MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 9838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011026	TGC	2	6	517980	517985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_011026	TTC	2	6	518032	518037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_011026	TTC	2	6	518138	518143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_011026	T	6	6	518168	518173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011026	TGTC	2	8	518198	518205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_011026	AGC	2	6	518212	518217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_011026	TTC	2	6	518246	518251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_011026	CCTTG	2	10	518325	518334	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1509	NC_011026	TTC	2	6	518377	518382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_011026	CAG	2	6	518446	518451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011026	TCTTG	2	10	518456	518465	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1512	NC_011026	TTC	2	6	518508	518513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_011026	TTCA	2	8	518544	518551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_011026	CTTGT	2	10	518588	518597	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_011026	GCTGA	2	10	518601	518610	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_011026	TAT	2	6	518622	518627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011026	A	8	8	519162	519169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011026	GAAA	2	8	519184	519191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_011026	T	6	6	519195	519200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011026	GCG	2	6	519259	519264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_011026	T	6	6	520167	520172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011026	TGAA	2	8	520259	520266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011026	A	8	8	520767	520774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011026	TGAA	2	8	520811	520818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011026	GCT	2	6	520884	520889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_011026	GACAA	2	10	520896	520905	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_011026	GAA	2	6	520934	520939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011026	GCT	2	6	520968	520973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_011026	A	8	8	520985	520992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011026	GAA	2	6	521017	521022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011026	GAT	2	6	523400	523405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011026	T	6	6	523405	523410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011026	T	6	6	523424	523429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011026	A	6	6	523500	523505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011026	A	6	6	523526	523531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011026	A	6	6	523628	523633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011026	TC	3	6	528383	528388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_011026	CTG	2	6	530418	530423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_011026	T	6	6	530817	530822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011026	CAA	2	6	530901	530906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011026	TAGT	2	8	531240	531247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011026	CAAA	2	8	531252	531259	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_011026	TCTT	2	8	531749	531756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_011026	TCA	2	6	531793	531798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_011026	A	7	7	531828	531834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011026	T	7	7	531852	531858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011026	CAC	2	6	531873	531878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_011026	CTTT	2	8	531923	531930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_011026	ATG	2	6	531956	531961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011026	AAGT	2	8	531980	531987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011026	A	6	6	531996	532001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011026	GAA	2	6	532006	532011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011026	T	6	6	532033	532038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011026	GC	3	6	532110	532115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_011026	T	8	8	533273	533280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011026	ACGAAA	2	12	533291	533302	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1557	NC_011026	A	6	6	533300	533305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011026	TAG	2	6	533313	533318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011026	CT	3	6	533322	533327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_011026	T	6	6	533327	533332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_011026	GCA	2	6	534386	534391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_011026	T	7	7	534412	534418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011026	T	6	6	534426	534431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_011026	TTC	2	6	534438	534443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_011026	T	6	6	534448	534453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011026	A	8	8	534455	534462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011026	TTC	2	6	534469	534474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_011026	T	6	6	534951	534956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1570	NC_011026	CTC	2	6	536807	536812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_011026	TTGC	2	8	536813	536820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_011026	T	6	6	536836	536841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011026	TTTCC	2	10	537848	537857	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1574	NC_011026	GTT	2	6	537865	537870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011026	TC	3	6	537881	537886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1577	NC_011026	A	6	6	537950	537955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_011026	TG	3	6	537965	537970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011026	TTG	2	6	538006	538011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011026	ATC	2	6	540365	540370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1582	NC_011026	A	6	6	540473	540478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011026	T	6	6	540905	540910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011026	AGG	2	6	540925	540930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011026	AACT	2	8	541013	541020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_011026	GC	3	6	541022	541027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_011026	A	6	6	541158	541163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_011026	TGT	2	6	543220	543225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011026	TTAT	2	8	543233	543240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011026	ATGA	2	8	543271	543278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011026	AATA	2	8	543297	543304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_011026	TTG	2	6	545204	545209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011026	TTG	2	6	545231	545236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_011026	GGA	2	6	546976	546981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011026	GA	3	6	546980	546985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011026	GGA	2	6	550311	550316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011026	T	6	6	551774	551779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_011026	CAA	2	6	551802	551807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_011026	T	6	6	551853	551858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011026	CTC	2	6	553716	553721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_011026	ATGG	2	8	553884	553891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011026	TCA	2	6	553904	553909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_011026	TGA	2	6	553984	553989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011026	TTG	2	6	554659	554664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011026	ATT	2	6	554737	554742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_011026	A	6	6	556507	556512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011026	A	7	7	556545	556551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1620	NC_011026	T	7	7	558562	558568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_011026	CCA	2	6	558598	558603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1623	NC_011026	CT	3	6	558675	558680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_011026	GGT	2	6	558688	558693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_011026	CAA	2	6	558749	558754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011026	T	6	6	558794	558799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011026	TCT	2	6	558841	558846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011026	T	6	6	558850	558855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011026	GC	3	6	558873	558878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_011026	AGCGA	2	10	558899	558908	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1633	NC_011026	T	8	8	559512	559519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011026	A	7	7	559529	559535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011026	CTTT	2	8	559543	559550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_011026	GCT	2	6	559572	559577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_011026	T	6	6	560639	560644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_011026	T	6	6	560670	560675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1640	NC_011026	T	6	6	560719	560724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1918	NC_011026	AAC	2	6	653728	653733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1919	NC_011026	AC	3	6	653776	653781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1920	NC_011026	T	7	7	653794	653800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1923	NC_011026	T	6	6	656002	656007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1986	NC_011026	A	7	7	676273	676279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1987	NC_011026	T	8	8	676928	676935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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