MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	TAATTA	2	12	240	251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011047	TATAAA	2	12	1623	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011047	ATTTTT	2	12	6537	6548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011047	TTTTAA	2	12	6555	6566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011047	TTAAAA	2	12	8780	8791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011047	AATAAA	2	12	14019	14030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011047	TTAAAT	2	12	14414	14425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011047	CATTAT	2	12	18647	18658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011047	ATATTT	2	12	24811	24822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011047	ATCATT	2	12	27113	27124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011047	ATATTT	2	12	27976	27987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011047	AAACTT	2	12	28085	28096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011047	ATATTT	2	12	28417	28428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011047	TTTTCT	2	12	29653	29664	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011047	TTAATT	2	12	31615	31626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011047	AAAATT	2	12	37962	37973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011047	TAAAAA	2	12	46888	46899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011047	ATTTAA	2	12	55276	55287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011047	TAAAAA	2	12	55345	55356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011047	CAATAA	2	12	56711	56722	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011047	TTTTAT	2	12	60120	60131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011047	ATATTA	2	12	63507	63518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011047	ATTTTA	2	12	68958	68969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011047	CATAAA	2	12	69022	69033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011047	TAAAAA	2	12	69836	69847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011047	ATTAAA	2	12	70074	70085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011047	TCTTTT	2	12	74806	74817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011047	AAAATT	2	12	76801	76812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011047	TAATCT	2	12	80653	80664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011047	TAAAAA	2	12	93793	93804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011047	ATAAAT	2	12	104168	104179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011047	TAAAAA	2	12	108265	108276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011047	AAAAAT	2	12	113953	113964	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011047	TTAAAA	2	12	119254	119265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011047	TAAAAA	2	12	141240	141251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011047	TAAAAA	2	12	144714	144725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011047	ATTAAA	2	12	145325	145336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011047	ATTTCT	2	12	155071	155082	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011047	TATGAT	2	12	169601	169612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011047	AATTTA	2	12	176224	176235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011047	AATTTT	2	12	185739	185750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011047	ATTTTT	2	12	186147	186158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011047	ATAAAA	2	12	186207	186218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011047	AATCAA	2	12	194100	194111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011047	TTTATT	2	12	195126	195137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011047	TTAAAT	2	12	202004	202015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011047	AAAATT	2	12	208477	208488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011047	ATTTTT	2	12	213451	213462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011047	TTATAA	2	12	216136	216147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011047	ATTTTC	2	12	230077	230088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011047	TTTCAT	2	12	244968	244979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011047	AATTTC	2	12	247020	247031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011047	ATTTTT	2	12	262768	262779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011047	TGAAGT	2	12	266168	266179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011047	TAATTA	2	12	269698	269709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011047	AATTTT	2	12	269710	269721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011047	TATTAG	2	12	270018	270029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011047	ATTTTT	2	12	270162	270173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011047	ATTATA	2	12	277533	277544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011047	TATAAA	2	12	282571	282582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011047	AAAATG	2	12	283048	283059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011047	AAAAAT	2	12	285356	285367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011047	AAAGAA	2	12	286421	286432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011047	ATTTAT	2	12	293202	293213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011047	TTAATT	2	12	296698	296709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011047	AAATTA	2	12	297178	297189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011047	TTTAAT	2	12	297255	297266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011047	AATAAA	2	12	304195	304206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011047	TAAAAT	2	12	304757	304768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011047	TTAAAT	2	12	318326	318337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011047	ATTTAT	2	12	319433	319444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011047	TGTTAA	2	12	321124	321135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011047	TAAAAA	2	12	321492	321503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011047	AAATTT	2	12	322292	322303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011047	AGATGT	2	12	330210	330221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011047	TAAAAT	2	12	330284	330295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011047	ACATCT	2	12	330394	330405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011047	TTCTTT	2	12	330484	330495	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011047	ATTCAT	2	12	331527	331538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011047	ACTTTA	2	12	331603	331614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011047	TAATTT	2	12	337841	337852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011047	TGTTAT	2	12	342366	342377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011047	ATATTT	2	12	343236	343247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011047	TATATT	2	12	350073	350084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011047	ATTAAA	2	12	361988	361999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011047	TTTTAA	2	12	364011	364022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011047	TTTTAT	2	12	366572	366583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011047	AATTTT	2	12	366701	366712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011047	ATTTTT	2	12	373801	373812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011047	TAAAAA	2	12	387312	387323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011047	TTATAA	2	12	393903	393914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011047	ATTTTA	2	12	393933	393944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011047	TTTTAA	2	12	400229	400240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011047	TTTATT	2	12	402743	402754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011047	CTTTAA	2	12	411935	411946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011047	AAAATT	2	12	412781	412792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011047	CGCAAA	2	12	418724	418735	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011047	AAAATT	2	12	443462	443473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011047	TATTTT	2	12	446038	446049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011047	AAATAT	2	12	447843	447854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011047	TATTTA	2	12	447873	447884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011047	ATTTTT	2	12	450106	450117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011047	TGAAGT	2	12	452409	452420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011047	ATTAAA	2	12	457661	457672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011047	ATTTTT	2	12	463644	463655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011047	AATTTA	2	12	477279	477290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011047	TAATTT	2	12	477410	477421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011047	AATTTA	2	12	479338	479349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011047	TTAAAA	2	12	487431	487442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011047	TTAATT	2	12	490576	490587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011047	ATATTT	2	12	499705	499716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011047	TTAAAA	2	12	500279	500290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011047	AAAATA	2	12	506018	506029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011047	AAAATA	2	12	506171	506182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011047	CCAAAA	2	12	506760	506771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011047	ATTTTA	2	12	507746	507757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011047	TTTTAA	2	12	511532	511543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011047	ATTTTT	2	12	512380	512391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011047	TTTAAA	2	12	512918	512929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011047	TATTTG	2	12	518730	518741	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011047	GAACAT	2	12	538610	538621	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011047	GAACAT	2	12	538625	538636	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011047	GAACAT	2	12	538640	538651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011047	GAACAT	2	12	538655	538666	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_011047	GAACAT	2	12	538670	538681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_011047	GAACAT	2	12	538685	538696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011047	GAACAT	2	12	538700	538711	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011047	GAACAT	2	12	538715	538726	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_011047	GAACAT	2	12	538730	538741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_011047	GAACAT	2	12	538745	538756	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_011047	GATAAA	2	12	544475	544486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011047	TAAAAT	2	12	545571	545582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011047	ATTTTA	2	12	547722	547733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011047	ATAAAA	2	12	550698	550709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.