MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	TGT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011564	AGC	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011564	TAA	2	6	4345	4350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011564	ACG	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011564	ATC	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011564	ATT	2	6	4601	4606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011564	ATT	2	6	4990	4995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011564	AAT	2	6	4996	5001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011564	GTT	2	6	5408	5413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011564	GTT	2	6	5416	5421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011564	GTT	2	6	5430	5435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011564	ATT	2	6	5454	5459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011564	TTA	2	6	5497	5502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011564	ATC	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011564	TCT	2	6	7327	7332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011564	AGA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011564	TAG	2	6	8656	8661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011564	AAT	2	6	8751	8756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011564	GGA	2	6	8800	8805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011564	TAA	2	6	8837	8842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011564	GAT	2	6	8928	8933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011564	GAT	2	6	8971	8976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011564	TTG	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011564	AAC	2	6	9153	9158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011564	GTA	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011564	GCA	2	6	9782	9787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011564	TGA	2	6	9822	9827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011564	ATT	2	6	9901	9906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011564	ATT	2	6	9926	9931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011564	TAG	2	6	11188	11193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011564	ATG	2	6	11201	11206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011564	ACA	2	6	11263	11268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011564	TCT	2	6	12963	12968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011564	TAT	2	6	13027	13032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011564	ATG	2	6	13148	13153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011564	GTT	2	6	13182	13187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011564	TGC	2	6	13225	13230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011564	TGA	2	6	13350	13355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011564	CGC	2	6	13578	13583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011564	ATC	2	6	13853	13858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011564	GTT	2	6	13898	13903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011564	GAT	3	9	14207	14215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011564	TGT	2	6	14274	14279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011564	AAC	2	6	14318	14323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011564	TGA	2	6	14393	14398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011564	AAC	2	6	14617	14622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011564	TGT	2	6	14902	14907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011564	AGT	2	6	15413	15418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011564	ATA	2	6	15507	15512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011564	ACA	2	6	15574	15579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011564	TAC	2	6	15619	15624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011564	TGA	2	6	15641	15646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011564	GAA	2	6	15686	15691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011564	AGA	2	6	15731	15736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011564	TCT	2	6	15785	15790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011564	CCA	2	6	15820	15825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011564	ATG	2	6	15853	15858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011564	TTC	2	6	15921	15926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011564	CTC	2	6	15951	15956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011564	TCC	2	6	15963	15968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011564	GAA	2	6	15982	15987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011564	AAC	2	6	16190	16195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011564	TTG	2	6	16257	16262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011564	GAT	2	6	16268	16273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011564	GTT	2	6	16318	16323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011564	TTC	2	6	16542	16547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011564	ATA	2	6	17272	17277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011564	TAC	2	6	17355	17360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011564	ATG	2	6	19699	19704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011564	TCC	2	6	20176	20181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011564	TGT	2	6	20241	20246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011564	TCT	2	6	20276	20281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011564	TAA	2	6	20390	20395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011564	CTT	2	6	20475	20480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011564	AGT	2	6	20559	20564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011564	ACT	2	6	20914	20919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011564	TGC	2	6	20991	20996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011564	GGA	2	6	21204	21209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011564	TTC	2	6	21271	21276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011564	GAT	2	6	21413	21418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011564	ATC	2	6	21463	21468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011564	ATG	2	6	21897	21902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011564	TAT	2	6	21908	21913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011564	ATC	2	6	21926	21931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011564	CTG	2	6	21936	21941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011564	CGT	2	6	21957	21962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011564	TTA	2	6	21978	21983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011564	GAT	2	6	22038	22043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011564	AGC	2	6	22237	22242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011564	TGT	2	6	22244	22249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011564	TCA	2	6	22302	22307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011564	AAT	2	6	22343	22348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011564	ATA	2	6	22429	22434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011564	ATA	2	6	22518	22523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011564	ATA	2	6	22880	22885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011564	GTC	2	6	22897	22902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011564	TTC	3	9	22943	22951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011564	ATA	2	6	22956	22961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011564	TTG	2	6	23525	23530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011564	TAG	2	6	24947	24952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011564	TTC	2	6	24954	24959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011564	TCT	2	6	24996	25001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011564	ATT	2	6	25117	25122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011564	TAA	2	6	25127	25132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011564	TCT	2	6	25152	25157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011564	ATT	2	6	25749	25754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011564	TTC	2	6	25769	25774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011564	ACT	2	6	26617	26622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011564	TGA	2	6	26714	26719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011564	TTA	2	6	26733	26738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011564	TAC	2	6	26847	26852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011564	GTT	2	6	26864	26869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011564	TTC	2	6	26879	26884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011564	CTT	2	6	26941	26946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011564	ATG	2	6	26967	26972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011564	TCT	2	6	27002	27007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011564	TAA	2	6	27114	27119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011564	TCT	2	6	27188	27193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011564	CTT	3	9	27198	27206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011564	AAC	2	6	27280	27285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011564	ATT	2	6	27662	27667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011564	TTA	2	6	27797	27802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011564	TAT	2	6	27807	27812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011564	AAG	2	6	29793	29798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011564	ATT	2	6	29998	30003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011564	TGT	3	9	30070	30078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011564	AGA	2	6	30220	30225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011564	ATG	2	6	30333	30338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011564	TTC	2	6	30394	30399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011564	AAG	2	6	30402	30407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011564	TCG	2	6	30413	30418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011564	CTT	2	6	30670	30675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011564	TAA	2	6	32130	32135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011564	GTT	2	6	32751	32756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011564	ACA	2	6	32851	32856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011564	TCC	2	6	32892	32897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011564	TTC	2	6	32912	32917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011564	CTT	2	6	32971	32976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011564	ATC	2	6	32979	32984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011564	ATC	2	6	33020	33025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011564	CTT	2	6	33056	33061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011564	TAT	2	6	33096	33101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011564	ATT	2	6	33109	33114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011564	TCT	2	6	33204	33209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011564	TTC	2	6	33254	33259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_011564	CAT	2	6	33286	33291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011564	CTT	2	6	33301	33306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011564	ATC	2	6	33350	33355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011564	CTT	2	6	33389	33394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011564	TCT	2	6	33399	33404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011564	ATT	2	6	33502	33507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_011564	CTT	2	6	34431	34436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_011564	AGT	2	6	34696	34701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_011564	ATT	2	6	34925	34930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_011564	TTA	2	6	37356	37361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.