MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 14746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011726	ACCT	2	8	995233	995240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_011726	TAAG	2	8	995244	995251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011726	CAT	2	6	995271	995276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_011726	A	6	6	995303	995308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011726	AC	3	6	995320	995325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_011726	ACCA	2	8	995329	995336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_011726	TTG	2	6	996039	996044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_011726	TTA	2	6	996775	996780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_011726	TAG	2	6	997254	997259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011726	TTG	2	6	997284	997289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_011726	TTTA	2	8	998379	998386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011726	GGGT	2	8	998473	998480	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011726	TAT	2	6	1001129	1001134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_011726	TTA	2	6	1002855	1002860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011726	TTG	2	6	1003091	1003096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011726	TCCA	2	8	1003117	1003124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_011726	ATT	2	6	1003233	1003238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011726	CGTT	2	8	1003301	1003308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_011726	TA	3	6	1003323	1003328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011726	T	6	6	1003373	1003378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011726	ATT	2	6	1003791	1003796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_011726	A	6	6	1004032	1004037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011726	T	7	7	1004121	1004127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011726	T	7	7	1004145	1004151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011726	AC	3	6	1004169	1004174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_011726	TGTT	2	8	1004771	1004778	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011726	TAA	2	6	1004811	1004816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_011726	AT	3	6	1004820	1004825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_011726	TAT	3	9	1004860	1004868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_011726	TAG	2	6	1004898	1004903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011726	TAAAA	2	10	1004904	1004913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_011726	T	7	7	1005357	1005363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011726	ATA	2	6	1005398	1005403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_011726	ATC	2	6	1005475	1005480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_011726	AACC	2	8	1005564	1005571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_011726	TAG	2	6	1005577	1005582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011726	ATT	2	6	1005623	1005628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011726	AGT	2	6	1008314	1008319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011726	TAA	2	6	1008331	1008336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011726	TAA	2	6	1008633	1008638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_011726	CAAC	2	8	1008707	1008714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_011726	AACT	2	8	1008723	1008730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_011726	GAA	2	6	1008735	1008740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011726	TCAG	2	8	1008799	1008806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_011726	A	6	6	1008814	1008819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011726	CAATGG	2	12	1009127	1009138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3047	NC_011726	CTC	2	6	1009308	1009313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_011726	A	6	6	1010096	1010101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011726	TTA	2	6	1010188	1010193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011726	ACT	2	6	1010222	1010227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_011726	GA	3	6	1010259	1010264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011726	ATG	2	6	1010312	1010317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011726	ATT	3	9	1010322	1010330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011726	A	6	6	1011227	1011232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011726	TAAG	2	8	1011280	1011287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_011726	CTT	2	6	1011289	1011294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_011726	AATT	2	8	1014584	1014591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011726	GTT	2	6	1014603	1014608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_011726	AATT	2	8	1014695	1014702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011726	TGA	2	6	1015442	1015447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011726	ATA	2	6	1015489	1015494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_011726	ATT	2	6	1015539	1015544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_011726	TGG	2	6	1015636	1015641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011726	GTC	2	6	1015648	1015653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_011726	GGT	2	6	1015709	1015714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011726	AAT	2	6	1015734	1015739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_011726	TGTT	2	8	1015821	1015828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011726	TAG	2	6	1015865	1015870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_011726	AGC	3	9	1015910	1015918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_011726	TTG	2	6	1015924	1015929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_011726	TGCTT	2	10	1015935	1015944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3072	NC_011726	CAG	2	6	1016016	1016021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_011726	T	6	6	1017579	1017584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011726	TTCT	2	8	1017678	1017685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_011726	CAGT	2	8	1017745	1017752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_011726	AG	3	6	1017765	1017770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_011726	GTT	2	6	1018523	1018528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_011726	AAC	2	6	1018559	1018564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_011726	CGGG	2	8	1018572	1018579	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3080	NC_011726	AAT	2	6	1018588	1018593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_011726	CAA	2	6	1018602	1018607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_011726	TAA	2	6	1018655	1018660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011726	CAG	2	6	1018703	1018708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_011726	AGCC	2	8	1018757	1018764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_011726	TTAAA	2	10	1019887	1019896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011726	TTTA	2	8	1019918	1019925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_011726	CTA	2	6	1019952	1019957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_011726	A	6	6	1020031	1020036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011726	TAT	2	6	1020041	1020046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_011726	A	6	6	1020056	1020061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_011726	AATT	2	8	1020108	1020115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_011726	AACG	2	8	1020128	1020135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_011726	TAGAG	2	10	1020143	1020152	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_011726	AGG	2	6	1020158	1020163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011726	T	7	7	1021323	1021329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_011726	TGA	2	6	1021334	1021339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_011726	TGT	2	6	1022289	1022294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011726	TGG	2	6	1022303	1022308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_011726	TTA	2	6	1023602	1023607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_011726	T	6	6	1023638	1023643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_011726	TAAAA	2	10	1023656	1023665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011726	CTTT	2	8	1024546	1024553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_011726	TTTGA	2	10	1024736	1024745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_011726	ATTA	2	8	1024754	1024761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011726	AAT	2	6	1024774	1024779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011726	AT	3	6	1024784	1024789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011726	T	6	6	1024805	1024810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011726	ATT	2	6	1024818	1024823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011726	TCCC	2	8	1024956	1024963	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3111	NC_011726	G	6	6	1026054	1026059	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011726	ATT	2	6	1026106	1026111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_011726	CTA	2	6	1027243	1027248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_011726	TAT	2	6	1027266	1027271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011726	AAT	2	6	1027300	1027305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011726	TG	3	6	1028683	1028688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011726	TTA	2	6	1028703	1028708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011726	TA	3	6	1028750	1028755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_011726	TAT	2	6	1028813	1028818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011726	T	6	6	1028824	1028829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011726	AGA	2	6	1028830	1028835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_011726	T	6	6	1028843	1028848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_011726	AATT	2	8	1028853	1028860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_011726	TTG	2	6	1028880	1028885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_011726	AGA	2	6	1028961	1028966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_011726	ATT	2	6	1029003	1029008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_011726	TTG	2	6	1031682	1031687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_011726	T	6	6	1031711	1031716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_011726	AG	3	6	1031726	1031731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011726	TTG	2	6	1031732	1031737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_011726	ATTT	2	8	1031752	1031759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_011726	AAT	2	6	1031765	1031770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3134	NC_011726	ACT	2	6	1031884	1031889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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