MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 25026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011729	GATG	2	8	1144181	1144188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011729	AGT	2	6	1145291	1145296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_011729	TAA	2	6	1146424	1146429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011729	AAC	2	6	1146446	1146451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_011729	TAA	2	6	1146459	1146464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011729	TAA	2	6	1146473	1146478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011729	CAA	2	6	1147452	1147457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011729	TC	3	6	1147481	1147486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_011729	CTC	2	6	1147520	1147525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_011729	TGT	3	9	1147739	1147747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011729	T	6	6	1147787	1147792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011729	T	7	7	1147838	1147844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011729	CAT	2	6	1147845	1147850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_011729	ATT	2	6	1147861	1147866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_011729	TCA	2	6	1147923	1147928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011729	T	6	6	1147938	1147943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011729	AAT	2	6	1147945	1147950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011729	TTA	2	6	1147965	1147970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011729	ATAA	2	8	1147975	1147982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011729	CCAAAG	2	12	1148010	1148021	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_011729	AGG	2	6	1148025	1148030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_011729	CAA	2	6	1148075	1148080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_011729	TTA	2	6	1149082	1149087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011729	T	6	6	1149109	1149114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011729	ATTT	2	8	1149126	1149133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011729	TTA	2	6	1149143	1149148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011729	ATTA	2	8	1149184	1149191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011729	TAA	2	6	1149246	1149251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011729	ATTA	2	8	1150510	1150517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011729	TA	3	6	1150516	1150521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011729	T	6	6	1150550	1150555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011729	AAC	2	6	1151732	1151737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_011729	A	6	6	1151750	1151755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011729	T	6	6	1151778	1151783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011729	TAAT	2	8	1151801	1151808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011729	A	8	8	1152309	1152316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011729	TATTT	2	10	1152927	1152936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5039	NC_011729	GAGCA	2	10	1152974	1152983	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5040	NC_011729	A	7	7	1152998	1153004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011729	A	6	6	1153033	1153038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011729	AAT	2	6	1153043	1153048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_011729	AT	3	6	1153376	1153381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011729	A	6	6	1153404	1153409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011729	TTA	2	6	1155886	1155891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_011729	AAT	2	6	1156164	1156169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5053	NC_011729	CCT	2	6	1158232	1158237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_011729	ATT	2	6	1158244	1158249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011729	T	6	6	1158248	1158253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011729	TTATTT	2	12	1158255	1158266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011729	TAA	2	6	1158278	1158283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011729	A	6	6	1158327	1158332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_011729	ATCT	2	8	1158342	1158349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_011729	T	6	6	1158362	1158367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011729	AAT	2	6	1158369	1158374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011729	T	7	7	1158378	1158384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011729	TTAA	2	8	1158412	1158419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011729	TCA	2	6	1158487	1158492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5066	NC_011729	TA	4	8	1158587	1158594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011729	TTA	2	6	1158628	1158633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011729	CT	3	6	1158672	1158677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_011729	A	6	6	1158691	1158696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_011729	CAT	2	6	1158876	1158881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5080	NC_011729	T	6	6	1160766	1160771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_011729	AG	3	6	1161127	1161132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_011729	ATTAC	2	10	1161267	1161276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5095	NC_011729	TCA	2	6	1161282	1161287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5097	NC_011729	ATTTA	2	10	1162163	1162172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_011729	TTG	2	6	1162174	1162179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_011729	G	6	6	1164210	1164215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011729	AGG	2	6	1164232	1164237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011729	ATTA	2	8	1164263	1164270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_011729	AAG	2	6	1164285	1164290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_011729	T	7	7	1164291	1164297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_011729	TA	3	6	1164353	1164358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_011729	CAA	2	6	1164403	1164408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_011729	A	6	6	1164414	1164419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011729	A	6	6	1169516	1169521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011729	TATG	2	8	1169525	1169532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5115	NC_011729	TCC	2	6	1169963	1169968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_011729	A	7	7	1170015	1170021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011729	GTT	2	6	1170086	1170091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011729	T	9	9	1170213	1170221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011729	AAT	2	6	1170236	1170241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011729	A	8	8	1170245	1170252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011729	ATCA	2	8	1170279	1170286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_011729	AAAT	2	8	1170300	1170307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011729	AG	3	6	1170327	1170332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011729	TTA	2	6	1170386	1170391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011729	AAT	2	6	1170393	1170398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011729	T	8	8	1170411	1170418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011729	TAT	2	6	1170464	1170469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5131	NC_011729	GAG	2	6	1170572	1170577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_011729	TCGTCA	2	12	1170591	1170602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5270	NC_011729	ATA	2	6	1199534	1199539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_011729	TAAA	2	8	1199552	1199559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_011729	ATC	2	6	1199624	1199629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5282	NC_011729	A	7	7	1203494	1203500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_011729	ATTT	2	8	1206940	1206947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5285	NC_011729	A	8	8	1207001	1207008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5305	NC_011729	TAAA	2	8	1210048	1210055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5323	NC_011729	T	7	7	1215021	1215027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5363	NC_011729	TAA	2	6	1232456	1232461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5385	NC_011729	TTAA	2	8	1238699	1238706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5388	NC_011729	TTA	2	6	1238769	1238774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5396	NC_011729	CAACC	2	10	1242324	1242333	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5397	NC_011729	T	6	6	1242344	1242349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5401	NC_011729	CA	3	6	1242516	1242521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5404	NC_011729	A	7	7	1245645	1245651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_011729	A	7	7	1245682	1245688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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