MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	TACTT	2	10	27806	27815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011738	AACTT	2	10	29433	29442	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011738	TTAGT	2	10	29745	29754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011738	CGGAT	2	10	31628	31637	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011738	AGTTT	2	10	32384	32393	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011738	GTATG	2	10	32794	32803	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011738	AATAG	2	10	36214	36223	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011738	GAGTA	2	10	41214	41223	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011738	CGAAA	2	10	41250	41259	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011738	CCATC	2	10	44693	44702	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_011738	TGATT	2	10	51890	51899	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011738	TTAAA	2	10	51974	51983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011738	TTAAA	2	10	53827	53836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011738	TAATT	2	10	53853	53862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011738	AAAAT	2	10	54546	54555	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011738	ATCTT	2	10	57044	57053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011738	GTAAA	2	10	57142	57151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011738	CTTTC	2	10	68502	68511	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011738	ATTTT	2	10	69656	69665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011738	CTAAT	2	10	86498	86507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011738	CTAAA	2	10	86643	86652	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011738	AAGTA	2	10	92390	92399	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011738	GACTT	2	10	93684	93693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011738	GAAAG	2	10	99156	99165	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011738	TTGAG	2	10	103754	103763	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011738	GATGA	2	10	105536	105545	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011738	ACCCA	2	10	110980	110989	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_011738	TTTAA	2	10	114868	114877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011738	AATTA	2	10	129603	129612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011738	TCACA	2	10	173610	173619	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011738	GAAAG	2	10	185892	185901	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011738	GACTA	2	10	186499	186508	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011738	ACTAA	2	10	186951	186960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011738	AAGTT	2	10	187263	187272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011738	ATTAC	2	10	188034	188043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011738	TTTTC	2	10	188132	188141	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011738	CTTTC	2	10	188481	188490	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011738	AAGTG	2	10	188825	188834	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011738	CCCTA	2	10	209120	209129	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_011738	GTAAT	2	10	226679	226688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011738	ACTAA	2	10	227101	227110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011738	TGCCC	2	10	228963	228972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_011738	AAGTT	2	10	228979	228988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011738	ATTAC	2	10	229750	229759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011738	ATTAC	2	10	229877	229886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011738	TTTAA	2	10	237546	237555	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011738	TTATC	2	10	237687	237696	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011738	ATTTT	2	10	240162	240171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011738	TTAAA	2	10	240824	240833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011738	GGAGT	2	10	240841	240850	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011738	AATTA	2	10	245739	245748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011738	ACTAA	2	10	248026	248035	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011738	AAGAA	2	10	264480	264489	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011738	GAAAA	2	10	267241	267250	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011738	GTAAT	2	10	267721	267730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011738	GTAAT	2	10	268177	268186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011738	GTAAT	2	10	268304	268313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011738	AACTT	2	10	269075	269084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011738	TTAGT	2	10	269387	269396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011738	TAGTC	2	10	269747	269756	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011738	CTTTC	2	10	270354	270363	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011738	TTAAT	2	10	271120	271129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011738	TAGGC	2	10	271132	271141	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011738	TAAAA	2	10	272128	272137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011738	TATGC	2	10	274191	274200	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011738	GTAAT	2	10	276020	276029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011738	GTAAT	2	10	276476	276485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011738	GTAAT	2	10	276603	276612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011738	AACTT	2	10	277374	277383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011738	TTAGT	2	10	277686	277695	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011738	TTTTA	2	10	281376	281385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011738	GAATT	2	10	282468	282477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011738	ATTGA	2	10	284228	284237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011738	AAAAG	2	10	285036	285045	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011738	TATAA	2	10	286132	286141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011738	CCTAA	2	10	301348	301357	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_011738	AACTT	2	10	314663	314672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011738	TTAGT	2	10	314975	314984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011738	TATTT	2	10	320716	320725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011738	TAACC	2	10	322181	322190	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011738	AATAA	2	10	322980	322989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011738	AATCC	2	10	323214	323223	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.