MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011528	ATTGTT	2	12	833900	833911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011528	TG	3	6	833955	833960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011528	CGG	2	6	833975	833980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_011528	ATT	2	6	834031	834036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011528	GAA	2	6	834084	834089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011528	AT	3	6	834098	834103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011528	ATTT	2	8	834128	834135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011528	T	7	7	834133	834139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011528	TAT	2	6	834159	834164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011528	GAA	2	6	834270	834275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_011528	AGA	2	6	834296	834301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011528	A	6	6	834317	834322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011528	CGG	2	6	834395	834400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_011528	ATG	2	6	834415	834420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011528	GAT	2	6	834439	834444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011528	ATC	2	6	834454	834459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_011528	TTCTT	2	10	834506	834515	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4018	NC_011528	A	7	7	834520	834526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011528	TAA	2	6	834530	834535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011528	GAT	2	6	834628	834633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011528	GGGCT	2	10	834635	834644	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4022	NC_011528	GGC	2	6	834682	834687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_011528	GGC	2	6	834772	834777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_011528	GCG	2	6	834792	834797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_011528	GTTATC	2	12	834813	834824	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4026	NC_011528	CGG	2	6	834846	834851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_011528	GATG	2	8	834852	834859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011528	CGG	2	6	834891	834896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_011528	TTAT	2	8	834913	834920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011528	TTA	2	6	834926	834931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011528	CTAT	2	8	834975	834982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_011528	A	6	6	835009	835014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011528	TTA	2	6	835031	835036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011528	TAA	2	6	835061	835066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011528	TAT	2	6	835073	835078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011528	ATTT	2	8	835091	835098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011528	CTTT	2	8	835124	835131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_011528	CAG	2	6	835136	835141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_011528	CGT	2	6	835314	835319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_011528	A	6	6	835396	835401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011528	CAT	2	6	835448	835453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_011528	ACTG	2	8	835454	835461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_011528	GAA	2	6	835481	835486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011528	T	7	7	835488	835494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011528	CTT	2	6	835511	835516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_011528	T	6	6	835535	835540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011528	AGA	2	6	835552	835557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011528	AAT	2	6	835571	835576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011528	ATCAA	2	10	835586	835595	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4050	NC_011528	ATT	2	6	835621	835626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011528	T	6	6	835625	835630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_011528	TGA	2	6	835682	835687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011528	TGA	2	6	835709	835714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011528	TTG	2	6	836221	836226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011528	GAG	2	6	836262	836267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011528	AAT	2	6	836269	836274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011528	CTC	2	6	836329	836334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_011528	A	6	6	836335	836340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_011528	TAA	2	6	836387	836392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_011528	GAA	2	6	836411	836416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_011528	GAA	2	6	836450	836455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011528	GTC	2	6	836494	836499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_011528	A	6	6	836540	836545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011528	TCAA	2	8	836649	836656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_011528	CGAG	2	8	836684	836691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_011528	GAA	2	6	836705	836710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011528	A	6	6	836742	836747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011528	ATC	2	6	836796	836801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_011528	T	7	7	836873	836879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011528	CCA	2	6	836898	836903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_011528	ATT	2	6	836973	836978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_011528	A	6	6	837051	837056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011528	TGA	2	6	837075	837080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011528	ATT	2	6	837109	837114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_011528	ACG	2	6	837282	837287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_011528	AGTT	2	8	837471	837478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_011528	T	6	6	837480	837485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011528	GAA	2	6	837492	837497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011528	TAG	2	6	837502	837507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011528	GTTT	2	8	837555	837562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_011528	CA	3	6	837578	837583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_011528	CAA	2	6	837593	837598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_011528	CAA	2	6	837603	837608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_011528	GCT	2	6	837669	837674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4088	NC_011528	AT	3	6	837725	837730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011528	ACA	2	6	837844	837849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_011528	ATTT	2	8	837858	837865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_011528	A	6	6	837929	837934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_011528	AGG	2	6	837977	837982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011528	GAC	2	6	837990	837995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4096	NC_011528	TGCG	2	8	838158	838165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4099	NC_011528	AATT	2	8	838368	838375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_011528	ATT	2	6	838396	838401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011528	ATT	2	6	838436	838441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_011528	AT	3	6	838446	838451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011528	AAG	2	6	838466	838471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011528	AGC	2	6	838498	838503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_011528	T	7	7	838516	838522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_011528	A	6	6	838525	838530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011528	AAGCG	2	10	838553	838562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4108	NC_011528	TGG	2	6	838650	838655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_011528	AAT	2	6	838684	838689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011528	ATTGTT	2	12	838699	838710	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_011528	AGC	2	6	838724	838729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_011528	AAG	3	9	838743	838751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011528	TAG	2	6	838764	838769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4115	NC_011528	AG	3	6	838814	838819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011528	AAT	2	6	839859	839864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011528	A	6	6	839884	839889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011528	TAA	2	6	839922	839927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011528	GATT	2	8	839978	839985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011528	AAAT	2	8	839988	839995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011528	T	7	7	840032	840038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011528	A	7	7	840066	840072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011528	ATT	2	6	840206	840211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011528	T	6	6	840262	840267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011528	ATC	2	6	840268	840273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_011528	TAT	2	6	840324	840329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011528	TTTAAT	2	12	840370	840381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_011528	TAG	2	6	840446	840451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_011528	TGG	2	6	840558	840563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_011528	GCC	2	6	840631	840636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_011528	TTCT	2	8	841143	841150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_011528	GAAT	2	8	844568	844575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011528	ATCA	2	8	844596	844603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4134	NC_011528	AGGG	2	8	844618	844625	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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