MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 14746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011726	ATT	2	6	1285988	1285993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011726	AGGAT	2	10	1285996	1286005	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011726	AGG	2	6	1286059	1286064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011726	AAT	2	6	1286101	1286106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011726	TTA	2	6	1286158	1286163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011726	AGA	2	6	1287748	1287753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011726	GAAG	2	8	1287758	1287765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011726	AAC	2	6	1287777	1287782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_011726	CTG	2	6	1287800	1287805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_011726	A	6	6	1287839	1287844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_011726	TATTCA	2	12	1288278	1288289	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4012	NC_011726	ATC	2	6	1288521	1288526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_011726	CCA	2	6	1288559	1288564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_011726	TGA	2	6	1289684	1289689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011726	T	6	6	1289742	1289747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011726	ATA	2	6	1289759	1289764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011726	ATTA	2	8	1289798	1289805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011726	TTTA	2	8	1290415	1290422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011726	GTT	2	6	1290429	1290434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011726	ATA	2	6	1290450	1290455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011726	GCAGAT	2	12	1290479	1290490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4022	NC_011726	ATTTG	2	10	1290533	1290542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011726	T	6	6	1290745	1290750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011726	GAG	2	6	1291535	1291540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011726	A	6	6	1291598	1291603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011726	A	7	7	1291627	1291633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4029	NC_011726	A	6	6	1291658	1291663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011726	ATT	2	6	1291682	1291687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011726	TC	3	6	1291969	1291974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4033	NC_011726	TTC	2	6	1292125	1292130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_011726	TTTGT	2	10	1292152	1292161	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011726	TAAG	2	8	1292740	1292747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011726	A	7	7	1293257	1293263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4038	NC_011726	CAA	3	9	1294372	1294380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_011726	GTT	2	6	1295878	1295883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011726	AATA	2	8	1295892	1295899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011726	ATA	4	12	1295897	1295908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011726	TTA	2	6	1295922	1295927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011726	TC	3	6	1296462	1296467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_011726	CAT	2	6	1296491	1296496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4047	NC_011726	GGTTG	2	10	1296698	1296707	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011726	GTTA	2	8	1297123	1297130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4051	NC_011726	CCT	2	6	1298324	1298329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_011726	GAG	2	6	1298335	1298340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011726	TAA	2	6	1298346	1298351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4059	NC_011726	TGA	2	6	1299442	1299447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4061	NC_011726	ATT	2	6	1300468	1300473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011726	A	7	7	1300480	1300486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011726	CT	4	8	1300507	1300514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_011726	A	6	6	1300535	1300540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011726	AACCT	2	10	1300552	1300561	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4066	NC_011726	T	6	6	1300567	1300572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4071	NC_011726	TTCA	3	12	1302272	1302283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4074	NC_011726	TTTTA	2	10	1302546	1302555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4083	NC_011726	ATT	3	9	1305445	1305453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_011726	TAC	2	6	1305672	1305677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4095	NC_011726	AATT	2	8	1308773	1308780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_011726	A	7	7	1309224	1309230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_011726	ATT	2	6	1309248	1309253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4104	NC_011726	ATA	2	6	1309318	1309323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4121	NC_011726	AT	3	6	1322472	1322477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011726	ACT	2	6	1322480	1322485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4125	NC_011726	AGAT	2	8	1324713	1324720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011726	GATA	2	8	1324724	1324731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011726	TAAG	2	8	1325279	1325286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_011726	AC	3	6	1325593	1325598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_011726	AATA	2	8	1325658	1325665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_011726	AAGT	2	8	1325701	1325708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011726	ATC	2	6	1325710	1325715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4133	NC_011726	TA	3	6	1329746	1329751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_011726	AAT	2	6	1331725	1331730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_011726	CGA	2	6	1331757	1331762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_011726	GA	4	8	1331819	1331826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_011726	T	7	7	1331827	1331833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4143	NC_011726	GCTT	2	8	1333341	1333348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4258	NC_011726	TTA	2	6	1380820	1380825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4393	NC_011726	ATT	2	6	1420849	1420854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4395	NC_011726	ATT	2	6	1420957	1420962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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