MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011528	ATT	2	6	261117	261122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011528	AAC	2	6	261160	261165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011528	AGA	2	6	261188	261193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011528	TTA	2	6	261250	261255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011528	GTTT	2	8	261292	261299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011528	CCT	2	6	261318	261323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_011528	T	6	6	261345	261350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011528	A	7	7	261417	261423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011528	GATGGT	2	12	261458	261469	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011528	ATA	2	6	261476	261481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011528	A	7	7	261481	261487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011528	CT	3	6	261494	261499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_011528	ATT	2	6	261507	261512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011528	AGA	2	6	261522	261527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011528	A	6	6	261527	261532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011528	TTC	2	6	261550	261555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_011528	AGG	2	6	261561	261566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011528	GCTG	2	8	261591	261598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_011528	A	6	6	261603	261608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011528	ATT	2	6	261686	261691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011528	AC	3	6	261697	261702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_011528	TCA	2	6	261709	261714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011528	AAAG	2	8	261715	261722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011528	GCGG	2	8	261805	261812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_011528	CGA	2	6	261921	261926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011528	A	8	8	261962	261969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011528	TTA	2	6	261978	261983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011528	TTA	2	6	261985	261990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011528	GAA	2	6	262039	262044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011528	TATTT	2	10	262085	262094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011528	A	7	7	262099	262105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011528	TGA	2	6	262113	262118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011528	GAAGA	2	10	262165	262174	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011528	ATCAAA	2	12	262202	262213	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1035	NC_011528	A	6	6	262211	262216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011528	ACG	2	6	262279	262284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011528	TGGG	2	8	262372	262379	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011528	TGA	2	6	262403	262408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011528	CAA	2	6	262439	262444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_011528	TGC	2	6	262496	262501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011528	A	6	6	262529	262534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011528	A	6	6	262549	262554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011528	CCG	2	6	262573	262578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_011528	A	7	7	262633	262639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011528	ATT	2	6	262650	262655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011528	ATT	2	6	262710	262715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011528	A	6	6	262732	262737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011528	CGG	2	6	262740	262745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011528	AGC	2	6	262791	262796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011528	TA	3	6	262829	262834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011528	TTAC	2	8	262890	262897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_011528	TAGC	2	8	262904	262911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_011528	AACCG	2	10	262938	262947	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1054	NC_011528	TGAT	2	8	263111	263118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011528	GTT	2	6	263226	263231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011528	ATG	2	6	263272	263277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011528	ATG	2	6	263338	263343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011528	TGT	2	6	263401	263406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011528	TCT	2	6	263417	263422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_011528	CGC	2	6	263423	263428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_011528	CCA	2	6	263458	263463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_011528	GCA	3	9	263471	263479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011528	TTA	2	6	263598	263603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011528	CAA	2	6	263658	263663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011528	CAA	2	6	263760	263765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_011528	AGC	2	6	263767	263772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011528	TAT	2	6	263775	263780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011528	GGCTT	2	10	264027	264036	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1069	NC_011528	GAT	2	6	264059	264064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011528	ATTTT	2	10	264077	264086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011528	GAA	2	6	267575	267580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011528	AG	3	6	267991	267996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011528	A	8	8	269683	269690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011528	T	6	6	269707	269712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011528	GAAGC	2	10	272705	272714	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1076	NC_011528	AAG	2	6	272729	272734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011528	GCG	2	6	274237	274242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011528	TTAA	2	8	274428	274435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011528	GAC	3	9	274492	274500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_011528	GAC	2	6	274514	274519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011528	TTAT	2	8	274529	274536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011528	A	6	6	274542	274547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011528	TCT	2	6	274593	274598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011528	TGA	2	6	274832	274837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011528	AAAG	2	8	274838	274845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011528	CCA	2	6	274885	274890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_011528	TGA	2	6	274900	274905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011528	TCATT	2	10	276158	276167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1089	NC_011528	TTC	2	6	276221	276226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011528	GCA	2	6	276233	276238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011528	GGA	2	6	276251	276256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011528	GC	3	6	276303	276308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_011528	GCC	2	6	276322	276327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_011528	GTC	2	6	276328	276333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_011528	CTCTC	2	10	276653	276662	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1096	NC_011528	TTAA	2	8	276890	276897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011528	GAC	2	6	276954	276959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_011528	GAC	2	6	276976	276981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_011528	TTAT	2	8	276991	276998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011528	A	6	6	277004	277009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011528	TCT	2	6	277055	277060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011528	T	6	6	277095	277100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011528	T	6	6	277115	277120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011528	T	6	6	277199	277204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011528	A	6	6	277221	277226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011528	TA	3	6	277227	277232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011528	TCC	2	6	278761	278766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_011528	T	6	6	278767	278772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011528	AG	3	6	278830	278835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011528	TAAA	2	8	279581	279588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011528	T	6	6	279620	279625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011528	GA	3	6	281764	281769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011528	CGG	2	6	281970	281975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011528	GAC	2	6	281988	281993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011528	ATC	2	6	283457	283462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011528	GAAG	2	8	283469	283476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011528	AGC	2	6	283500	283505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011528	GA	3	6	283689	283694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011528	TGT	2	6	283702	283707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011528	AGC	2	6	283738	283743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_011528	ATTTC	2	10	283751	283760	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_011528	TAAA	2	8	283878	283885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011528	A	6	6	283913	283918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011528	AGA	3	9	283954	283962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011528	TTG	2	6	284042	284047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011528	TAT	2	6	284079	284084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011528	ATGA	2	8	284099	284106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011528	TTG	2	6	284187	284192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011528	ATT	2	6	284219	284224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011528	ATC	2	6	284241	284246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011528	CAC	2	6	284269	284274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_011528	CGC	2	6	284346	284351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_011528	ATTT	2	8	284384	284391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011528	T	6	6	284401	284406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011528	CT	3	6	284433	284438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_011528	ATGT	2	8	284456	284463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011528	CGC	2	6	284499	284504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1411	NC_011528	GAC	2	6	306662	306667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_011528	CAC	2	6	306690	306695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_011528	TGG	2	6	306696	306701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_011528	A	6	6	307597	307602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_011528	TC	3	6	307618	307623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1416	NC_011528	GGA	2	6	309315	309320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_011528	GTGTT	2	10	309343	309352	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_011528	TTC	2	6	309358	309363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_011528	GAC	2	6	310903	310908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1422	NC_011528	AGCGA	2	10	312032	312041	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1423	NC_011528	TCGCT	2	10	312081	312090	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1424	NC_011528	CCG	2	6	312139	312144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1426	NC_011528	A	6	6	312231	312236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_011528	GAA	2	6	312368	312373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_011528	T	6	6	312483	312488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_011528	ATG	2	6	312536	312541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_011528	GGC	2	6	312544	312549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_011528	GGC	2	6	312604	312609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_011528	CGA	2	6	312622	312627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_011528	ATG	2	6	312642	312647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_011528	A	6	6	312782	312787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_011528	ATATC	2	10	312879	312888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1439	NC_011528	TAC	2	6	313048	313053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1443	NC_011528	CCG	2	6	313152	313157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1444	NC_011528	A	6	6	313163	313168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_011528	A	6	6	313215	313220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_011528	A	7	7	313261	313267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_011528	TTC	2	6	313271	313276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1448	NC_011528	TA	3	6	313354	313359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_011528	TTA	2	6	313460	313465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_011528	GAA	2	6	313471	313476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_011528	TAAT	2	8	313517	313524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_011528	GCA	2	6	313534	313539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1455	NC_011528	AG	3	6	313598	313603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_011528	GATT	2	8	313611	313618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_011528	T	6	6	313635	313640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1464	NC_011528	CTAT	2	8	313886	313893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1483	NC_011528	AAGG	2	8	314933	314940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1484	NC_011528	GAAA	2	8	314941	314948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1485	NC_011528	GAG	2	6	315056	315061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1487	NC_011528	ATA	2	6	315213	315218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1488	NC_011528	TCAT	2	8	315237	315244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1489	NC_011528	A	6	6	315263	315268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1490	NC_011528	GTTTCT	2	12	315337	315348	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1492	NC_011528	GT	3	6	315534	315539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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