MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011528	ACC	2	6	988421	988426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_011528	A	6	6	988835	988840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011528	ATA	2	6	988845	988850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011528	TAA	2	6	988883	988888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011528	CAT	2	6	988912	988917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_011528	ATAA	2	8	989386	989393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011528	ATC	2	6	989416	989421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_011528	CTC	2	6	989422	989427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_011528	AAT	2	6	989511	989516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011528	TCGTA	2	10	989525	989534	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5012	NC_011528	ATC	2	6	989535	989540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_011528	TA	3	6	989564	989569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011528	AAAT	2	8	989594	989601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_011528	TCCC	2	8	989645	989652	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5016	NC_011528	CTTT	2	8	989668	989675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_011528	TCC	2	6	989680	989685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_011528	TAT	2	6	989735	989740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011528	ACGCT	2	10	989756	989765	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5020	NC_011528	AT	3	6	989801	989806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011528	A	6	6	989880	989885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_011528	AAT	2	6	989947	989952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011528	T	7	7	989973	989979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011528	GAG	2	6	989984	989989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011528	GTT	2	6	989992	989997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011528	CAA	2	6	990020	990025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_011528	CAA	2	6	990110	990115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_011528	GAGC	2	8	990187	990194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5030	NC_011528	TGGAG	2	10	990358	990367	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011528	A	7	7	990399	990405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011528	GTTT	2	8	990577	990584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011528	TTC	3	9	990585	990593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_011528	TTC	2	6	990612	990617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5036	NC_011528	AGG	2	6	990708	990713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011528	ATT	2	6	990753	990758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011528	GTTT	2	8	990771	990778	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_011528	AG	3	6	990802	990807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011528	CGT	2	6	990846	990851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_011528	CTG	2	6	990868	990873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_011528	GGA	2	6	990911	990916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_011528	GAA	2	6	991183	991188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011528	AAGC	2	8	992649	992656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_011528	GTTT	3	12	992695	992706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_011528	TAA	2	6	992728	992733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_011528	TAA	2	6	992764	992769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011528	TAAT	2	8	992785	992792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5052	NC_011528	ACC	2	6	992831	992836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_011528	ATT	2	6	992849	992854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011528	CAA	2	6	992871	992876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_011528	AAT	2	6	992884	992889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011528	CAA	2	6	992931	992936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_011528	CTA	2	6	992949	992954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5059	NC_011528	TAA	2	6	993001	993006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011528	AGA	2	6	993008	993013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5062	NC_011528	GGA	2	6	993065	993070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011528	A	6	6	993072	993077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011528	TCT	2	6	993086	993091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_011528	ACA	2	6	993094	993099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_011528	TTC	2	6	993121	993126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_011528	TAA	2	6	993132	993137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011528	T	7	7	993145	993151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011528	CTT	2	6	993158	993163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5079	NC_011528	ATG	2	6	993417	993422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5084	NC_011528	ATTA	2	8	993692	993699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_011528	GTA	2	6	994030	994035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_011528	CCTTC	2	10	997956	997965	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5100	NC_011528	CAA	2	6	998358	998363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_011528	CTC	2	6	998379	998384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_011528	AAT	2	6	999174	999179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011528	GAGG	2	8	1001107	1001114	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011528	GGA	2	6	1001128	1001133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_011528	ATCA	2	8	1001196	1001203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_011528	TA	3	6	1001281	1001286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011528	GAG	2	6	1001294	1001299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_011528	GCCTA	2	10	1001303	1001312	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5109	NC_011528	GAT	2	6	1001374	1001379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5114	NC_011528	CTTT	2	8	1002891	1002898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_011528	TCA	2	6	1002899	1002904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_011528	TTG	2	6	1002912	1002917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011528	ACA	2	6	1002918	1002923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_011528	GGGT	2	8	1002925	1002932	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011528	GAC	2	6	1002972	1002977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_011528	TTG	2	6	1003020	1003025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011528	TTG	2	6	1003267	1003272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011528	AGA	2	6	1003278	1003283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011528	TTGT	2	8	1003293	1003300	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011528	ATA	2	6	1003310	1003315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011528	ACTA	2	8	1003326	1003333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_011528	A	6	6	1003339	1003344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011528	CTT	2	6	1005264	1005269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_011528	T	6	6	1005268	1005273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_011528	T	6	6	1007281	1007286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_011528	ACGC	2	8	1009655	1009662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_011528	TGA	2	6	1009686	1009691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_011528	TAT	2	6	1009711	1009716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_011528	GCT	2	6	1010729	1010734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_011528	CTA	2	6	1012189	1012194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_011528	CAT	2	6	1012202	1012207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_011528	TTA	2	6	1012215	1012220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_011528	T	6	6	1012497	1012502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_011528	CTC	2	6	1014821	1014826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5139	NC_011528	GTT	2	6	1014833	1014838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5145	NC_011528	CAA	2	6	1020963	1020968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5252	NC_011528	A	9	9	1031026	1031034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_011528	ATG	2	6	1033704	1033709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_011528	TCGCT	2	10	1033730	1033739	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5265	NC_011528	GGC	2	6	1033771	1033776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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