MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 1727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	TCA	2	6	82	87	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011738	CTAT	2	8	226	233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011738	AG	3	6	238	243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011738	CTT	2	6	252	257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011738	AGTT	2	8	280	287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011738	CT	3	6	301	306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011738	T	6	6	334	339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011738	ATTG	2	8	340	347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011738	A	6	6	811	816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011738	TTC	2	6	831	836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011738	TG	3	6	854	859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011738	CAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011738	T	6	6	886	891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011738	TC	3	6	955	960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011738	CT	3	6	1045	1050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011738	AAG	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011738	TCC	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011738	GAG	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011738	A	6	6	1302	1307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011738	AAT	2	6	1634	1639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011738	CAAA	2	8	1667	1674	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011738	TAAT	2	8	5274	5281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011738	TGT	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011738	T	6	6	5299	5304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011738	GTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011738	AGG	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011738	TTAC	2	8	5465	5472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011738	CCT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011738	TTA	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011738	GAA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011738	AATT	2	8	5740	5747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011738	T	7	7	5780	5786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011738	ATT	2	6	5815	5820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011738	ATT	2	6	5838	5843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011738	ACG	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011738	GCT	2	6	6029	6034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011738	CGC	2	6	6068	6073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011738	AGCG	2	8	6081	6088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011738	AAT	2	6	7349	7354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011738	ATA	2	6	7370	7375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011738	A	7	7	7406	7412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011738	AATT	2	8	7445	7452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011738	TTC	2	6	7458	7463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011738	TAA	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011738	AAG	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011738	TTA	2	6	8173	8178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011738	AGTA	2	8	8192	8199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011738	ATC	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011738	ATTA	2	8	8348	8355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011738	A	6	6	8355	8360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011738	AG	3	6	8395	8400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011738	TAA	2	6	11851	11856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011738	CT	3	6	11882	11887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011738	TG	3	6	11900	11905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011738	GCT	2	6	11918	11923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011738	CA	3	6	11927	11932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011738	TGT	2	6	12012	12017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011738	AGG	2	6	12056	12061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011738	AGG	2	6	12063	12068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011738	AGG	2	6	12070	12075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011738	TTC	2	6	12081	12086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011738	CGG	2	6	12172	12177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011738	CCT	2	6	12218	12223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011738	CCT	2	6	12225	12230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011738	CCT	2	6	12246	12251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011738	ATTA	2	8	12523	12530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011738	TAC	2	6	12544	12549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011738	A	6	6	12553	12558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011738	CAA	2	6	12829	12834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011738	TTG	2	6	12840	12845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011738	A	6	6	13863	13868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011738	AATT	2	8	13925	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011738	A	9	9	13961	13969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011738	ATT	2	6	14017	14022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011738	CTC	2	6	14081	14086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011738	TTA	2	6	14152	14157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011738	AAT	2	6	15685	15690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011738	CTT	2	6	15732	15737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011738	A	6	6	15746	15751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011738	TAA	2	6	15799	15804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011738	A	6	6	15811	15816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011738	AAT	2	6	15838	15843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011738	AAG	2	6	15874	15879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011738	ATGA	2	8	15889	15896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011738	A	6	6	16696	16701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011738	ATA	2	6	16719	16724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011738	AT	3	6	16739	16744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011738	GAA	2	6	16755	16760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011738	ATT	2	6	21256	21261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011738	GGAA	2	8	21270	21277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011738	TAAT	2	8	21310	21317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011738	ATC	2	6	21326	21331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011738	T	8	8	21343	21350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011738	ATT	2	6	21393	21398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011738	T	6	6	21397	21402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011738	A	7	7	27618	27624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011738	A	6	6	27629	27634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011738	A	6	6	27713	27718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011738	CTTT	2	8	27760	27767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011738	A	6	6	27789	27794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011738	TACTT	2	10	27806	27815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011738	A	6	6	27839	27844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011738	CTCC	2	8	27847	27854	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_011738	T	7	7	28119	28125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011738	AAG	2	6	28750	28755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011738	AT	3	6	28785	28790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011738	ATA	2	6	28848	28853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011738	A	6	6	28939	28944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011738	CAA	2	6	29020	29025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011738	ATAA	2	8	29032	29039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011738	T	7	7	29208	29214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011738	CTT	2	6	29220	29225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011738	TGC	2	6	29247	29252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011738	TTG	2	6	29350	29355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011738	TTC	2	6	29398	29403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011738	TCA	2	6	29412	29417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011738	G	6	6	29421	29426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011738	AACTT	2	10	29433	29442	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011738	CCT	2	6	29480	29485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011738	TTGA	2	8	29517	29524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011738	CTTC	2	8	29594	29601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011738	TCTT	2	8	29625	29632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011738	CGC	2	6	29646	29651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011738	TGC	2	6	29665	29670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011738	TTC	2	6	29673	29678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011738	CTT	2	6	29739	29744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011738	TTAGT	2	10	29745	29754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011738	AG	3	6	29849	29854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011738	AACT	2	8	29940	29947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011738	AACTAG	2	12	30162	30173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_011738	GAG	2	6	30179	30184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011738	TTA	2	6	30209	30214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011738	TGG	2	6	30219	30224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011738	TTG	2	6	30258	30263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011738	ATCT	2	8	30267	30274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011738	AGC	2	6	30310	30315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011738	TTA	2	6	30366	30371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011738	AGG	2	6	30450	30455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011738	A	6	6	30531	30536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011738	AGG	2	6	30669	30674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011738	AT	3	6	30715	30720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011738	GATA	2	8	30931	30938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011738	ATT	2	6	30947	30952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011738	A	6	6	30981	30986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011738	TTC	2	6	31020	31025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011738	GAAT	2	8	31048	31055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011738	TAG	2	6	31230	31235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011738	GCA	2	6	31255	31260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011738	TCA	2	6	31285	31290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011738	ATT	2	6	31300	31305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011738	CAAT	2	8	31323	31330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011738	AAG	2	6	31410	31415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011738	TAT	2	6	31465	31470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011738	ACC	2	6	31488	31493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_011738	CT	3	6	31617	31622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_011738	CGGAT	2	10	31628	31637	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_011738	TAA	2	6	31686	31691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_011738	CCA	2	6	32606	32611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_011738	TAC	2	6	32613	32618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_011738	ACC	2	6	32772	32777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_011738	GCC	2	6	33011	33016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_011738	TAA	2	6	41297	41302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_011738	T	6	6	41327	41332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011738	GTA	2	6	41397	41402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011738	TTCC	2	8	41455	41462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
284	NC_011738	T	8	8	41492	41499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011738	AGT	2	6	41500	41505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011738	AGC	2	6	41508	41513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_011738	CTT	2	6	41609	41614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_011738	TGA	2	6	41627	41632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011738	AC	3	6	41637	41642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
290	NC_011738	TAA	3	9	41661	41669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011738	TTA	2	6	41675	41680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011738	CT	3	6	41838	41843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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