MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011528	TTA	2	6	532180	532185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_011528	A	7	7	532193	532199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_011528	AGT	2	6	532224	532229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_011528	TC	3	6	532260	532265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_011528	GCA	2	6	532302	532307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_011528	AGG	3	9	532351	532359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_011528	AAG	2	6	532367	532372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011528	AAG	2	6	541874	541879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011528	ATG	2	6	541892	541897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_011528	GA	3	6	541898	541903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_011528	ATCC	2	8	546896	546903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_011528	GTC	2	6	546914	546919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_011528	TCATT	2	10	547072	547081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2514	NC_011528	TATAA	2	10	547090	547099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_011528	TCG	2	6	547135	547140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_011528	T	6	6	547224	547229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_011528	T	6	6	547231	547236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_011528	AGGTA	2	10	547238	547247	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_011528	A	6	6	551654	551659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011528	TCGCT	2	10	551676	551685	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2521	NC_011528	CG	3	6	551711	551716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_011528	TTTG	2	8	553005	553012	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_011528	ACCT	2	8	553391	553398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_011528	C	6	6	553408	553413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2525	NC_011528	CAA	2	6	553444	553449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_011528	C	7	7	554960	554966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2527	NC_011528	T	6	6	554987	554992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011528	A	7	7	555010	555016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011528	TCC	2	6	555022	555027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_011528	GC	3	6	555034	555039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_011528	TCGCT	2	10	555814	555823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2532	NC_011528	TGTC	2	8	557282	557289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2533	NC_011528	ACG	2	6	557312	557317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_011528	AGC	2	6	560430	560435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_011528	TAAT	2	8	562872	562879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_011528	TGC	2	6	562999	563004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_011528	CGT	2	6	563669	563674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_011528	TAC	2	6	564704	564709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_011528	AGCGA	2	10	565631	565640	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2540	NC_011528	GAC	2	6	565656	565661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_011528	ATT	2	6	565662	565667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_011528	TCGCT	2	10	565681	565690	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2543	NC_011528	TAA	2	6	565741	565746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_011528	CAA	2	6	565825	565830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_011528	GATC	2	8	565833	565840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2546	NC_011528	GCA	2	6	565848	565853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_011528	TTC	2	6	565876	565881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_011528	T	7	7	566005	566011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_011528	CCT	2	6	566041	566046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_011528	GAT	2	6	566053	566058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2552	NC_011528	GGA	2	6	566111	566116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_011528	AAT	2	6	566138	566143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_011528	AAGAA	2	10	566193	566202	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_011528	ATA	2	6	566242	566247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_011528	CAT	2	6	566259	566264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_011528	TCA	2	6	566275	566280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_011528	CGA	2	6	566297	566302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_011528	AAT	2	6	566815	566820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_011528	TG	3	6	567268	567273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_011528	TATTT	2	10	567330	567339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_011528	T	6	6	567373	567378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_011528	TCT	2	6	568892	568897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_011528	T	7	7	568960	568966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_011528	GTT	2	6	568974	568979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_011528	ATTTA	2	10	568982	568991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2569	NC_011528	A	8	8	569018	569025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_011528	ATC	2	6	569039	569044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2572	NC_011528	ATT	2	6	569115	569120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_011528	A	6	6	569148	569153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_011528	GAA	2	6	569209	569214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2577	NC_011528	ATT	2	6	569314	569319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_011528	A	6	6	569323	569328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2583	NC_011528	A	7	7	569474	569480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_011528	TTA	2	6	569481	569486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2586	NC_011528	CAT	2	6	569590	569595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2595	NC_011528	GC	3	6	570001	570006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2600	NC_011528	AT	3	6	570311	570316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_011528	TTA	2	6	570329	570334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_011528	TTAT	2	8	570366	570373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_011528	GCG	2	6	570388	570393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_011528	T	7	7	570471	570477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_011528	GCG	2	6	570525	570530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_011528	CAA	2	6	570538	570543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2609	NC_011528	GCG	2	6	570602	570607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_011528	AAAG	2	8	570619	570626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_011528	GAA	3	9	570706	570714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2613	NC_011528	GTTG	2	8	570803	570810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_011528	TAT	2	6	570828	570833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2619	NC_011528	TGC	2	6	571005	571010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2621	NC_011528	A	6	6	571103	571108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_011528	GAA	2	6	571192	571197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_011528	TCA	2	6	571201	571206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2625	NC_011528	A	6	6	571237	571242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_011528	AAG	2	6	571309	571314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_011528	ATT	2	6	571324	571329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2632	NC_011528	CCGC	2	8	571559	571566	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2633	NC_011528	A	6	6	571708	571713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_011528	TCC	2	6	571755	571760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2911	NC_011528	TCC	2	6	622673	622678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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