MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 14746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011726	T	7	7	192930	192936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011726	AGAT	2	8	192978	192985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011726	CCA	2	6	194163	194168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_011726	TAT	2	6	194175	194180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011726	ATT	2	6	194193	194198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011726	TTC	2	6	194242	194247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011726	TAA	2	6	194260	194265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011726	AAAG	2	8	194326	194333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011726	AAT	2	6	196575	196580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011726	AAC	2	6	196588	196593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011726	TA	3	6	197198	197203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011726	ACAA	2	8	197223	197230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_011726	ATA	2	6	197257	197262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011726	ATT	2	6	197778	197783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011726	AT	3	6	197795	197800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011726	TAA	2	6	197819	197824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011726	GTC	2	6	198823	198828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011726	TTTTA	2	10	199057	199066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011726	CTT	2	6	201305	201310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011726	TGTT	2	8	201316	201323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011726	ATT	2	6	201347	201352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011726	ACT	2	6	201364	201369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011726	TAAA	2	8	201408	201415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011726	GGTAG	2	10	201426	201435	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011726	A	6	6	201516	201521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011726	ATG	2	6	202732	202737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011726	T	6	6	202747	202752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011726	ATA	2	6	202821	202826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011726	TTTA	2	8	202836	202843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011726	TGA	2	6	202850	202855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011726	TTG	2	6	202866	202871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011726	T	7	7	202911	202917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011726	ATC	2	6	202922	202927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011726	T	6	6	202945	202950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011726	TTGAC	2	10	204217	204226	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
536	NC_011726	AG	3	6	205504	205509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011726	AAT	2	6	205512	205517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011726	TGAT	2	8	205524	205531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011726	TGA	2	6	205540	205545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011726	TAA	2	6	205598	205603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011726	ATC	2	6	206012	206017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011726	T	7	7	206055	206061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011726	CTTGA	2	10	206083	206092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
544	NC_011726	AAT	2	6	206107	206112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011726	ATA	2	6	206169	206174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011726	CAA	2	6	206178	206183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011726	T	6	6	206627	206632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011726	CTTGA	2	10	206654	206663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
549	NC_011726	AAT	2	6	206678	206683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011726	ATG	2	6	206864	206869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011726	TTG	2	6	206977	206982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011726	TAA	2	6	207006	207011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011726	C	6	6	207086	207091	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
554	NC_011726	C	6	6	207095	207100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
555	NC_011726	GAA	2	6	207263	207268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011726	GCAA	2	8	207280	207287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_011726	TTG	2	6	207311	207316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011726	GAA	2	6	207347	207352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011726	TAA	3	9	207361	207369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011726	TGC	2	6	207370	207375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_011726	AGA	2	6	207475	207480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011726	GGT	2	6	207502	207507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011726	TATCC	2	10	207509	207518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
564	NC_011726	ATG	2	6	207543	207548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011726	CAA	2	6	207566	207571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011726	AAT	2	6	207683	207688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011726	CT	3	6	207717	207722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_011726	CA	3	6	207766	207771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_011726	AAT	2	6	207773	207778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011726	AGA	2	6	207829	207834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011726	CGC	2	6	207982	207987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_011726	A	6	6	208014	208019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011726	CTTT	2	8	208068	208075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_011726	AGG	2	6	208078	208083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011726	TCA	2	6	208120	208125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011726	TTTG	2	8	208168	208175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011726	CAT	2	6	208190	208195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_011726	TTGC	2	8	208237	208244	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_011726	GTTT	2	8	208245	208252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011726	CGT	2	6	208253	208258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011726	TGC	2	6	208276	208281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_011726	TAT	2	6	208367	208372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011726	ACC	2	6	208377	208382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_011726	CTA	2	6	208424	208429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011726	ACA	2	6	208457	208462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011726	TAAC	2	8	209716	209723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_011726	ATA	2	6	209763	209768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011726	ATT	2	6	209818	209823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011726	T	6	6	210574	210579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011726	CT	3	6	210612	210617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_011726	A	6	6	211067	211072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011726	T	6	6	211087	211092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011726	TTA	2	6	211098	211103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011726	ATA	2	6	211129	211134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011726	ACG	2	6	211165	211170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011726	AC	3	6	211212	211217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_011726	ACT	2	6	211224	211229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_011726	AGAA	2	8	211263	211270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011726	TA	3	6	211271	211276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011726	AAGT	2	8	211292	211299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011726	A	6	6	213384	213389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011726	AAT	2	6	213785	213790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011726	A	6	6	213883	213888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011726	GTT	2	6	213911	213916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011726	TAA	2	6	213917	213922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011726	ACC	2	6	213950	213955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_011726	ATCA	2	8	217457	217464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_011726	AATT	2	8	217734	217741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011726	TTA	2	6	217745	217750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011726	GTA	2	6	218660	218665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011726	T	6	6	219968	219973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011726	TGA	2	6	221165	221170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011726	TAA	2	6	221612	221617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011726	GTT	2	6	222006	222011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011726	GTT	2	6	222040	222045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011726	GAA	2	6	222059	222064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011726	GCT	2	6	222073	222078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011726	ATG	3	9	222079	222087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011726	TTA	3	9	222234	222242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011726	T	8	8	222281	222288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011726	ATCT	2	8	222585	222592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_011726	TCT	2	6	222596	222601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_011726	TTC	2	6	222650	222655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011726	CTC	2	6	222685	222690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_011726	TAACA	2	10	222701	222710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
626	NC_011726	A	6	6	223326	223331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011726	TCA	2	6	223336	223341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011726	TTA	2	6	224703	224708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011726	CTT	2	6	225260	225265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011726	A	7	7	225813	225819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011726	TGT	2	6	225827	225832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011726	TTC	2	6	226795	226800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011726	GAT	2	6	227234	227239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011726	CT	3	6	232041	232046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_011726	T	6	6	233729	233734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011726	AT	3	6	233837	233842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011726	AAG	2	6	233844	233849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011726	CTC	2	6	233913	233918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_011726	TCT	2	6	233932	233937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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