MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011528	TCGCT	2	10	1996177	1996186	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10002	NC_011528	CTT	2	6	1996201	1996206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_011528	A	6	6	1996217	1996222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_011528	GAC	2	6	1997419	1997424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_011528	T	8	8	1997431	1997438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_011528	A	6	6	1997454	1997459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_011528	ACG	2	6	1997525	1997530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_011528	T	6	6	1997555	1997560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_011528	CAAT	2	8	1997734	1997741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10010	NC_011528	GAAA	2	8	1997744	1997751	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_011528	TAA	2	6	1997825	1997830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_011528	ACC	3	9	1997857	1997865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_011528	C	11	11	1997864	1997874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10014	NC_011528	GATGA	2	10	1997938	1997947	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_011528	T	7	7	1998126	1998132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_011528	TGA	2	6	1998512	1998517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_011528	GA	3	6	1998516	1998521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_011528	TTG	2	6	1998538	1998543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_011528	ATTAT	2	10	1998548	1998557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_011528	CT	3	6	1998583	1998588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_011528	ATT	2	6	1998600	1998605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_011528	CTT	2	6	1998615	1998620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_011528	TCT	3	9	1998706	1998714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_011528	A	6	6	1998720	1998725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_011528	GTT	4	12	1998737	1998748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_011528	T	6	6	1998747	1998752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_011528	ATC	2	6	1998777	1998782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_011528	T	6	6	1998810	1998815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_011528	ATG	2	6	1998837	1998842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_011528	TCG	2	6	1998858	1998863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_011528	T	7	7	1998951	1998957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_011528	ACA	2	6	1998988	1998993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_011528	GTT	2	6	1999113	1999118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_011528	T	6	6	1999171	1999176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_011528	GGT	2	6	1999179	1999184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_011528	TCA	2	6	1999321	1999326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_011528	G	6	6	1999350	1999355	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_011528	GGC	2	6	1999366	1999371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_011528	TCAA	2	8	1999372	1999379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10040	NC_011528	AAG	2	6	1999401	1999406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_011528	T	7	7	1999408	1999414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_011528	TCA	3	9	1999416	1999424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_011528	GGC	2	6	1999450	1999455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_011528	GCC	2	6	1999459	1999464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_011528	CCT	2	6	2000111	2000116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_011528	A	6	6	2000153	2000158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_011528	T	6	6	2000178	2000183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_011528	TTTA	2	8	2002762	2002769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_011528	CAA	2	6	2002781	2002786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_011528	AATTAC	2	12	2002791	2002802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10051	NC_011528	AATT	2	8	2002821	2002828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_011528	TC	3	6	2002830	2002835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_011528	A	6	6	2002860	2002865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_011528	T	7	7	2002885	2002891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_011528	GTTAC	2	10	2002912	2002921	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10056	NC_011528	GAT	2	6	2002931	2002936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_011528	T	6	6	2002943	2002948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_011528	TTA	2	6	2003049	2003054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_011528	A	6	6	2003109	2003114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_011528	TTA	2	6	2003156	2003161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_011528	AAT	2	6	2003189	2003194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_011528	T	6	6	2003218	2003223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_011528	CGT	2	6	2003284	2003289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_011528	CAC	2	6	2003300	2003305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_011528	GGA	2	6	2003341	2003346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_011528	A	7	7	2003353	2003359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_011528	GAAAA	2	10	2003387	2003396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_011528	AAC	2	6	2003420	2003425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_011528	A	7	7	2003477	2003483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_011528	T	6	6	2003525	2003530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_011528	CGA	2	6	2003542	2003547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10073	NC_011528	AAG	2	6	2003589	2003594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_011528	CGA	2	6	2003719	2003724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_011528	AATC	2	8	2003754	2003761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10076	NC_011528	CTT	2	6	2003785	2003790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_011528	T	6	6	2003828	2003833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_011528	TAA	2	6	2003859	2003864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_011528	GGGA	2	8	2003897	2003904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_011528	ACTC	2	8	2003916	2003923	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10081	NC_011528	AAT	2	6	2005134	2005139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_011528	ATT	2	6	2005165	2005170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_011528	ATC	2	6	2005374	2005379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_011528	TTC	2	6	2005439	2005444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_011528	ATT	2	6	2005449	2005454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_011528	TTCT	2	8	2005460	2005467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10087	NC_011528	GTG	2	6	2005470	2005475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_011528	TTA	2	6	2005520	2005525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_011528	TCGC	2	8	2005534	2005541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_011528	AT	3	6	2005594	2005599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_011528	TCG	2	6	2005616	2005621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_011528	GC	4	8	2005691	2005698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_011528	ATT	2	6	2005734	2005739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_011528	AAG	2	6	2005766	2005771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_011528	TGA	2	6	2005797	2005802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_011528	T	6	6	2005936	2005941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_011528	TTC	2	6	2005945	2005950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_011528	AC	3	6	2005998	2006003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_011528	GACG	2	8	2006008	2006015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10100	NC_011528	T	6	6	2006039	2006044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_011528	CGT	2	6	2006092	2006097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10103	NC_011528	AAAT	2	8	2006130	2006137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_011528	TCA	2	6	2006142	2006147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_011528	TTA	2	6	2006275	2006280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_011528	TCG	2	6	2006304	2006309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10108	NC_011528	CGC	2	6	2006412	2006417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_011528	GAAAAA	2	12	2006464	2006475	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_011528	CTG	2	6	2006560	2006565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_011528	CA	3	6	2006584	2006589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_011528	CGA	2	6	2006591	2006596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_011528	A	6	6	2006619	2006624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_011528	AG	3	6	2006653	2006658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_011528	GCG	2	6	2006825	2006830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_011528	TGT	2	6	2006909	2006914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10118	NC_011528	AAG	2	6	2007108	2007113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_011528	AATGG	2	10	2007192	2007201	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_011528	ATG	2	6	2007272	2007277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_011528	CAA	2	6	2007332	2007337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_011528	TCG	3	9	2007354	2007362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_011528	A	6	6	2007365	2007370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_011528	GAA	2	6	2007437	2007442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_011528	CAA	2	6	2007512	2007517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_011528	CGT	2	6	2007528	2007533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10128	NC_011528	T	6	6	2007545	2007550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_011528	A	6	6	2007551	2007556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_011528	TA	3	6	2007629	2007634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10391	NC_011528	CAG	2	6	2047146	2047151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10392	NC_011528	CTA	2	6	2047257	2047262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10393	NC_011528	TAT	2	6	2047296	2047301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10394	NC_011528	ATT	2	6	2047307	2047312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10395	NC_011528	GAA	2	6	2047752	2047757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10396	NC_011528	GCG	2	6	2053000	2053005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10397	NC_011528	GGT	2	6	2053009	2053014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10398	NC_011528	TCAG	2	8	2053037	2053044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10399	NC_011528	CA	3	6	2053060	2053065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10400	NC_011528	A	7	7	2053117	2053123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10401	NC_011528	TGTA	2	8	2053124	2053131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10402	NC_011528	TTGAA	2	10	2053133	2053142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10403	NC_011528	GAA	2	6	2053171	2053176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10404	NC_011528	TA	3	6	2053247	2053252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10405	NC_011528	A	7	7	2053264	2053270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10406	NC_011528	GAA	2	6	2053289	2053294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10407	NC_011528	AGCA	2	8	2053296	2053303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10408	NC_011528	A	6	6	2053342	2053347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10409	NC_011528	A	6	6	2053352	2053357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10410	NC_011528	AGC	2	6	2053378	2053383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10411	NC_011528	TCT	2	6	2053561	2053566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10412	NC_011528	AAG	2	6	2053640	2053645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10413	NC_011528	AGCGA	2	10	2053662	2053671	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10414	NC_011528	TTAAA	2	10	2055023	2055032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10415	NC_011528	GCC	2	6	2055039	2055044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10417	NC_011528	AAT	2	6	2055522	2055527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10418	NC_011528	ATG	2	6	2055633	2055638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10419	NC_011528	TAT	2	6	2055666	2055671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10420	NC_011528	CGC	2	6	2057316	2057321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10421	NC_011528	T	7	7	2057340	2057346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10422	NC_011528	ATA	2	6	2063024	2063029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10423	NC_011528	CAGCG	2	10	2063039	2063048	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10424	NC_011528	CGCTG	2	10	2063082	2063091	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

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