MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742404

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011732	AAT	2	6	66	71	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011732	TTG	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011732	ATT	3	9	187	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011732	GAT	2	6	231	236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011732	CGT	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011732	TTC	2	6	4312	4317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011732	TCC	3	9	4337	4345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011732	ATA	2	6	4428	4433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011732	TAT	2	6	4455	4460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011732	TCG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011732	TGT	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011732	GAA	2	6	4794	4799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011732	GCA	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011732	CTT	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011732	AGT	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011732	CTT	2	6	5053	5058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011732	TCT	2	6	5090	5095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011732	CTT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011732	AAG	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011732	CTT	2	6	5233	5238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011732	CTT	2	6	5243	5248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011732	AGT	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011732	TTA	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011732	GAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011732	TAC	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011732	AAT	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011732	GAT	2	6	5972	5977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011732	GAG	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011732	ATG	2	6	6013	6018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011732	ACT	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011732	GTT	3	9	6099	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011732	TAA	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011732	TAC	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011732	ATA	2	6	6792	6797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011732	TAT	2	6	7100	7105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011732	TTG	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011732	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011732	CCA	2	6	7214	7219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011732	ACA	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011732	GTA	2	6	10635	10640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011732	GTC	2	6	10707	10712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011732	CAA	2	6	10716	10721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011732	GGA	2	6	11831	11836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011732	CCG	2	6	12897	12902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011732	CAG	2	6	12941	12946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011732	TAA	2	6	13131	13136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011732	GCC	2	6	13153	13158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011732	CTT	2	6	13201	13206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011732	GGA	2	6	13210	13215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011732	ATT	2	6	13260	13265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011732	ATC	2	6	13266	13271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011732	CTT	2	6	13273	13278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011732	ACG	2	6	14886	14891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011732	GTG	2	6	15071	15076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011732	AGT	3	9	15151	15159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011732	TCA	2	6	16017	16022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011732	AGT	2	6	16057	16062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011732	AAT	2	6	16186	16191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011732	GCA	2	6	16210	16215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011732	TAC	2	6	16346	16351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011732	CTG	2	6	17166	17171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011732	ATT	2	6	17470	17475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011732	ATA	2	6	17669	17674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011732	TTC	2	6	17725	17730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011732	TAT	2	6	17800	17805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011732	TTA	2	6	17874	17879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011732	TTG	2	6	19124	19129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011732	ATT	2	6	19196	19201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011732	ACA	2	6	19265	19270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011732	GCT	2	6	19278	19283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011732	ATG	2	6	20319	20324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011732	ATT	2	6	22547	22552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011732	CTT	2	6	22581	22586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.