MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 1727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011738	AAC	2	6	213154	213159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011738	AT	3	6	218536	218541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011738	T	7	7	218548	218554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011738	AGATAG	2	12	219737	219748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011738	ATT	2	6	219781	219786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011738	A	6	6	219788	219793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011738	TA	3	6	220491	220496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011738	GAA	2	6	221279	221284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011738	ATA	2	6	221302	221307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011738	AGC	2	6	221320	221325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011738	T	7	7	222229	222235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011738	T	7	7	222237	222243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011738	AT	3	6	222285	222290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011738	T	9	9	222346	222354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011738	AAT	2	6	222365	222370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011738	TTC	2	6	223257	223262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_011738	TTA	2	6	223268	223273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011738	ATAA	2	8	223337	223344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011738	ATT	2	6	223407	223412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011738	AGT	2	6	223465	223470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011738	A	7	7	223476	223482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011738	AAAT	2	8	223502	223509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011738	GAAA	2	8	223559	223566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011738	A	6	6	223564	223569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011738	GAAA	2	8	223573	223580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011738	T	6	6	224336	224341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011738	AAT	2	6	224415	224420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011738	TTA	2	6	224442	224447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011738	A	7	7	224447	224453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011738	A	9	9	224529	224537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011738	A	8	8	225298	225305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011738	TAGT	2	8	225319	225326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011738	TGGT	2	8	225380	225387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011738	GAT	2	6	225388	225393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011738	TTC	2	6	225407	225412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011738	A	7	7	225413	225419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011738	TAT	2	6	225472	225477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011738	TAA	2	6	226666	226671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011738	GTAAT	2	10	226679	226688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011738	AAG	2	6	226767	226772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011738	AT	3	6	226802	226807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011738	ATA	2	6	226865	226870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011738	A	6	6	226956	226961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011738	CAA	2	6	227037	227042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011738	ATAA	2	8	227049	227056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011738	ACTAA	2	10	227101	227110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_011738	AAG	2	6	227111	227116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011738	GAA	2	6	227177	227182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011738	GCA	2	6	227185	227190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011738	GCG	2	6	227204	227209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011738	AAAG	2	8	227222	227229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011738	AAG	2	6	227252	227257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011738	ATCA	2	8	227330	227337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_011738	AGG	2	6	227370	227375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011738	TTA	2	6	227434	227439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011738	GAA	2	6	227486	227491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011738	AATT	2	8	227497	227504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011738	T	7	7	227537	227543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011738	ATT	2	6	227572	227577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011738	ATT	2	6	227595	227600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011738	GC	3	6	228858	228863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011738	GGC	2	6	228875	228880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011738	AGC	2	6	228915	228920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011738	CGT	2	6	228938	228943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011738	TGCCC	2	10	228963	228972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1066	NC_011738	AAGTT	2	10	228979	228988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011738	C	6	6	228995	229000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1069	NC_011738	GAA	2	6	229018	229023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011738	CAA	2	6	229066	229071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_011738	AGC	2	6	229168	229173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011738	AAG	2	6	229196	229201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011738	A	7	7	229207	229213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011738	TTTA	2	8	229381	229388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011738	TTG	2	6	229396	229401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011738	T	6	6	229477	229482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_011738	AT	3	6	229631	229636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_011738	ATT	2	6	229766	229771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011738	ATTAC	2	10	229877	229886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_011738	ATT	2	6	229893	229898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011738	CAT	2	6	230005	230010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_011738	TGA	2	6	230303	230308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_011738	TCT	2	6	233477	233482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_011738	GCA	2	6	235604	235609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_011738	AGA	2	6	236529	236534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011738	T	8	8	236600	236607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011738	CTT	2	6	236625	236630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011738	TTTAA	2	10	237546	237555	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011738	AAT	2	6	237560	237565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011738	TTA	2	6	237571	237576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011738	A	7	7	237640	237646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011738	TTATC	2	10	237687	237696	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_011738	AAG	2	6	237706	237711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011738	G	6	6	237734	237739	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011738	TGAG	2	8	237755	237762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011738	TC	3	6	237778	237783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_011738	TCA	2	6	237885	237890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_011738	T	7	7	237891	237897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011738	CTT	2	6	237899	237904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011738	ACTA	2	8	238550	238557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_011738	GAG	2	6	238734	238739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011738	TTG	2	6	238775	238780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011738	TATTAA	2	12	238852	238863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011738	AGTC	2	8	239095	239102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_011738	TAA	2	6	239145	239150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011738	T	7	7	239202	239208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011738	GAA	2	6	239209	239214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011738	ATC	2	6	239228	239233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011738	ACCA	2	8	239234	239241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_011738	ACTA	2	8	239295	239302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_011738	T	8	8	239316	239323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011738	T	9	9	240084	240092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011738	ATTTT	2	10	240162	240171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011738	T	7	7	240168	240174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011738	ATT	2	6	240201	240206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011738	ATGA	2	8	240513	240520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011738	CGG	2	6	240544	240549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011738	T	7	7	240561	240567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011738	A	6	6	240573	240578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011738	T	6	6	240609	240614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011738	A	6	6	240630	240635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011738	TCTA	2	8	240648	240655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_011738	GTAA	2	8	240711	240718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011738	CAT	2	6	240784	240789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011738	CT	4	8	240811	240818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_011738	TTAAA	2	10	240824	240833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011738	GGAGT	2	10	240841	240850	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011738	ATCA	2	8	240870	240877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_011738	T	6	6	240910	240915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011738	GA	3	6	241045	241050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011738	AT	3	6	241079	241084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_011738	TAAA	2	8	241227	241234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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