MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 14746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011726	AAT	2	6	1648331	1648336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011726	A	6	6	1648442	1648447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_011726	T	7	7	1649107	1649113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011726	GTT	2	6	1649114	1649119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011726	ATT	2	6	1649168	1649173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011726	TTC	2	6	1650380	1650385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_011726	A	7	7	1650436	1650442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011726	ATA	2	6	1651759	1651764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011726	T	7	7	1651782	1651788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011726	TAAA	2	8	1652572	1652579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011726	CAAT	2	8	1652584	1652591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_011726	TTA	2	6	1653267	1653272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011726	AGA	2	6	1653594	1653599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011726	CTG	2	6	1653601	1653606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_011726	ACA	2	6	1655142	1655147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011726	GTT	2	6	1655236	1655241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011726	CT	3	6	1655314	1655319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_011726	ATC	2	6	1655458	1655463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_011726	AGA	2	6	1655479	1655484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011726	GA	3	6	1655483	1655488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011726	GCT	2	6	1655573	1655578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_011726	TTG	2	6	1655623	1655628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011726	TCA	2	6	1655675	1655680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_011726	AGT	2	6	1655685	1655690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011726	CAGT	2	8	1655708	1655715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_011726	GTT	2	6	1655747	1655752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011726	CAA	2	6	1655780	1655785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_011726	CAA	2	6	1656549	1656554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_011726	ATA	2	6	1656571	1656576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011726	T	6	6	1656606	1656611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011726	A	6	6	1656637	1656642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011726	GGC	2	6	1657140	1657145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_011726	GGT	2	6	1657186	1657191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011726	AAAG	2	8	1657213	1657220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011726	GATCT	2	10	1657226	1657235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5036	NC_011726	GA	3	6	1658159	1658164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011726	TATT	2	8	1659078	1659085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011726	TG	3	6	1659134	1659139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_011726	ATC	2	6	1659183	1659188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_011726	AATG	2	8	1659196	1659203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011726	ATAA	2	8	1661194	1661201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011726	TCT	2	6	1662014	1662019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011726	T	6	6	1662123	1662128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011726	CTT	2	6	1662166	1662171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_011726	GC	3	6	1662197	1662202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_011726	CAGT	2	8	1662215	1662222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_011726	CTA	2	6	1662273	1662278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_011726	ATT	2	6	1662647	1662652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011726	TAA	2	6	1664108	1664113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011726	GAT	2	6	1664117	1664122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011726	TTC	2	6	1664173	1664178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_011726	CT	3	6	1664202	1664207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_011726	TTG	2	6	1664223	1664228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011726	T	6	6	1666199	1666204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011726	TA	3	6	1667580	1667585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011726	AATA	2	8	1667647	1667654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011726	T	7	7	1667662	1667668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011726	TTG	2	6	1667684	1667689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_011726	TAAT	2	8	1667707	1667714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011726	T	7	7	1667736	1667742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011726	ATCTC	2	10	1667758	1667767	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5062	NC_011726	TAA	2	6	1667795	1667800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011726	GA	3	6	1667838	1667843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011726	AGC	2	6	1671326	1671331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_011726	TCAAT	2	10	1671419	1671428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5066	NC_011726	A	6	6	1671530	1671535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011726	ATC	2	6	1671645	1671650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_011726	TA	3	6	1671692	1671697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011726	TCT	2	6	1671727	1671732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5075	NC_011726	AAC	2	6	1671915	1671920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_011726	GTT	2	6	1671946	1671951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_011726	CAT	2	6	1672338	1672343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5081	NC_011726	GTA	2	6	1673098	1673103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5085	NC_011726	TCT	2	6	1676693	1676698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5089	NC_011726	T	6	6	1676872	1676877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011726	TA	3	6	1676919	1676924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_011726	GTT	2	6	1676998	1677003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_011726	A	6	6	1677250	1677255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_011726	ATGAT	2	10	1677300	1677309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011726	GAA	2	6	1677318	1677323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_011726	GGA	2	6	1677458	1677463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_011726	GTT	2	6	1678901	1678906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011726	AAC	2	6	1678933	1678938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_011726	AGGT	2	8	1678956	1678963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_011726	TAG	2	6	1679795	1679800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_011726	T	7	7	1680963	1680969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011726	AAG	2	6	1683726	1683731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5115	NC_011726	TTA	2	6	1684977	1684982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_011726	T	7	7	1685097	1685103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011726	T	7	7	1685116	1685122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011726	CTA	2	6	1685173	1685178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5122	NC_011726	T	6	6	1687479	1687484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011726	AATC	2	8	1687490	1687497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5128	NC_011726	T	6	6	1691565	1691570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_011726	TAT	2	6	1691632	1691637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_011726	A	6	6	1691643	1691648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_011726	TAA	2	6	1691656	1691661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_011726	TAA	2	6	1691684	1691689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_011726	TCAC	2	8	1691711	1691718	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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