MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 25026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011729	CCT	2	6	885673	885678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_011729	ATA	2	6	885693	885698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011729	CCAA	2	8	885705	885712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_011729	T	6	6	886352	886357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011729	TTG	2	6	886463	886468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011729	T	7	7	886474	886480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011729	ATT	2	6	886497	886502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011729	ATTT	2	8	886508	886515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011729	AGG	2	6	886553	886558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011729	C	6	6	886635	886640	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4011	NC_011729	G	6	6	886648	886653	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011729	G	6	6	886656	886661	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011729	TGA	2	6	886725	886730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011729	TTG	2	6	886789	886794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011729	A	7	7	886802	886808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011729	TGA	2	6	887961	887966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011729	CCA	2	6	888010	888015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_011729	CGA	2	6	888019	888024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_011729	TTTA	2	8	888041	888048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011729	AACA	2	8	888086	888093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_011729	AAT	2	6	888097	888102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011729	TCA	2	6	888144	888149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_011729	TAAT	2	8	888161	888168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011729	GAA	2	6	888172	888177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011729	ATTA	2	8	888220	888227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011729	TCATTT	2	12	888296	888307	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4027	NC_011729	AAT	2	6	890340	890345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011729	GGGT	2	8	890355	890362	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011729	ATT	2	6	890376	890381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011729	TTC	2	6	890409	890414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_011729	TGGT	2	8	890428	890435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011729	T	6	6	890451	890456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011729	GTA	2	6	891409	891414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011729	ATT	2	6	891457	891462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011729	TTTA	2	8	891476	891483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011729	TCTT	2	8	891507	891514	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_011729	CCT	2	6	891537	891542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_011729	TCC	2	6	891551	891556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_011729	A	9	9	891614	891622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011729	A	6	6	891625	891630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011729	GAATA	2	10	891654	891663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011729	TAAAAA	2	12	891672	891683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011729	TTAA	2	8	893392	893399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011729	T	6	6	893414	893419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011729	A	8	8	893467	893474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011729	T	6	6	893475	893480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011729	ATTA	2	8	893518	893525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011729	TTGA	2	8	894197	894204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011729	ATA	2	6	894660	894665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_011729	T	8	8	895633	895640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011729	GAA	2	6	895678	895683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_011729	A	6	6	895693	895698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011729	A	6	6	895716	895721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011729	A	6	6	895729	895734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011729	TTG	2	6	895743	895748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011729	CTGC	2	8	895772	895779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_011729	CCT	2	6	895796	895801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_011729	TCA	3	9	897987	897995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_011729	CT	3	6	898013	898018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_011729	CAA	2	6	898067	898072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_011729	A	7	7	898071	898077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011729	GAAA	2	8	898121	898128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011729	GTTA	2	8	898796	898803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011729	ATT	2	6	898863	898868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011729	ATTA	2	8	898881	898888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011729	TGA	2	6	898948	898953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4069	NC_011729	AATT	2	8	900099	900106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011729	AGT	2	6	900107	900112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_011729	TAT	2	6	901886	901891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4083	NC_011729	ATTA	2	8	903037	903044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_011729	TA	3	6	903051	903056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4102	NC_011729	TAAA	2	8	905398	905405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011729	T	6	6	905655	905660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011729	CCT	2	6	905661	905666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_011729	TGT	2	6	906745	906750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4107	NC_011729	TAT	2	6	906820	906825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_011729	CTT	2	6	906836	906841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4110	NC_011729	ATT	2	6	908542	908547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_011729	CAG	2	6	908717	908722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_011729	AATAA	2	10	908740	908749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011729	GT	3	6	909911	909916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_011729	TAGCG	2	10	909917	909926	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4118	NC_011729	GTC	2	6	910685	910690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_011729	TTAAT	2	10	910725	910734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011729	ACC	2	6	912059	912064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_011729	AATT	2	8	912067	912074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011729	AAAT	2	8	912118	912125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011729	TAAT	2	8	912295	912302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011729	GTT	2	6	912304	912309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011729	ATAA	2	8	912311	912318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011729	TAA	4	12	912335	912346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011729	A	6	6	912362	912367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_011729	AATA	2	8	912370	912377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_011729	TAG	2	6	912386	912391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_011729	A	7	7	912397	912403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011729	GTT	2	6	913369	913374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011729	TTTA	2	8	913379	913386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011729	AGA	2	6	913391	913396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_011729	T	7	7	913443	913449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_011729	AGTT	2	8	913458	913465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_011729	TTA	2	6	913471	913476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_011729	TGAT	2	8	913522	913529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_011729	A	6	6	913533	913538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4140	NC_011729	AAGGGG	2	12	918198	918209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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