MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 10019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011527	TCTT	2	8	219859	219866	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_011527	AAT	2	6	219916	219921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011527	T	7	7	219921	219927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011527	CTT	2	6	219989	219994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011527	CAA	2	6	220025	220030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_011527	AATA	2	8	220051	220058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011527	TAA	2	6	220152	220157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011527	AAT	2	6	220308	220313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011527	ATC	2	6	220351	220356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011527	GTT	2	6	220516	220521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011527	CAG	2	6	220562	220567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011527	T	6	6	220629	220634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011527	AAAT	2	8	220642	220649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011527	TAA	2	6	220728	220733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011527	GTT	2	6	220757	220762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011527	CCA	2	6	220790	220795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_011527	TAA	2	6	220859	220864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011527	TGT	2	6	220877	220882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011527	GTC	2	6	220944	220949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011527	ATC	2	6	220998	221003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011527	ACC	2	6	221018	221023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_011527	TGA	2	6	221031	221036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011527	TAA	2	6	221084	221089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011527	T	6	6	221124	221129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011527	TCAT	2	8	221136	221143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_011527	TTG	2	6	221144	221149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011527	TCGT	2	8	221230	221237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_011527	CACC	2	8	221357	221364	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1029	NC_011527	GAT	2	6	221447	221452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011527	ATTTT	2	10	221476	221485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011527	AGCGA	2	10	221530	221539	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_011527	G	6	6	221545	221550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011527	AAT	2	6	221551	221556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011527	TCGCT	2	10	221574	221583	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1035	NC_011527	AAAT	2	8	221656	221663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011527	ACA	2	6	221691	221696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011527	AAC	2	6	221705	221710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_011527	CCA	2	6	221713	221718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_011527	CA	3	6	221717	221722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_011527	CGT	2	6	221779	221784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011527	CAACGC	2	12	221790	221801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_011527	GC	3	6	221835	221840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_011527	ACC	2	6	221852	221857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_011527	AAC	2	6	221866	221871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011527	AAT	2	6	221902	221907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011527	CG	3	6	221933	221938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_011527	CAA	2	6	221943	221948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011527	GTA	2	6	221982	221987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011527	TAA	2	6	222037	222042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011527	GT	3	6	222085	222090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011527	CAA	2	6	222130	222135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011527	TA	3	6	222162	222167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011527	ATA	2	6	222176	222181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011527	A	6	6	222199	222204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011527	AAG	2	6	222249	222254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011527	TAA	2	6	222268	222273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011527	TAAT	2	8	222344	222351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011527	ACCC	2	8	222368	222375	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1059	NC_011527	A	6	6	222488	222493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011527	A	7	7	222503	222509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011527	CA	3	6	222560	222565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011527	TGT	2	6	222669	222674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011527	TAA	2	6	222817	222822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011527	AAT	2	6	222826	222831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011527	AAC	2	6	222837	222842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_011527	CGG	2	6	222852	222857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011527	ATC	2	6	222860	222865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011527	A	7	7	222927	222933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011527	ATG	2	6	222946	222951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011527	TAA	2	6	222978	222983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011527	AATA	2	8	224146	224153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011527	TAA	2	6	224179	224184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011527	CTT	2	6	224211	224216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_011527	TGA	2	6	224303	224308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011527	TCT	2	6	224354	224359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_011527	T	6	6	224385	224390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011527	TTC	2	6	224425	224430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011527	AAT	2	6	224457	224462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011527	TTG	2	6	224463	224468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011527	AGCC	2	8	224549	224556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_011527	TCG	2	6	224684	224689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_011527	GCC	2	6	224692	224697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_011527	CGT	2	6	224709	224714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011527	CCA	2	6	224753	224758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_011527	TCG	2	6	224819	224824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_011527	GCG	2	6	224883	224888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011527	T	6	6	224980	224985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011527	GCC	2	6	225001	225006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_011527	A	6	6	225039	225044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011527	GTT	2	6	225059	225064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011527	AATT	2	8	225085	225092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011527	CTTT	2	8	225209	225216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_011527	TAA	2	6	225240	225245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011527	TTTG	2	8	225354	225361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011527	ATT	2	6	225367	225372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011527	A	7	7	225484	225490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011527	CGT	2	6	225587	225592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_011527	T	9	9	225627	225635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011527	AT	3	6	225668	225673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011527	TGAA	2	8	225697	225704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011527	GCC	2	6	225746	225751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_011527	CGA	2	6	225812	225817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011527	TAAA	2	8	225826	225833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011527	ATA	2	6	225877	225882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011527	TTGGAT	2	12	225930	225941	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011527	ATA	2	6	225970	225975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011527	TCG	2	6	226082	226087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011527	ACGT	2	8	226144	226151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_011527	CTT	2	6	226161	226166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011527	T	6	6	226165	226170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011527	AGGCC	2	10	226191	226200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1112	NC_011527	T	7	7	226245	226251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011527	TAT	2	6	226291	226296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011527	A	9	9	229163	229171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011527	GAA	2	6	229183	229188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011527	AAAATT	2	12	229198	229209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011527	A	7	7	229235	229241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011527	ATTA	2	8	229243	229250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011527	T	8	8	229254	229261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011527	A	8	8	229262	229269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011527	T	6	6	229303	229308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011527	A	6	6	229309	229314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011527	TTAA	2	8	229319	229326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011527	T	6	6	229350	229355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011527	AATT	2	8	229358	229365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011527	AG	3	6	232546	232551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011527	A	6	6	232582	232587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011527	TGTC	2	8	232588	232595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_011527	GATA	2	8	232621	232628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011527	CT	3	6	232857	232862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_011527	CTT	2	6	233576	233581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011527	T	6	6	233587	233592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011527	A	6	6	233602	233607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011527	TA	3	6	233609	233614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011527	CAAA	2	8	233620	233627	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_011527	AGT	2	6	233640	233645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011527	TTGG	2	8	233683	233690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_011527	A	6	6	233710	233715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_011527	CGG	2	6	307780	307785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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