MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 14746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011726	GGA	2	6	511232	511237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011726	AT	4	8	511351	511358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011726	TTTA	2	8	511420	511427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011726	TCG	2	6	512123	512128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_011726	AAC	2	6	512136	512141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_011726	ATT	2	6	512159	512164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011726	CTA	2	6	512171	512176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_011726	TCA	2	6	512202	512207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_011726	GTT	2	6	512275	512280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011726	TTC	2	6	512297	512302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011726	TAA	3	9	512309	512317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011726	ATC	2	6	512327	512332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_011726	CCA	2	6	512333	512338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_011726	TGA	2	6	512451	512456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011726	ATA	2	6	512507	512512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011726	TGTT	2	8	512570	512577	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011726	A	6	6	512635	512640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011726	GGTC	2	8	512728	512735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_011726	TAA	2	6	512772	512777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011726	TTA	2	6	512778	512783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011726	ATTG	2	8	512796	512803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011726	TGCTA	2	10	512839	512848	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1523	NC_011726	TTG	2	6	512872	512877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011726	TGA	2	6	512883	512888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011726	GCGA	2	8	512897	512904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_011726	TAA	2	6	512931	512936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011726	TCTA	2	8	513017	513024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_011726	TAAG	2	8	513091	513098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011726	GAG	2	6	513124	513129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011726	TC	3	6	513986	513991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_011726	GA	3	6	513996	514001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011726	T	7	7	514005	514011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011726	CT	3	6	514013	514018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_011726	TGA	2	6	514027	514032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011726	ATC	2	6	514050	514055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_011726	TAA	2	6	514073	514078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011726	TATCT	2	10	514152	514161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1538	NC_011726	CAAA	2	8	514207	514214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_011726	CTA	2	6	514281	514286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_011726	TGGT	2	8	514361	514368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_011726	A	6	6	514769	514774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011726	AGAT	2	8	516180	516187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011726	ATA	2	6	516825	516830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011726	AAT	2	6	516831	516836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011726	ATT	3	9	518487	518495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011726	A	6	6	518499	518504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011726	T	6	6	518519	518524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_011726	TTG	2	6	519701	519706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011726	AAT	2	6	522721	522726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011726	A	6	6	524892	524897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011726	TGA	2	6	524945	524950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011726	TCA	2	6	524955	524960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_011726	T	8	8	525282	525289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011726	AAC	2	6	525291	525296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_011726	A	10	10	525396	525405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011726	AAT	2	6	525416	525421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011726	ATA	2	6	525424	525429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011726	TGAC	2	8	528697	528704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_011726	TAT	2	6	528740	528745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_011726	GTT	2	6	528829	528834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_011726	T	6	6	528844	528849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011726	ATG	2	6	530631	530636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011726	AT	3	6	530696	530701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_011726	GA	3	6	530738	530743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011726	T	6	6	530753	530758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011726	T	6	6	530767	530772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011726	TTAT	2	8	534369	534376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011726	AATT	2	8	534429	534436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011726	TA	3	6	537759	537764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011726	ATA	2	6	537819	537824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011726	CGC	2	6	537833	537838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_011726	TAC	2	6	537885	537890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_011726	TGT	2	6	537900	537905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011726	ATT	2	6	537996	538001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011726	ATC	2	6	538003	538008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_011726	AGA	2	6	540276	540281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011726	AGC	2	6	540335	540340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_011726	AATA	2	8	540363	540370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011726	ATC	2	6	540378	540383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_011726	TGAA	2	8	540406	540413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011726	TGG	2	6	540418	540423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011726	ATC	2	6	540424	540429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_011726	T	6	6	540495	540500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011726	AAT	2	6	540505	540510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011726	AATG	2	8	541391	541398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_011726	AAT	2	6	541469	541474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011726	GATT	3	12	541536	541547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011726	TAA	2	6	543320	543325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011726	TAT	2	6	544633	544638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_011726	TTA	2	6	544710	544715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011726	A	6	6	544722	544727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011726	T	7	7	544771	544777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011726	T	8	8	544783	544790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011726	CAT	2	6	544791	544796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_011726	CAAGT	2	10	544802	544811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1596	NC_011726	T	6	6	546577	546582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011726	ATT	2	6	549703	549708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011726	GTC	2	6	549711	549716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_011726	CTC	2	6	549722	549727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_011726	ATTAT	2	10	550720	550729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011726	GCT	2	6	550751	550756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_011726	TAA	2	6	550823	550828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011726	CT	3	6	550838	550843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_011726	CTC	2	6	550858	550863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_011726	GAT	2	6	550888	550893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011726	TTA	2	6	551816	551821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011726	GTAG	2	8	551859	551866	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011726	ATG	2	6	551943	551948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011726	A	6	6	551979	551984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011726	TCT	3	9	551994	552002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_011726	CTTCCC	2	12	552022	552033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_011726	TTA	2	6	552180	552185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011726	CA	3	6	552214	552219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_011726	CAA	2	6	552393	552398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_011726	AATT	2	8	554527	554534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011726	ATT	2	6	554538	554543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_011726	A	6	6	554578	554583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011726	AAT	2	6	554590	554595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011726	ATA	2	6	554596	554601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011726	ATA	2	6	555943	555948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_011726	ATA	2	6	555953	555958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011726	ATG	2	6	556930	556935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011726	GGC	2	6	559217	559222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_011726	GACTT	2	10	559284	559293	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_011726	T	6	6	559292	559297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011726	GAT	2	6	560699	560704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_011726	ACTTA	2	10	560718	560727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1628	NC_011726	ACC	2	6	560737	560742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_011726	AAC	2	6	561967	561972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011726	ATT	2	6	563737	563742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011726	T	6	6	563757	563762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011726	AGA	2	6	563773	563778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011726	GGCT	2	8	563859	563866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_011726	CTT	2	6	565554	565559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_011726	ACTC	2	8	565570	565577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1637	NC_011726	TGA	2	6	566226	566231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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