MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	TGT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011561	GTA	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011561	GCA	2	6	4518	4523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011561	TGA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011561	TAT	2	6	4624	4629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011561	ATT	2	6	4649	4654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011561	TAC	2	6	7248	7253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011561	ACT	2	6	7281	7286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011561	CAG	2	6	7308	7313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011561	TAA	3	9	7318	7326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011561	GAT	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011561	ATT	2	6	7403	7408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011561	CCA	2	6	10789	10794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011561	TTC	2	6	10809	10814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011561	CAT	2	6	10819	10824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011561	AGT	5	15	10892	10906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011561	CTT	2	6	10983	10988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011561	TTA	2	6	11036	11041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011561	TGA	2	6	12217	12222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011561	AAT	2	6	12288	12293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011561	TGT	2	6	12367	12372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011561	AAC	2	6	12380	12385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011561	GAA	2	6	12420	12425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011561	CTT	2	6	12600	12605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011561	GAA	2	6	12628	12633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011561	GAA	2	6	12642	12647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011561	GAA	2	6	12656	12661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011561	ATG	2	6	12704	12709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011561	ACA	2	6	12737	12742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011561	CTA	2	6	12813	12818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011561	ATA	2	6	12952	12957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011561	GAT	2	6	14183	14188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011561	ATT	2	6	14213	14218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011561	TCT	2	6	14630	14635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011561	TAT	2	6	14694	14699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011561	ATG	2	6	14809	14814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011561	AAT	2	6	14892	14897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011561	GAT	2	6	14972	14977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011561	CTT	2	6	15022	15027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011561	TGA	2	6	15978	15983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011561	ATC	2	6	16023	16028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011561	TTA	2	6	16038	16043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011561	TCC	3	9	18867	18875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011561	TGT	2	6	18932	18937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011561	TCT	2	6	18967	18972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011561	AAC	2	6	19033	19038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011561	TAA	2	6	19081	19086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011561	CTT	2	6	19156	19161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011561	TCT	2	6	19288	19293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011561	TCA	2	6	19297	19302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011561	ACA	2	6	19347	19352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011561	TGC	2	6	19670	19675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011561	ATA	2	6	19707	19712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011561	ATC	2	6	19775	19780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011561	ATA	2	6	20063	20068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011561	CTT	2	6	20082	20087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011561	TCT	2	6	20146	20151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011561	TAA	2	6	20608	20613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011561	GTT	2	6	21365	21370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011561	CTG	2	6	21449	21454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011561	CAT	2	6	21497	21502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011561	GTA	2	6	21547	21552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011561	ATG	2	6	21580	21585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011561	CAT	2	6	21592	21597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011561	TGC	2	6	21628	21633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011561	ATA	2	6	21672	21677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011561	CAA	2	6	21691	21696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011561	TCG	2	6	21801	21806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011561	TGA	2	6	21891	21896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011561	GAA	2	6	21930	21935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011561	TGT	2	6	21966	21971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011561	GAA	2	6	22031	22036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011561	AAT	2	6	22047	22052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011561	AAT	2	6	22100	22105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011561	TCA	2	6	22178	22183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011561	CAA	2	6	22317	22322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011561	ATC	3	9	22393	22401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011561	TGC	2	6	22462	22467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011561	TAG	2	6	22483	22488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011561	TTC	2	6	22490	22495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011561	TCT	2	6	22806	22811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011561	GTT	2	6	22831	22836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011561	CCA	2	6	22898	22903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011561	TAG	2	6	22970	22975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011561	TGT	2	6	23106	23111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011561	ATC	2	6	23172	23177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011561	TTG	2	6	23222	23227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011561	CAC	2	6	23305	23310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011561	AGT	2	6	23897	23902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011561	CAG	2	6	23946	23951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011561	ATA	2	6	23954	23959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011561	TTC	2	6	23961	23966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011561	CTT	2	6	24004	24009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011561	TGC	2	6	24078	24083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011561	TAA	2	6	24134	24139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011561	CTT	2	6	24157	24162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011561	GAG	2	6	24267	24272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011561	ATG	2	6	24274	24279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011561	ACT	2	6	24336	24341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011561	TAT	2	6	24461	24466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011561	TCA	3	9	24524	24532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011561	ACA	2	6	24562	24567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011561	CTA	2	6	24656	24661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011561	TAT	2	6	24727	24732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011561	TTA	2	6	25338	25343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011561	TAC	2	6	25452	25457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011561	GTT	2	6	25469	25474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011561	TTC	2	6	25484	25489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011561	CTT	2	6	25546	25551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011561	TCT	2	6	25605	25610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011561	TAA	2	6	25723	25728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011561	TAA	2	6	26480	26485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011561	TCT	2	6	26593	26598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011561	CTT	3	9	26603	26611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011561	AAC	2	6	26685	26690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011561	ATT	2	6	27063	27068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011561	ATT	2	6	27120	27125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011561	TAA	2	6	27128	27133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011561	TTA	2	6	27197	27202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011561	AGT	2	6	29196	29201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011561	ATT	2	6	29400	29405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011561	TGT	3	9	29472	29480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011561	CAT	2	6	29551	29556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011561	AGA	2	6	29677	29682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011561	ATG	2	6	29790	29795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011561	AAG	2	6	29857	29862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011561	TCG	2	6	29869	29874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011561	CTT	2	6	29883	29888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011561	TGA	2	6	29970	29975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011561	CAT	2	6	30041	30046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011561	TTC	2	6	30056	30061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011561	TCT	2	6	30108	30113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011561	CAT	2	6	31407	31412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011561	AGA	2	6	31422	31427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011561	TAC	2	6	31559	31564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011561	ATT	2	6	31615	31620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011561	CAA	2	6	32498	32503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011561	TCA	2	6	33123	33128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011561	TCT	2	6	33166	33171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011561	ACA	2	6	33352	33357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_011561	CAT	2	6	33687	33692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_011561	TTA	2	6	36891	36896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.