MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cellvibrio japonicus Ueda107 chromosome

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010995	GTTATT	2	12	9670	9681	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010995	TTTTCT	2	12	37165	37176	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010995	TAACAA	2	12	76358	76369	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010995	TTCCTC	2	12	166034	166045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010995	ATTTTT	2	12	166625	166636	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010995	TTTTCT	2	12	185072	185083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010995	TCGTCA	2	12	212346	212357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010995	ATCAGC	2	12	346132	346143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010995	CAGCAA	2	12	455754	455765	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010995	AAAAAT	2	12	460399	460410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010995	TTTGTT	2	12	472370	472381	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010995	CAGTAT	2	12	554926	554937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010995	TGGACG	2	12	559186	559197	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010995	AAGAGA	2	12	644637	644648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010995	ATATTG	2	12	646481	646492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010995	ATGGGG	2	12	651347	651358	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010995	GTAAAA	2	12	665695	665706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010995	CGGCTT	2	12	689952	689963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010995	TCAGTG	2	12	701553	701564	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010995	TTATGG	2	12	713394	713405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010995	AGCCAT	2	12	728498	728509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010995	TGAAAT	2	12	811282	811293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010995	TGGTCT	2	12	852114	852125	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010995	AAAATT	2	12	955316	955327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010995	ATTTGA	2	12	977306	977317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010995	CAATAA	2	12	983136	983147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010995	ATTGGT	2	12	990836	990847	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010995	GTGGTC	2	12	997081	997092	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010995	GCTTTC	2	12	1046534	1046545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010995	TGAAAT	2	12	1058338	1058349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010995	TGAAAT	2	12	1064037	1064048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010995	CCATTT	2	12	1076964	1076975	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010995	GAGCTG	2	12	1077452	1077463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010995	TGGCTT	2	12	1152997	1153008	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010995	TTAATG	2	12	1153465	1153476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010995	CACTGC	2	12	1174937	1174948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010995	GTTTGG	2	12	1193266	1193277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010995	TATTTT	2	12	1193854	1193865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010995	TATAAA	2	12	1203321	1203332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010995	GCCCAG	2	12	1341337	1341348	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010995	AAACAC	2	12	1368845	1368856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010995	TGGATA	2	12	1404796	1404807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010995	TGGGGA	2	12	1406571	1406582	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010995	ATTGCC	2	12	1411991	1412002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010995	CCTACG	2	12	1420042	1420053	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010995	TTCAAA	2	12	1431036	1431047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010995	GCAAGA	2	12	1437740	1437751	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010995	CTCATC	2	12	1437757	1437768	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010995	GTTTTC	2	12	1450224	1450235	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010995	CAATTG	2	12	1456728	1456739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010995	ACCCTC	2	12	1488153	1488164	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010995	ATCATT	2	12	1488198	1488209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010995	CAATAA	2	12	1515219	1515230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010995	TGGTCG	2	12	1519914	1519925	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010995	TTTTTG	2	12	1648872	1648883	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010995	CCTGGC	2	12	1649827	1649838	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010995	TTTGCC	2	12	1650220	1650231	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010995	CAATAA	2	12	1763798	1763809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010995	TATTAA	2	12	1766000	1766011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010995	CGCCTG	2	12	1820772	1820783	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010995	GCTACT	2	12	1886712	1886723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010995	TTCTAT	2	12	1889009	1889020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010995	GCTTGT	2	12	1919718	1919729	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010995	GGCCAG	2	12	2123892	2123903	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010995	CTGCCA	2	12	2230264	2230275	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010995	AAAGTA	2	12	2271089	2271100	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010995	CTGGCT	2	12	2316945	2316956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010995	CTGTTG	2	12	2346094	2346105	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010995	CTGGTA	2	12	2357785	2357796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010995	ATTGTT	2	12	2366322	2366333	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010995	GAGCGG	2	12	2381436	2381447	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010995	AAGAAT	2	12	2428782	2428793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010995	AAAAAG	2	12	2432269	2432280	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010995	ATAAAT	2	12	2441839	2441850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010995	CTGTTA	2	12	2479309	2479320	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010995	GGCCGG	2	12	2483759	2483770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010995	TTTACG	2	12	2526739	2526750	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010995	ATTTAG	2	12	2557493	2557504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010995	TATCCA	2	12	2628079	2628090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010995	ATCAAC	2	12	2694011	2694022	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010995	CTCACT	2	12	2830171	2830182	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010995	ATCAAA	2	12	2876773	2876784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010995	CATTTT	2	12	2876831	2876842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010995	AAAAAC	2	12	2877394	2877405	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010995	AAAAAC	2	12	2880751	2880762	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010995	AAAAAC	2	12	2892201	2892212	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010995	TTTCAT	2	12	2893321	2893332	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010995	CCCCTT	2	12	3002277	3002288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010995	CTTTTT	2	12	3074418	3074429	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010995	TTAGGA	2	12	3128541	3128552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010995	CACTGA	2	12	3161011	3161022	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010995	AAACAG	2	12	3189876	3189887	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010995	CTCACA	2	12	3210167	3210178	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010995	CTTTTG	2	12	3227733	3227744	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010995	CAGCCA	2	12	3308192	3308203	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010995	ATCATG	2	12	3323951	3323962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010995	GTGTTT	2	12	3340155	3340166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010995	CGCCTG	2	12	3385395	3385406	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010995	CAATAA	2	12	3416712	3416723	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010995	GCTTTA	2	12	3420258	3420269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010995	CAAACA	2	12	3462956	3462967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010995	TCGCGC	2	12	3514616	3514627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010995	ACATAG	2	12	3559113	3559124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010995	TTTTCG	2	12	3597743	3597754	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010995	GCACCT	2	12	3601642	3601653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010995	TTCCGT	2	12	3602154	3602165	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010995	TCTGTA	2	12	3603241	3603252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010995	GTATGG	2	12	3726386	3726397	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010995	ATTCGA	2	12	3792086	3792097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010995	GCGATG	2	12	3799577	3799588	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010995	GCCACC	2	12	3835053	3835064	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010995	TATTTA	2	12	3919087	3919098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010995	ACTTAA	2	12	4110033	4110044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010995	AGAAAG	2	12	4111269	4111280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010995	ATTTTT	2	12	4113750	4113761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010995	TTCAAA	2	12	4184088	4184099	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010995	ACCGGT	2	12	4194597	4194608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010995	AGCGAT	2	12	4269434	4269445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010995	ACAGCG	2	12	4297291	4297302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010995	CGACCG	2	12	4313768	4313779	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010995	TAAAAC	2	12	4351406	4351417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010995	AGAAAA	2	12	4373517	4373528	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010995	TTTACG	2	12	4376667	4376678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010995	CGGCGA	2	12	4376711	4376722	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010995	CGCCAG	2	12	4415705	4415716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010995	CTGGCC	2	12	4416641	4416652	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010995	GTTAAG	2	12	4430599	4430610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010995	TTTATA	2	12	4468409	4468420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010995	AAAAAC	2	12	4561473	4561484	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.