MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 10019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011527	ACG	2	6	826606	826611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_011527	TTA	2	6	826612	826617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011527	CGT	2	6	826627	826632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_011527	AGT	2	6	826637	826642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011527	CTT	2	6	826669	826674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_011527	CGC	2	6	826735	826740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_011527	AACG	2	8	826767	826774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_011527	GCCG	2	8	826790	826797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_011527	TTG	2	6	826832	826837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011527	GCA	2	6	826891	826896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_011527	CGC	2	6	826907	826912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_011527	T	6	6	826953	826958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011527	CCTT	5	20	826959	826978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_011527	TAA	2	6	826979	826984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011527	AAT	2	6	827018	827023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011527	TAA	2	6	827039	827044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011527	TGT	2	6	827118	827123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011527	AGCC	2	8	827146	827153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_011527	ATAAGT	2	12	827201	827212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011527	CG	3	6	827247	827252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_011527	GTTG	2	8	827266	827273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011527	ACC	2	6	827279	827284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_011527	A	6	6	827332	827337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011527	CCA	2	6	827358	827363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_011527	ATA	2	6	827373	827378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011527	GTT	2	6	827386	827391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011527	CTT	2	6	827422	827427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_011527	CCA	2	6	827452	827457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_011527	TAA	2	6	827600	827605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011527	CAAAT	2	10	827671	827680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4031	NC_011527	GAT	2	6	827733	827738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011527	T	6	6	827752	827757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011527	ATT	2	6	827782	827787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011527	TG	3	6	827793	827798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011527	TAA	2	6	827809	827814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011527	A	7	7	827828	827834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011527	GAC	2	6	827889	827894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_011527	TGT	2	6	827903	827908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_011527	T	6	6	828044	828049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011527	TAA	2	6	828060	828065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011527	CTT	2	6	828085	828090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_011527	AATTG	2	10	828146	828155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011527	T	6	6	828285	828290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011527	CGT	2	6	828315	828320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_011527	TTA	2	6	828341	828346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011527	GA	3	6	828350	828355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011527	ATG	2	6	828372	828377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011527	GAT	2	6	828387	828392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011527	A	6	6	828485	828490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_011527	TAT	2	6	828546	828551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011527	TTTTGA	2	12	828562	828573	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_011527	TTGC	2	8	828617	828624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_011527	TA	3	6	829464	829469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011527	GCGA	2	8	829500	829507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_011527	CTT	2	6	829515	829520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_011527	TCA	2	6	829539	829544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_011527	AAT	2	6	829570	829575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011527	CTTT	2	8	829592	829599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_011527	T	6	6	829624	829629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_011527	AAT	2	6	829671	829676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_011527	ATA	2	6	829705	829710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011527	T	9	9	829711	829719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011527	ATT	2	6	829720	829725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011527	AATT	2	8	829758	829765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011527	TAA	2	6	829840	829845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011527	GT	3	6	829873	829878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011527	GGT	2	6	829918	829923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011527	TAAT	2	8	829953	829960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011527	CGTT	2	8	830006	830013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_011527	A	6	6	830015	830020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_011527	CTT	2	6	830028	830033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_011527	A	6	6	830069	830074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011527	CG	3	6	830101	830106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_011527	CGC	2	6	830189	830194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_011527	CGA	2	6	830201	830206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_011527	TAA	2	6	830348	830353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_011527	T	8	8	830394	830401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_011527	AGT	2	6	830421	830426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011527	ATT	2	6	830440	830445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011527	CAG	2	6	830464	830469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_011527	TCT	2	6	830489	830494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_011527	ATTA	2	8	830531	830538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_011527	CGA	2	6	830683	830688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_011527	T	7	7	830728	830734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011527	TCG	2	6	830748	830753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_011527	GTC	2	6	830763	830768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_011527	TCA	2	6	830787	830792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_011527	GAG	2	6	830866	830871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_011527	T	6	6	830876	830881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_011527	GAC	2	6	830914	830919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_011527	AAT	2	6	830936	830941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011527	AAT	2	6	831010	831015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_011527	ATT	2	6	831066	831071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_011527	TCC	2	6	831085	831090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_011527	GGC	2	6	831106	831111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_011527	CG	3	6	831187	831192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_011527	TCG	2	6	831219	831224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_011527	AAT	3	9	831229	831237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_011527	TCG	2	6	831254	831259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_011527	CGA	2	6	831296	831301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_011527	T	6	6	831404	831409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011527	GCGA	2	8	831523	831530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_011527	TTTC	2	8	831558	831565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_011527	TTA	2	6	831573	831578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_011527	T	6	6	831675	831680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011527	TAAA	2	8	831718	831725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_011527	T	7	7	831748	831754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_011527	T	6	6	831793	831798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011527	T	7	7	831867	831873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_011527	TCG	2	6	831942	831947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_011527	GGGC	2	8	831956	831963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_011527	ATT	2	6	831972	831977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011527	CAA	2	6	832040	832045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_011527	ATT	2	6	832062	832067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011527	T	6	6	832124	832129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011527	TG	3	6	832137	832142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011527	TGC	2	6	832197	832202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_011527	ATGG	2	8	832220	832227	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011527	TTG	2	6	832245	832250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011527	GAT	2	6	832265	832270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011527	T	6	6	832303	832308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011527	A	7	7	832309	832315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011527	GAT	2	6	832338	832343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011527	TGA	2	6	832483	832488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011527	GGC	2	6	832509	832514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_011527	AC	3	6	832555	832560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_011527	AATA	2	8	834075	834082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_011527	A	7	7	834093	834099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_011527	ATT	2	6	834109	834114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011527	AAT	2	6	834152	834157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011527	AAT	2	6	838826	838831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011527	TTA	2	6	838848	838853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_011527	AGC	2	6	838875	838880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4136	NC_011527	ATG	2	6	838992	838997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4412	NC_011527	AGG	2	6	890501	890506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4415	NC_011527	T	7	7	890631	890637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4432	NC_011527	TA	3	6	891310	891315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4452	NC_011527	GGA	2	6	904036	904041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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