MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	ACTG	2	8	1724	1731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011562	GGAA	2	8	1851	1858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011562	GACA	2	8	1956	1963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011562	TATT	2	8	2690	2697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011562	TTTG	2	8	7496	7503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011562	AAAT	2	8	7624	7631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011562	AATG	2	8	10633	10640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011562	TTCT	2	8	10668	10675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011562	TGTC	2	8	11021	11028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011562	AAAG	2	8	11326	11333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011562	CGTT	2	8	11671	11678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011562	TGGG	2	8	11686	11693	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011562	CCCA	2	8	11728	11735	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_011562	CATA	2	8	11990	11997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011562	CCCA	2	8	12410	12417	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_011562	GTAC	2	8	12472	12479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011562	GAAT	2	8	12495	12502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011562	AGAT	2	8	13947	13954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011562	AATG	2	8	14002	14009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011562	TAGA	2	8	14122	14129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011562	GCAC	2	8	14314	14321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011562	AGGC	2	8	14346	14353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011562	AAAC	2	8	14646	14653	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011562	AGTA	2	8	14910	14917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011562	ATGA	2	8	15396	15403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011562	AGAA	2	8	15904	15911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011562	CCTT	2	8	17631	17638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011562	AGAT	2	8	20390	20397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011562	ACCA	2	8	21416	21423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011562	TTTC	2	8	21496	21503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011562	TCTT	2	8	21543	21550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011562	TTAT	2	8	21667	21674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011562	AATG	2	8	21728	21735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011562	GACA	2	8	21776	21783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011562	ATTC	2	8	21795	21802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011562	ATAA	2	8	23630	23637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011562	TCTT	2	8	24483	24490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011562	TGCC	2	8	25142	25149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011562	TAAG	2	8	25830	25837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011562	ATTT	2	8	26040	26047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011562	TGTT	2	8	26099	26106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011562	GTAT	2	8	26360	26367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011562	AGAT	2	8	26493	26500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011562	TATC	2	8	27436	27443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011562	TGGT	2	8	31000	31007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011562	AATG	2	8	31076	31083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011562	TTTA	2	8	31219	31226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011562	ATAA	2	8	31229	31236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011562	TAAT	2	8	31757	31764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011562	TAAT	2	8	31789	31796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011562	TAAT	2	8	31821	31828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.