MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011528	CGT	2	6	131194	131199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011528	G	7	7	131420	131426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011528	ATGGT	2	10	131673	131682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011528	TAT	2	6	131696	131701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011528	TTC	2	6	131714	131719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011528	TATT	2	8	131724	131731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011528	ATT	2	6	131743	131748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011528	AAT	2	6	132464	132469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011528	GTG	2	6	133370	133375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011528	ACG	2	6	133391	133396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011528	ATT	2	6	133506	133511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011528	T	7	7	133523	133529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011528	CAA	2	6	133538	133543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011528	A	6	6	133587	133592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011528	CAA	2	6	133705	133710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011528	CTA	2	6	133719	133724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011528	GAT	2	6	133759	133764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011528	TTGT	2	8	133828	133835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011528	CCG	2	6	133843	133848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_011528	TCC	2	6	133941	133946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_011528	CGC	2	6	133979	133984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_011528	ATT	2	6	133990	133995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011528	AAT	2	6	134047	134052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011528	AGA	2	6	134070	134075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011528	AAC	2	6	134087	134092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011528	TGT	2	6	134111	134116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011528	TTA	2	6	134148	134153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011528	CATT	2	8	134294	134301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_011528	CCT	2	6	134483	134488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_011528	CAAA	2	8	134495	134502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_011528	ATA	2	6	134506	134511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011528	ACGA	2	8	134579	134586	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_011528	A	6	6	134652	134657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011528	T	8	8	134680	134687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011528	ATTT	2	8	134707	134714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011528	TAAA	2	8	134737	134744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011528	GAG	2	6	134906	134911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011528	AGG	2	6	135310	135315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011528	CTT	2	6	135369	135374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011528	AGCA	2	8	135388	135395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_011528	TTA	2	6	135622	135627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011528	TCAT	2	8	135650	135657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_011528	AGTA	2	8	136350	136357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011528	CTG	2	6	136445	136450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_011528	GTT	2	6	136471	136476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011528	CAAG	2	8	140184	140191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_011528	ATT	2	6	140228	140233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011528	TGA	2	6	140282	140287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011528	ACGA	2	8	140564	140571	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_011528	ATT	2	6	140594	140599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011528	ACT	2	6	140666	140671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011528	ACG	2	6	140681	140686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011528	AT	3	6	140714	140719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011528	GAC	2	6	140755	140760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011528	T	7	7	140803	140809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011528	CGC	2	6	140867	140872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_011528	GC	3	6	140871	140876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_011528	CCT	2	6	140916	140921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_011528	CGAAA	2	10	144141	144150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
560	NC_011528	G	6	6	144154	144159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011528	AAT	2	6	144160	144165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011528	TGC	2	6	144189	144194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011528	TAT	2	6	148901	148906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011528	A	9	9	151770	151778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011528	GAA	2	6	151790	151795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011528	AAAATT	2	12	151805	151816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011528	A	7	7	151842	151848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011528	ATTA	2	8	151850	151857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011528	T	9	9	151861	151869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011528	T	6	6	151908	151913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011528	A	6	6	151914	151919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011528	TTAA	2	8	151924	151931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011528	T	6	6	151955	151960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011528	AATT	2	8	151963	151970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011528	AG	3	6	155151	155156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011528	A	6	6	155187	155192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011528	TGTC	2	8	155193	155200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_011528	GATA	2	8	155226	155233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011528	CT	3	6	155458	155463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_011528	CTT	2	6	156178	156183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011528	T	6	6	156189	156194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_011528	TA	3	6	156211	156216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011528	CAAA	2	8	156222	156229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_011528	AGT	2	6	156242	156247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011528	TTGG	2	8	156285	156292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011528	A	6	6	156312	156317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011528	GCA	2	6	161526	161531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_011528	AAT	4	12	161573	161584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011528	CTTC	2	8	161600	161607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_011528	AGACAT	2	12	161659	161670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
592	NC_011528	CAAG	2	8	161747	161754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_011528	CAAT	2	8	161756	161763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_011528	ATTTTT	2	12	161773	161784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011528	T	7	7	161780	161786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011528	CTC	2	6	161802	161807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_011528	ACCATT	3	18	161815	161832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_011528	T	6	6	164008	164013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011528	AG	3	6	164518	164523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011528	TCC	2	6	164551	164556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_011528	AAAC	2	8	168202	168209	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_011528	T	6	6	168238	168243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011528	CGT	2	6	168248	168253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011528	GC	3	6	168291	168296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_011528	GC	3	6	168302	168307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_011528	A	7	7	168338	168344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011528	AG	3	6	168412	168417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011528	TCAC	2	8	172325	172332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_011528	TGC	2	6	172335	172340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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611	NC_011528	ACA	2	6	172419	172424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011528	A	8	8	172482	172489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011528	GAT	2	6	172505	172510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011528	TAA	2	6	172518	172523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011528	A	7	7	172580	172586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011528	AATTT	2	10	172617	172626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011528	T	6	6	172642	172647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011528	T	6	6	172660	172665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011528	A	7	7	172666	172672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011528	ATA	2	6	175834	175839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011528	GAAGG	2	10	177394	177403	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011528	GCT	2	6	177551	177556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_011528	TTG	2	6	177589	177594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011528	TAT	2	6	177599	177604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011528	GCTTGC	2	12	177605	177616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011528	TTA	2	6	177619	177624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011528	TAT	2	6	177632	177637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011528	CGC	2	6	177650	177655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_011528	CAT	2	6	177674	177679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011528	TTTA	2	8	177799	177806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011528	TTA	2	6	177817	177822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011528	AAG	2	6	177844	177849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011528	TGC	3	9	177865	177873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011528	ATT	2	6	177912	177917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011528	TTA	2	6	177921	177926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011528	AAC	2	6	177950	177955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_011528	A	6	6	178053	178058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011528	TAC	2	6	180357	180362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011528	TAA	2	6	180526	180531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_011528	GA	4	8	180583	180590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_011528	T	8	8	180654	180661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_011528	T	6	6	181571	181576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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955	NC_011528	A	7	7	248906	248912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
956	NC_011528	AAT	2	6	248971	248976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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