MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 9016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011565	GTT	2	6	1401	1406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011565	AGT	3	9	1507	1515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011565	A	10	10	1529	1538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011565	CT	3	6	1574	1579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011565	TATTT	2	10	1599	1608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011565	CAA	2	6	1633	1638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011565	AAT	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011565	TC	3	6	1680	1685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011565	T	6	6	1694	1699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011565	AAT	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011565	A	7	7	3499	3505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011565	ATGAA	2	10	5282	5291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011565	ATA	2	6	5297	5302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011565	CAAA	2	8	5303	5310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011565	A	7	7	5321	5327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011565	TA	4	8	5335	5342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011565	AT	3	6	5346	5351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011565	CT	3	6	5384	5389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011565	TAA	2	6	5391	5396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011565	T	7	7	6760	6766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011565	T	8	8	11027	11034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011565	ACA	2	6	14889	14894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011565	ATC	2	6	14903	14908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011565	ATA	2	6	14928	14933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011565	A	6	6	14933	14938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011565	TC	3	6	14979	14984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011565	CAAA	2	8	14988	14995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011565	ACA	2	6	15011	15016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011565	ATTT	2	8	15451	15458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011565	T	6	6	15456	15461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011565	CTCA	2	8	17253	17260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011565	ACAA	2	8	17265	17272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011565	ATCTA	2	10	17307	17316	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011565	ACA	2	6	17344	17349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011565	CA	3	6	17367	17372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011565	TCC	2	6	17395	17400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011565	TTTA	2	8	18004	18011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011565	GTAC	2	8	18038	18045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011565	A	7	7	18061	18067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011565	TA	3	6	18080	18085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011565	TAT	2	6	18327	18332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011565	CATA	2	8	18334	18341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011565	ATAC	2	8	18342	18349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011565	GA	3	6	18373	18378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011565	ATG	2	6	18481	18486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011565	TAA	2	6	18487	18492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011565	T	6	6	18496	18501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011565	ATTT	2	8	19710	19717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011565	TA	3	6	19723	19728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011565	ATT	2	6	19776	19781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011565	AAG	2	6	19863	19868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011565	A	6	6	19869	19874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011565	AT	3	6	19886	19891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011565	TTC	2	6	19903	19908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011565	GAA	2	6	19913	19918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011565	A	6	6	19929	19934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011565	A	8	8	19943	19950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011565	AAT	2	6	20011	20016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011565	CAAT	2	8	20026	20033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011565	ATAA	2	8	20068	20075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011565	GTA	2	6	20178	20183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011565	GTA	2	6	20196	20201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011565	GAA	3	9	20240	20248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011565	CT	3	6	20252	20257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011565	TCC	2	6	20272	20277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011565	TCC	2	6	20288	20293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011565	CTT	2	6	20368	20373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011565	A	6	6	20409	20414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011565	A	6	6	20466	20471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011565	GAT	2	6	20521	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011565	TTC	2	6	20579	20584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011565	AC	3	6	20594	20599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011565	GAA	2	6	20645	20650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011565	CGT	2	6	20697	20702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011565	ACA	2	6	20741	20746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011565	TAT	2	6	23988	23993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011565	A	7	7	24052	24058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011565	TG	3	6	24060	24065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011565	TATTT	2	10	24130	24139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011565	T	6	6	24137	24142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011565	TTG	2	6	24174	24179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011565	CAC	2	6	24245	24250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011565	CTA	2	6	24329	24334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011565	AGC	2	6	24347	24352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011565	ATC	2	6	24387	24392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011565	AAC	2	6	24409	24414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011565	A	11	11	24513	24523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011565	AGC	2	6	24550	24555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011565	A	7	7	24556	24562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011565	AGA	2	6	24577	24582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011565	AAG	2	6	24584	24589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011565	TCT	2	6	24595	24600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011565	T	6	6	24602	24607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011565	ACAA	2	8	24624	24631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011565	CTA	2	6	25785	25790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011565	AAGC	2	8	25834	25841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011565	ACATG	2	10	25846	25855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011565	CT	3	6	25882	25887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011565	CTCA	2	8	25892	25899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011565	TGAT	2	8	25909	25916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011565	CT	3	6	25954	25959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011565	ATAC	2	8	25977	25984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011565	A	7	7	26020	26026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011565	T	6	6	26051	26056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011565	TAC	2	6	27485	27490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011565	TAG	2	6	27495	27500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011565	ATG	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011565	AATC	2	8	27571	27578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011565	CCAC	2	8	27586	27593	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_011565	TTCA	2	8	27596	27603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011565	TTC	2	6	27662	27667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011565	TCA	2	6	27699	27704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011565	TA	3	6	27737	27742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011565	TAA	2	6	28114	28119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011565	AT	3	6	28136	28141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011565	T	6	6	28141	28146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011565	A	6	6	28187	28192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011565	GAT	2	6	28775	28780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011565	AAT	2	6	28781	28786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011565	T	6	6	28790	28795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011565	ACT	2	6	28804	28809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011565	AAT	2	6	28820	28825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011565	TAA	2	6	29610	29615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011565	TGT	2	6	29624	29629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011565	A	6	6	29658	29663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011565	TG	3	6	29672	29677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011565	AG	3	6	30953	30958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011565	ATAA	2	8	30973	30980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011565	AAG	2	6	30985	30990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011565	A	6	6	31957	31962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011565	T	7	7	31979	31985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011565	CT	3	6	32006	32011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011565	AACTTG	2	12	32034	32045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_011565	CATC	2	8	32076	32083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011565	A	7	7	32147	32153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011565	AC	3	6	32201	32206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011565	AACTAG	2	12	32231	32242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_011565	C	6	6	34201	34206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_011565	TAT	2	6	34217	34222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011565	TC	3	6	34253	34258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011565	AAT	2	6	34338	34343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011565	T	6	6	34368	34373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011565	TTTTA	2	10	34402	34411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011565	TAAT	2	8	34422	34429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011565	AGA	2	6	34649	34654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011565	AT	3	6	34674	34679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011565	TCT	2	6	34690	34695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011565	TC	3	6	34701	34706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011565	TTG	2	6	34765	34770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011565	ATAA	2	8	34808	34815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_011565	AT	3	6	83938	83943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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