MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 14746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011726	GCA	2	6	1820547	1820552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_011726	TAA	2	6	1820555	1820560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_011726	CAA	2	6	1822604	1822609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_011726	CCA	2	6	1822630	1822635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_011726	AACTA	2	10	1822649	1822658	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5506	NC_011726	GTT	2	6	1822671	1822676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011726	T	6	6	1822706	1822711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011726	A	7	7	1823149	1823155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_011726	AACA	2	8	1823167	1823174	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_011726	CCT	2	6	1823779	1823784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_011726	A	7	7	1823811	1823817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_011726	A	6	6	1823865	1823870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_011726	TCA	2	6	1823909	1823914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_011726	CTG	2	6	1823951	1823956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_011726	TCA	2	6	1824004	1824009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_011726	ATT	2	6	1826108	1826113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_011726	GGA	2	6	1826170	1826175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_011726	T	6	6	1826272	1826277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011726	TGT	2	6	1826311	1826316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_011726	TTG	2	6	1826323	1826328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_011726	TAT	2	6	1826725	1826730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_011726	CAA	2	6	1826797	1826802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_011726	TAA	2	6	1826826	1826831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011726	AAT	2	6	1826897	1826902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011726	T	8	8	1826902	1826909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011726	GAT	2	6	1826927	1826932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011726	ATACA	2	10	1826950	1826959	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5528	NC_011726	T	6	6	1826963	1826968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_011726	AGTA	2	8	1827097	1827104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_011726	ATTA	2	8	1827175	1827182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_011726	TAG	2	6	1827243	1827248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_011726	A	6	6	1827496	1827501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_011726	ATA	2	6	1827541	1827546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011726	AAT	2	6	1827553	1827558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011726	T	6	6	1827834	1827839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011726	TAAT	2	8	1827843	1827850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011726	TAAT	2	8	1827855	1827862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_011726	AAT	2	6	1827874	1827879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011726	ATC	2	6	1827886	1827891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_011726	TGA	2	6	1827900	1827905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_011726	GCA	2	6	1830285	1830290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011726	TG	3	6	1830339	1830344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_011726	GGC	2	6	1830371	1830376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_011726	TATT	2	8	1830802	1830809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_011726	ATT	2	6	1830837	1830842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_011726	ATTTT	2	10	1831445	1831454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_011726	CCT	2	6	1831529	1831534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_011726	GAT	2	6	1832905	1832910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_011726	TTA	2	6	1836871	1836876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_011726	TTA	2	6	1836892	1836897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_011726	TTA	2	6	1836906	1836911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_011726	TTC	2	6	1836927	1836932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_011726	ATCT	2	8	1840294	1840301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_011726	AAG	2	6	1840313	1840318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011726	GGT	2	6	1841153	1841158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_011726	T	6	6	1841199	1841204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_011726	AG	3	6	1841567	1841572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011726	TC	3	6	1841713	1841718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_011726	A	7	7	1841748	1841754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_011726	CAGA	2	8	1841765	1841772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_011726	ATAC	2	8	1841820	1841827	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_011726	TAA	2	6	1841898	1841903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_011726	AAAG	2	8	1841913	1841920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_011726	GGT	2	6	1841941	1841946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011726	A	6	6	1841953	1841958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011726	TTA	2	6	1841979	1841984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011726	AGA	2	6	1842020	1842025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011726	CT	3	6	1842042	1842047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_011726	GAAG	2	8	1842050	1842057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_011726	TAA	2	6	1842069	1842074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_011726	AAAG	2	8	1842094	1842101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_011726	AT	3	6	1842130	1842135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011726	A	6	6	1842147	1842152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_011726	AG	3	6	1842238	1842243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_011726	CAAA	2	8	1842266	1842273	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_011726	GAAA	2	8	1842298	1842305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_011726	TTA	2	6	1842375	1842380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_011726	GAATA	2	10	1842399	1842408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_011726	AAG	2	6	1842510	1842515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011726	GA	3	6	1842531	1842536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_011726	AGA	2	6	1842551	1842556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_011726	ACC	2	6	1842578	1842583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_011726	TGA	2	6	1842601	1842606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_011726	AAG	2	6	1842651	1842656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011726	GAA	2	6	1842686	1842691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_011726	TGG	2	6	1842767	1842772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_011726	TG	3	6	1842783	1842788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_011726	CAT	2	6	1842809	1842814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_011726	CAA	2	6	1842857	1842862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_011726	TTG	2	6	1843054	1843059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_011726	TTC	2	6	1843075	1843080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_011726	AGA	2	6	1843094	1843099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011726	GA	3	6	1843098	1843103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011726	AAT	2	6	1843177	1843182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_011726	CAA	2	6	1843208	1843213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_011726	AGTA	2	8	1843250	1843257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_011726	GTA	2	6	1845733	1845738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_011726	AG	3	6	1845752	1845757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_011726	T	6	6	1845759	1845764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011726	ATT	2	6	1845810	1845815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_011726	ATT	2	6	1845831	1845836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_011726	TCT	2	6	1845853	1845858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_011726	CCTAC	2	10	1846679	1846688	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5604	NC_011726	TTGA	2	8	1846692	1846699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_011726	AAG	2	6	1846710	1846715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_011726	TAT	2	6	1849284	1849289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5608	NC_011726	TA	3	6	1852513	1852518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_011726	TTC	2	6	1852550	1852555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_011726	AATC	2	8	1852556	1852563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_011726	AAT	2	6	1852637	1852642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_011726	GA	3	6	1852658	1852663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_011726	TTTG	2	8	1852711	1852718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_011726	CG	3	6	1852743	1852748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_011726	T	6	6	1852796	1852801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_011726	TAT	2	6	1852815	1852820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5618	NC_011726	CAT	2	6	1852857	1852862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5622	NC_011726	TAA	2	6	1854089	1854094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_011726	TAA	2	6	1854603	1854608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_011726	T	7	7	1855170	1855176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_011726	AAG	2	6	1855177	1855182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_011726	ATT	2	6	1855187	1855192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_011726	GA	3	6	1855312	1855317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_011726	GT	3	6	1856832	1856837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_011726	CTGTG	2	10	1856852	1856861	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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