MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	TTGT	2	8	5024	5031	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011737	AACA	2	8	5104	5111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011737	AATT	2	8	9899	9906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011737	TTAA	2	8	11200	11207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011737	GTTT	2	8	11813	11820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011737	TTGT	2	8	12384	12391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011737	CTTT	2	8	12454	12461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011737	GAAT	2	8	14838	14845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011737	ATTT	2	8	18461	18468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011737	TAAT	2	8	18638	18645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011737	TATT	2	8	18673	18680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011737	AAAG	2	8	18943	18950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011737	TTAT	2	8	19048	19055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011737	AATT	2	8	19125	19132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011737	TCAA	2	8	19566	19573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011737	ATTT	2	8	19659	19666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011737	TGAA	2	8	19998	20005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011737	AATG	2	8	20149	20156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011737	ATTA	2	8	20172	20179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011737	TACT	2	8	20342	20349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011737	TAAT	2	8	20661	20668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011737	TCAA	2	8	21498	21505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011737	TAGT	2	8	21590	21597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011737	ATTT	2	8	22096	22103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011737	TTAT	2	8	22159	22166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011737	AGGT	2	8	22500	22507	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011737	AGTA	2	8	22595	22602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011737	TAGA	2	8	22801	22808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011737	TAGT	2	8	22844	22851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011737	ATAG	2	8	23574	23581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011737	TAAT	2	8	26018	26025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011737	TCAT	2	8	26050	26057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011737	TTCA	2	8	26202	26209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011737	AAAT	2	8	26540	26547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011737	TTGA	2	8	26633	26640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011737	AATT	2	8	27074	27081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011737	ATAA	2	8	27151	27158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011737	TCTT	2	8	27255	27262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011737	TAAA	2	8	27524	27531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011737	ATTA	2	8	27561	27568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011737	TAAA	2	8	27737	27744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011737	GTTA	2	8	28113	28120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011737	TACT	2	8	28334	28341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011737	TTTA	2	8	28589	28596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011737	GTTT	2	8	28722	28729	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011737	GGAA	2	8	28888	28895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011737	TAAT	2	8	29116	29123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011737	ATTA	2	8	29129	29136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011737	AACA	2	8	34146	34153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011737	AAGC	2	8	34301	34308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011737	TAAA	2	8	35867	35874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011737	GTTT	2	8	35981	35988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011737	CTTG	2	8	40727	40734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011737	ATTA	2	8	41007	41014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011737	AATT	2	8	44131	44138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011737	TTTA	2	8	46514	46521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011737	ACTA	2	8	47759	47766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011737	CAAA	2	8	49185	49192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011737	ATGA	2	8	49237	49244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011737	AATT	2	8	54131	54138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011737	TTCC	2	8	56109	56116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011737	TTAA	2	8	59639	59646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011737	TTAA	2	8	59649	59656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011737	AGAA	2	8	60995	61002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011737	TTAG	2	8	61131	61138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011737	CTAA	2	8	61152	61159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011737	TAAT	2	8	61180	61187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011737	AATT	2	8	61349	61356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011737	ACCC	2	8	61610	61617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_011737	ATAA	2	8	61618	61625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011737	AATT	2	8	61925	61932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011737	GGTT	2	8	62650	62657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011737	ATTT	2	8	63848	63855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011737	TAAT	2	8	64025	64032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011737	TATT	2	8	64060	64067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011737	AAAG	2	8	64330	64337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011737	TTAT	2	8	64435	64442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011737	AATT	2	8	64512	64519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011737	TCAA	2	8	64953	64960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011737	ATTT	2	8	65046	65053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011737	TGAA	2	8	65384	65391	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011737	AATG	2	8	65535	65542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011737	ATTA	2	8	65558	65565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011737	ACTT	2	8	67937	67944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011737	AATC	2	8	68078	68085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011737	AATC	2	8	68168	68175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011737	CATT	2	8	69129	69136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011737	ATTA	2	8	80616	80623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011737	AAGT	2	8	80630	80637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011737	TCAA	2	8	84761	84768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011737	TCAA	2	8	84863	84870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011737	TAAT	2	8	84909	84916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011737	ACTT	2	8	85324	85331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011737	AAAT	2	8	86494	86501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011737	ATTA	2	8	86610	86617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011737	ATTA	2	8	87464	87471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011737	CATT	2	8	91614	91621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011737	AATA	2	8	91709	91716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011737	TCTA	2	8	93381	93388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011737	CTTC	2	8	93581	93588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011737	TAAA	2	8	96810	96817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011737	ATAC	2	8	96884	96891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011737	AAAG	2	8	96972	96979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011737	AAAG	2	8	97296	97303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011737	AAAT	2	8	97530	97537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011737	AATG	2	8	97956	97963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011737	CTAG	2	8	101785	101792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011737	ATTA	2	8	104167	104174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011737	GAAA	2	8	104391	104398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011737	ATTA	3	12	104418	104429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011737	TAAG	2	8	109439	109446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011737	AATT	2	8	113727	113734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011737	GATA	2	8	115858	115865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011737	CTCC	2	8	116747	116754	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_011737	TCCC	2	8	117183	117190	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_011737	ATTG	2	8	117589	117596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011737	TTTG	2	8	118526	118533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011737	GCTT	2	8	118927	118934	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011737	TTAA	2	8	119026	119033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011737	CTAC	2	8	119900	119907	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011737	TTAT	2	8	120784	120791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011737	AAAT	2	8	120981	120988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011737	AAAC	2	8	121245	121252	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011737	TTAA	2	8	122914	122921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011737	ATTT	2	8	123182	123189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011737	ATTA	2	8	127096	127103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011737	AATT	2	8	127356	127363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011737	TTAA	2	8	127435	127442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011737	TCCC	2	8	127622	127629	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_011737	TTTA	2	8	127743	127750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011737	AATT	2	8	127796	127803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011737	AAAC	2	8	131562	131569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011737	GAAT	2	8	136006	136013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011737	GATT	2	8	136029	136036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011737	TTTC	2	8	136720	136727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011737	TAAA	2	8	141644	141651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011737	ATGT	2	8	143484	143491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011737	TTTA	2	8	144043	144050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011737	CGGA	2	8	144064	144071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011737	AACC	2	8	146711	146718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011737	TCCA	2	8	147216	147223	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011737	TCAA	2	8	149240	149247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011737	TATT	2	8	151680	151687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011737	GGGA	2	8	153674	153681	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011737	AATA	2	8	154492	154499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011737	TTAT	2	8	162576	162583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011737	CAGG	2	8	164628	164635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011737	TCAT	2	8	164793	164800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011737	TCTA	2	8	167991	167998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011737	TTGT	2	8	169033	169040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011737	AACT	2	8	169504	169511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011737	TAAT	2	8	181948	181955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011737	AGCG	2	8	182927	182934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_011737	AATT	2	8	184291	184298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011737	TTGT	2	8	185106	185113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.