MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 1178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011737	AAC	2	6	160307	160312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011737	ATA	2	6	161697	161702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011737	GTA	2	6	161727	161732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011737	TCA	2	6	162351	162356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011737	TTAAAG	2	12	162432	162443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011737	A	7	7	162502	162508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011737	TCA	2	6	162514	162519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011737	TTAT	2	8	162576	162583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011737	AT	3	6	162646	162651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011737	TAA	2	6	162658	162663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011737	TCCCAC	2	12	164516	164527	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_011737	TAG	2	6	164534	164539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011737	CAGG	2	8	164628	164635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_011737	A	6	6	164639	164644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011737	CAA	2	6	164691	164696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011737	CTT	2	6	164720	164725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_011737	AGT	2	6	164745	164750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011737	ATT	2	6	164760	164765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011737	TCC	2	6	164771	164776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_011737	TCAT	2	8	164793	164800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_011737	AAG	2	6	164823	164828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011737	TGA	2	6	164848	164853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011737	AGT	2	6	164927	164932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011737	ATT	2	6	165000	165005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011737	TAA	2	6	166222	166227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011737	A	6	6	166499	166504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011737	ACC	2	6	167815	167820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_011737	AT	3	6	167831	167836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011737	ATT	2	6	167859	167864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011737	T	8	8	167863	167870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011737	TAT	2	6	167885	167890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011737	TTC	2	6	167901	167906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011737	ATT	2	6	167946	167951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011737	AAT	3	9	167972	167980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011737	TCTA	2	8	167991	167998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_011737	T	6	6	167999	168004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011737	A	6	6	168174	168179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011737	A	7	7	168186	168192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011737	AGT	2	6	168308	168313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011737	ATT	2	6	168480	168485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011737	AGT	2	6	168590	168595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011737	C	6	6	168677	168682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1043	NC_011737	AGT	2	6	168764	168769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011737	TG	3	6	168840	168845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011737	AGT	2	6	168874	168879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011737	AAT	2	6	168896	168901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011737	TTGT	2	8	169033	169040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011737	TTA	2	6	169053	169058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011737	CAA	2	6	169122	169127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011737	AGT	2	6	169162	169167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011737	AG	3	6	169172	169177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011737	TGA	2	6	169295	169300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011737	T	6	6	169337	169342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011737	G	6	6	169343	169348	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011737	CAA	2	6	169421	169426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011737	TCC	2	6	169496	169501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_011737	AACT	2	8	169504	169511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_011737	TCA	2	6	169596	169601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011737	CGA	2	6	169614	169619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_011737	TTC	2	6	169726	169731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011737	A	6	6	169794	169799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011737	ATTTA	2	10	169852	169861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011737	T	6	6	169895	169900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011737	TAA	2	6	169926	169931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011737	A	6	6	169947	169952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011737	TTG	2	6	171140	171145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011737	TTA	2	6	171153	171158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011737	ATT	2	6	171179	171184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011737	AAC	2	6	171188	171193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011737	AG	3	6	172502	172507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011737	AT	3	6	172551	172556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011737	TAG	2	6	174653	174658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011737	T	6	6	175447	175452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011737	ATA	2	6	175503	175508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011737	A	6	6	175548	175553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011737	TAAT	2	8	181948	181955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011737	A	6	6	181971	181976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011737	T	6	6	181977	181982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011737	TAA	2	6	182566	182571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_011737	CAC	2	6	182638	182643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_011737	CCA	2	6	182697	182702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_011737	GT	3	6	182726	182731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011737	GCC	2	6	182783	182788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1088	NC_011737	AGCG	2	8	182927	182934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_011737	AAT	2	6	184195	184200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011737	ATA	2	6	184216	184221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011737	A	7	7	184252	184258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011737	AATT	2	8	184291	184298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011737	TTC	2	6	184304	184309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011737	TAA	2	6	184356	184361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011737	T	6	6	184410	184415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011737	TAG	2	6	184548	184553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_011737	GGC	2	6	184612	184617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_011737	AAC	2	6	184661	184666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011737	AT	3	6	184674	184679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011737	AAT	2	6	184717	184722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011737	AGA	2	6	184792	184797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011737	ACA	2	6	184836	184841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_011737	TTGT	2	8	185106	185113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011737	CCTT	2	8	185164	185171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_011737	ATC	2	6	185200	185205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_011737	T	7	7	185210	185216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011737	TGC	2	6	185277	185282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011737	ATCA	2	8	185392	185399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_011737	AT	3	6	185508	185513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011737	TAA	2	6	185514	185519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011737	CAT	2	6	185560	185565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011737	A	6	6	187897	187902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011737	GTT	2	6	188670	188675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011737	AG	3	6	188680	188685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011737	CT	3	6	188720	188725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_011737	GA	3	6	188809	188814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011737	T	6	6	189085	189090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011737	TCA	2	6	189146	189151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011737	AAT	2	6	189391	189396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011737	GT	3	6	189569	189574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011737	GTT	2	6	189580	189585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011737	AAAT	2	8	189589	189596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011737	CTT	2	6	189600	189605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011737	TCG	2	6	189644	189649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011737	AAG	2	6	189669	189674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011737	AATA	2	8	189714	189721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011737	TAT	2	6	189764	189769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011737	TTG	2	6	189774	189779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011737	A	6	6	189797	189802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011737	CTT	2	6	189821	189826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011737	ATT	2	6	189831	189836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011737	T	8	8	189839	189846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011737	ATTG	2	8	190203	190210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011737	TAA	2	6	190212	190217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_011737	CTAT	2	8	191329	191336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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