MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 25026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011729	ATT	2	6	1016969	1016974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_011729	GGA	2	6	1018224	1018229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_011729	TGA	2	6	1018317	1018322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_011729	GTATA	2	10	1018332	1018341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_011729	A	8	8	1018387	1018394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_011729	TTA	2	6	1018421	1018426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_011729	TAAATT	2	12	1018487	1018498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_011729	A	6	6	1018519	1018524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_011729	TCT	2	6	1018525	1018530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_011729	CAA	2	6	1018568	1018573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_011729	AAC	2	6	1018619	1018624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_011729	ATATA	2	10	1018634	1018643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_011729	AG	3	6	1018699	1018704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_011729	TTC	2	6	1018776	1018781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_011729	ACAAT	2	10	1018843	1018852	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4516	NC_011729	AGG	2	6	1019121	1019126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_011729	A	6	6	1019149	1019154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_011729	A	6	6	1019452	1019457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_011729	AAT	2	6	1019473	1019478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_011729	A	6	6	1019505	1019510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_011729	ATCA	2	8	1019526	1019533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_011729	TA	3	6	1023247	1023252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_011729	GAC	2	6	1023264	1023269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_011729	TAA	2	6	1023285	1023290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_011729	TTG	2	6	1024791	1024796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_011729	AATT	2	8	1028110	1028117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_011729	ACT	2	6	1028130	1028135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_011729	TTTCTA	2	12	1029355	1029366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4529	NC_011729	CCTC	2	8	1029377	1029384	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4530	NC_011729	A	6	6	1029403	1029408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_011729	AAT	2	6	1029780	1029785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_011729	AGG	2	6	1029791	1029796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_011729	AGG	2	6	1029798	1029803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_011729	TGTT	2	8	1029821	1029828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_011729	TGA	2	6	1029931	1029936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_011729	AAT	2	6	1029952	1029957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_011729	TAAA	2	8	1032056	1032063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_011729	ATTT	2	8	1032080	1032087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_011729	A	9	9	1032765	1032773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_011729	T	6	6	1032789	1032794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_011729	GAT	2	6	1032809	1032814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_011729	GA	3	6	1032852	1032857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_011729	TCC	2	6	1033831	1033836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_011729	A	6	6	1033837	1033842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_011729	ATT	2	6	1033880	1033885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011729	A	6	6	1033897	1033902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_011729	TTTA	2	8	1033932	1033939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_011729	T	9	9	1034031	1034039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_011729	AAG	2	6	1034085	1034090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_011729	TTA	2	6	1034101	1034106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_011729	AGT	2	6	1034116	1034121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_011729	AAT	2	6	1034154	1034159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011729	TTG	2	6	1034180	1034185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_011729	CTAACT	2	12	1034282	1034293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_011729	CTA	2	6	1034294	1034299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_011729	AG	3	6	1036423	1036428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011729	TCTG	2	8	1036433	1036440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_011729	ATG	2	6	1036491	1036496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_011729	TAA	2	6	1036522	1036527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_011729	GATT	2	8	1036570	1036577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_011729	AAT	2	6	1036605	1036610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_011729	GAA	2	6	1036633	1036638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_011729	A	6	6	1036637	1036642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011729	GGA	2	6	1036649	1036654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_011729	T	6	6	1037027	1037032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_011729	GAG	2	6	1037137	1037142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_011729	T	7	7	1037152	1037158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_011729	CGT	2	6	1037682	1037687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4570	NC_011729	GAG	2	6	1037745	1037750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_011729	TAT	2	6	1037763	1037768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4573	NC_011729	TGG	2	6	1037858	1037863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_011729	GGGAAA	2	12	1037929	1037940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_011729	AGG	2	6	1037955	1037960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_011729	CGG	2	6	1038130	1038135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4584	NC_011729	GA	3	6	1038434	1038439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_011729	GTC	2	6	1038519	1038524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4591	NC_011729	T	7	7	1041017	1041023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_011729	TCA	2	6	1041034	1041039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4599	NC_011729	ATC	2	6	1042998	1043003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4601	NC_011729	TCAA	2	8	1043070	1043077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_011729	CTA	2	6	1043137	1043142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_011729	TGAT	2	8	1044366	1044373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_011729	A	7	7	1044467	1044473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_011729	TAA	2	6	1044508	1044513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4608	NC_011729	TATC	2	8	1044583	1044590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_011729	T	6	6	1046454	1046459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_011729	ACTCAA	2	12	1046506	1046517	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_011729	TTAATA	2	12	1047861	1047872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_011729	TAT	2	6	1047973	1047978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_011729	A	6	6	1049246	1049251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_011729	T	6	6	1049252	1049257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_011729	CTA	2	6	1049285	1049290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4619	NC_011729	A	7	7	1049441	1049447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011729	TCA	2	6	1049451	1049456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4623	NC_011729	TA	3	6	1049500	1049505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_011729	TTG	2	6	1049513	1049518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4628	NC_011729	A	6	6	1053595	1053600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_011729	A	6	6	1053658	1053663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_011729	TCTG	2	8	1053666	1053673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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