MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 1178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011737	GAG	2	6	28	33	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011737	TTA	2	6	64	69	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011737	TCC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011737	CTG	2	6	118	123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011737	CCT	2	6	132	137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011737	TGT	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011737	TTA	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011737	AGA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011737	TTGT	2	8	5024	5031	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011737	AACA	2	8	5104	5111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011737	CAT	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011737	TCT	2	6	5163	5168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011737	ATT	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011737	CGA	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011737	ATA	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011737	ACT	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011737	T	7	7	5288	5294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011737	TA	3	6	5428	5433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011737	TA	3	6	5450	5455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011737	ATA	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011737	TAT	2	6	8707	8712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011737	AT	3	6	9398	9403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011737	TA	3	6	9427	9432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011737	ACG	2	6	9510	9515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011737	AAG	2	6	9527	9532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011737	GGC	2	6	9576	9581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011737	TAA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011737	TCA	2	6	9672	9677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011737	TAA	2	6	9850	9855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011737	CAT	2	6	9879	9884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011737	AATT	2	8	9899	9906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011737	T	6	6	10548	10553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011737	TAA	2	6	10558	10563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011737	TA	3	6	10576	10581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011737	GTT	2	6	10668	10673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011737	TTAA	2	8	11200	11207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011737	T	8	8	11233	11240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011737	GAA	2	6	11262	11267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011737	AG	3	6	11271	11276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011737	TA	3	6	11783	11788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011737	GTTT	2	8	11813	11820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011737	TGA	2	6	12048	12053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011737	ATG	2	6	12055	12060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011737	TCA	2	6	12071	12076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011737	GTA	2	6	12120	12125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011737	TCG	2	6	12186	12191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011737	A	6	6	12261	12266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011737	TGA	2	6	12269	12274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011737	TTG	2	6	12354	12359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011737	TTGT	2	8	12384	12391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011737	GGA	2	6	12394	12399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011737	T	6	6	12408	12413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011737	CTTT	2	8	12454	12461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011737	ATT	2	6	12483	12488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011737	TC	3	6	12508	12513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011737	CAT	2	6	12575	12580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011737	GTA	2	6	12662	12667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011737	ACT	2	6	13503	13508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011737	T	6	6	13520	13525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011737	TAA	2	6	13565	13570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011737	AGGGTT	2	12	13950	13961	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011737	GAA	2	6	14045	14050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011737	TAA	2	6	14698	14703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011737	T	6	6	14719	14724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011737	ATA	2	6	14752	14757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011737	TTAATT	2	12	14761	14772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011737	CAA	2	6	14789	14794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011737	GAAT	2	8	14838	14845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011737	TA	3	6	14861	14866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011737	TA	3	6	14871	14876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011737	TTA	2	6	14906	14911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011737	ATT	2	6	14923	14928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011737	ATTT	2	8	18461	18468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011737	A	6	6	18475	18480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011737	TAG	2	6	18530	18535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011737	TGA	2	6	18546	18551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011737	A	6	6	18602	18607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011737	TAAT	2	8	18638	18645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011737	TATT	2	8	18673	18680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011737	T	6	6	18688	18693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011737	TTA	2	6	18715	18720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011737	ATG	2	6	18749	18754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011737	TA	3	6	18782	18787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011737	AAT	2	6	18799	18804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011737	A	6	6	18834	18839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011737	CAT	2	6	18878	18883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011737	A	6	6	18916	18921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011737	GAAAAA	2	12	18922	18933	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011737	A	9	9	18929	18937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011737	AAAG	2	8	18943	18950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011737	AAT	3	9	18954	18962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011737	ACC	2	6	18983	18988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011737	TAA	2	6	19019	19024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011737	A	6	6	19026	19031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011737	TTAT	2	8	19048	19055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011737	AATT	2	8	19125	19132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011737	AAT	2	6	19140	19145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011737	GT	3	6	19147	19152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011737	TA	3	6	19163	19168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011737	A	6	6	19231	19236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011737	AGA	2	6	19266	19271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011737	A	6	6	19274	19279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011737	A	8	8	19283	19290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011737	AGA	2	6	19320	19325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011737	TAG	3	9	19361	19369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011737	A	6	6	19376	19381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011737	A	6	6	19420	19425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011737	GAA	2	6	19426	19431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011737	A	7	7	19461	19467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011737	GAA	2	6	19468	19473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011737	A	6	6	19519	19524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011737	TCAA	2	8	19566	19573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011737	A	6	6	19580	19585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011737	AGA	2	6	19623	19628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011737	GAG	2	6	19635	19640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011737	AG	3	6	19645	19650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011737	ATTT	2	8	19659	19666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011737	AAAAT	2	10	19688	19697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011737	ATT	2	6	19774	19779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011737	T	6	6	19778	19783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011737	T	7	7	19792	19798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011737	AG	3	6	19874	19879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011737	AAT	2	6	19886	19891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011737	AG	3	6	19896	19901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011737	AAT	2	6	19940	19945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011737	TGAA	2	8	19998	20005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011737	GAA	2	6	20030	20035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011737	ATT	2	6	20079	20084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011737	AG	3	6	20096	20101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011737	AATG	2	8	20149	20156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011737	T	6	6	20166	20171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011737	ATTA	2	8	20172	20179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011737	TTA	3	9	20177	20185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011737	T	6	6	20196	20201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011737	TAAAAT	2	12	20239	20250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011737	T	6	6	20269	20274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011737	TACT	2	8	20342	20349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011737	C	7	7	20395	20401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_011737	A	6	6	20446	20451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011737	C	7	7	20459	20465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_011737	ATT	3	9	20614	20622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011737	CT	3	6	20624	20629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011737	TAAT	2	8	20661	20668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011737	TCG	2	6	20674	20679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011737	T	6	6	20786	20791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011737	TCAA	2	8	21498	21505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011737	GAA	2	6	21542	21547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011737	TAGT	2	8	21590	21597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011737	AGA	2	6	21631	21636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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