MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742403

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011730	TTC	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011730	CGG	2	6	143	148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011730	ATT	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011730	AGT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011730	TTC	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011730	AAG	2	6	774	779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011730	TGT	2	6	849	854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011730	AGA	2	6	2127	2132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011730	AAG	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011730	TCT	2	6	2230	2235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011730	CGT	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011730	AAC	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011730	ACA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011730	ACT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011730	TCT	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011730	CAG	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011730	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011730	ACA	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011730	ACA	2	6	3590	3595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011730	AAG	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011730	CGG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011730	CTC	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011730	GAT	2	6	8815	8820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011730	TGA	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011730	AAT	2	6	8901	8906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011730	TGC	2	6	8910	8915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011730	CTC	2	6	11822	11827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011730	TTA	2	6	13953	13958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011730	TAT	2	6	14029	14034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011730	GTT	2	6	14069	14074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011730	GTT	2	6	14168	14173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011730	GTT	2	6	14225	14230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011730	CAG	2	6	14541	14546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011730	TTG	2	6	15302	15307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011730	ATT	2	6	15373	15378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011730	TAA	2	6	15381	15386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011730	TTA	2	6	15394	15399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011730	AGC	2	6	17111	17116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011730	ATT	2	6	17559	17564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011730	CTT	2	6	17781	17786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011730	ATT	2	6	17838	17843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011730	TAG	2	6	18813	18818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011730	AAT	2	6	18857	18862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011730	AAT	2	6	20292	20297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011730	GGA	2	6	20483	20488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011730	TTA	2	6	20500	20505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011730	TTC	2	6	20625	20630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011730	AAG	2	6	21314	21319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011730	ATT	2	6	21539	21544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011730	ATC	2	6	21577	21582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011730	ACA	2	6	21586	21591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011730	TAG	2	6	21720	21725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011730	ACA	2	6	21819	21824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011730	GAT	2	6	22817	22822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011730	AGT	2	6	22827	22832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011730	ACT	2	6	22900	22905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011730	TGT	2	6	22936	22941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011730	TTC	2	6	23328	23333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011730	GCT	2	6	23336	23341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011730	ATT	2	6	23342	23347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011730	AAC	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011730	ATT	2	6	23455	23460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011730	CTT	2	6	23485	23490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.