MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 1327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011026	CTTT	2	8	1520	1527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011026	AATG	2	8	3040	3047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011026	CAAA	2	8	3120	3127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011026	TACC	2	8	7111	7118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011026	CATC	2	8	10913	10920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011026	CCTG	2	8	13707	13714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011026	TTCA	2	8	14729	14736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011026	GTTC	2	8	20022	20029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011026	TAAC	2	8	20047	20054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011026	ATTT	2	8	27837	27844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011026	ATTG	2	8	38822	38829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011026	TGTA	2	8	38869	38876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011026	TTTC	2	8	41282	41289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011026	AAAG	2	8	54171	54178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011026	ATTC	2	8	57323	57330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011026	TTTG	2	8	57773	57780	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011026	CCAA	2	8	61694	61701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011026	AGTT	2	8	62830	62837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011026	TAAA	2	8	69377	69384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011026	ATAA	2	8	69500	69507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011026	GATT	2	8	73244	73251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011026	ACCC	2	8	73522	73529	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_011026	CTTT	2	8	77089	77096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011026	TGGA	2	8	79569	79576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011026	TCAC	2	8	81516	81523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011026	AATC	2	8	87030	87037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011026	CCCG	2	8	93748	93755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_011026	TTGT	2	8	95765	95772	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011026	ATTT	2	8	95856	95863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011026	ATTT	2	8	95924	95931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011026	TTTA	2	8	100528	100535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011026	ATTT	2	8	100777	100784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011026	AAAT	2	8	100884	100891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011026	AATT	2	8	113435	113442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011026	ATTT	2	8	113839	113846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011026	CCTT	2	8	114207	114214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011026	ACAA	2	8	114258	114265	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011026	ATGA	2	8	114295	114302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011026	CTTT	2	8	114342	114349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011026	GCTT	2	8	118273	118280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011026	TCAA	2	8	118447	118454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011026	ATTT	2	8	119868	119875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011026	CCAA	2	8	122824	122831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011026	CTGC	2	8	123167	123174	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011026	AGCA	2	8	125269	125276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011026	CAAG	2	8	130018	130025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011026	CAGC	2	8	130115	130122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011026	TGTT	2	8	132485	132492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011026	AGGA	2	8	134435	134442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011026	ATTG	2	8	136352	136359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011026	TATT	2	8	137417	137424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011026	GTCT	2	8	149610	149617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011026	TGTC	2	8	149696	149703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011026	TGTC	2	8	149734	149741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011026	GGCC	2	8	149760	149767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011026	TTGC	2	8	152433	152440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011026	TGCC	2	8	152556	152563	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011026	CTCA	2	8	156327	156334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011026	TGTT	2	8	157168	157175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011026	CCAT	2	8	157540	157547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011026	CATC	2	8	160095	160102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011026	GAAC	2	8	164047	164054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011026	TGCA	2	8	167032	167039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011026	ACTC	2	8	174295	174302	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011026	GCTT	2	8	179375	179382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011026	TTAG	2	8	179761	179768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011026	TGCT	2	8	179794	179801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011026	CAAA	2	8	179828	179835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011026	ACTT	2	8	179866	179873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011026	ATTT	2	8	179882	179889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011026	GACC	2	8	185855	185862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011026	AGTC	2	8	185863	185870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011026	AAAG	2	8	188157	188164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011026	TCGC	2	8	190462	190469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011026	ATAA	2	8	190562	190569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011026	ATTA	2	8	193636	193643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011026	TGAA	2	8	196056	196063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011026	AAAT	2	8	196151	196158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011026	CCAA	2	8	196563	196570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011026	CTTT	2	8	198872	198879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011026	GCCT	2	8	200680	200687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011026	ATTT	2	8	204017	204024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011026	GACC	2	8	206093	206100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011026	GCAA	2	8	206286	206293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011026	GAAT	2	8	209893	209900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011026	CAAG	2	8	210021	210028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011026	CTTG	2	8	214800	214807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011026	CGCT	2	8	216106	216113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011026	TCCA	2	8	217394	217401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011026	AAAT	2	8	217543	217550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011026	TGAA	2	8	217600	217607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011026	AAAG	2	8	221526	221533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011026	TCGT	2	8	223412	223419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011026	CTTC	2	8	223541	223548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011026	GAAA	2	8	225778	225785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011026	TTTC	2	8	225869	225876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011026	GCAA	2	8	227687	227694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011026	ATTT	2	8	227708	227715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011026	TCCT	2	8	227717	227724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011026	ATAA	2	8	236102	236109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011026	GCCT	2	8	236328	236335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011026	TTTC	2	8	236419	236426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011026	ATTT	2	8	236454	236461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011026	ATCA	2	8	238015	238022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011026	TTTC	2	8	241033	241040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011026	AGAA	2	8	241080	241087	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011026	TGAA	2	8	250074	250081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011026	TCAT	2	8	253737	253744	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011026	CAAA	2	8	253773	253780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011026	CGCC	2	8	268510	268517	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_011026	TTAG	2	8	270794	270801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011026	ATCA	2	8	273742	273749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011026	CCAT	2	8	273760	273767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011026	ACAA	2	8	276007	276014	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011026	AACA	2	8	276301	276308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011026	TGGA	2	8	276430	276437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011026	TTCT	2	8	281147	281154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011026	ATTT	2	8	288691	288698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011026	TAAG	2	8	291177	291184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011026	AAAT	2	8	295985	295992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011026	AGGA	2	8	296079	296086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011026	ACAA	2	8	299390	299397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011026	TATT	2	8	299464	299471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011026	TGAA	2	8	299637	299644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011026	ATTG	2	8	299665	299672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011026	GGGA	2	8	299690	299697	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011026	CAAA	2	8	302681	302688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011026	GCAA	2	8	303225	303232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011026	CCGC	2	8	303868	303875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_011026	GTTC	2	8	309196	309203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011026	CAGC	2	8	313466	313473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011026	TGCA	2	8	315859	315866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011026	ATTC	2	8	317870	317877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011026	AAAC	2	8	325946	325953	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011026	GTTT	2	8	326156	326163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011026	TGAT	2	8	329185	329192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011026	TACT	2	8	329238	329245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011026	ATTT	2	8	329565	329572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011026	ATTG	2	8	331650	331657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011026	TATT	2	8	331683	331690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011026	TTTA	2	8	331699	331706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011026	TTTA	2	8	331786	331793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011026	AAGT	2	8	336752	336759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011026	TTGC	2	8	351026	351033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011026	ATTT	2	8	351100	351107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011026	CTTG	2	8	356154	356161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011026	ATTC	2	8	356199	356206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011026	AAGA	2	8	356283	356290	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011026	TGCC	2	8	356326	356333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011026	AATC	2	8	360756	360763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011026	CAAT	3	12	362544	362555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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