MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 1156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010831	ACAA	2	8	4050	4057	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010831	AAAC	2	8	6921	6928	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010831	AGTA	2	8	11611	11618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010831	TATG	2	8	11666	11673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010831	ATGT	2	8	11752	11759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010831	CATG	2	8	14077	14084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010831	GGAT	2	8	24194	24201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010831	AGTA	2	8	30394	30401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010831	TATT	2	8	30671	30678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010831	TGGT	2	8	31610	31617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010831	TTTA	2	8	37031	37038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010831	TATT	3	12	39895	39906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010831	AATA	2	8	40011	40018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010831	CCGT	2	8	48383	48390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010831	TGTT	2	8	48436	48443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010831	TCAT	2	8	51142	51149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010831	TGAT	2	8	51627	51634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010831	GGCA	2	8	58363	58370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010831	GAAC	2	8	58371	58378	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010831	GATT	2	8	58470	58477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010831	AAGA	2	8	60516	60523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010831	TGCA	2	8	60676	60683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010831	CGAA	2	8	60976	60983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010831	ATCT	2	8	61140	61147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010831	GCAC	2	8	61535	61542	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010831	ATTT	2	8	63919	63926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010831	CTTG	2	8	64304	64311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010831	ATTC	2	8	64863	64870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010831	TCCA	2	8	64876	64883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010831	TTGA	2	8	76243	76250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010831	ACGT	2	8	86723	86730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010831	ACCC	2	8	92198	92205	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_010831	AATA	2	8	94889	94896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010831	AATA	2	8	98020	98027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010831	GGGA	2	8	99024	99031	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010831	CTGT	2	8	99045	99052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010831	TTAC	2	8	99067	99074	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010831	TTTC	2	8	99638	99645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010831	TGTA	2	8	99923	99930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010831	TCGT	2	8	103505	103512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010831	AGCA	2	8	104228	104235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010831	TGAA	2	8	109057	109064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010831	TGAA	2	8	110896	110903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010831	AATC	2	8	111654	111661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010831	GAAA	2	8	111821	111828	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010831	TTTA	2	8	112750	112757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010831	AAGA	2	8	121184	121191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010831	GTTT	2	8	121320	121327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010831	ATTT	2	8	123067	123074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010831	TGTT	2	8	124532	124539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010831	TCCC	2	8	127862	127869	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_010831	CTGA	2	8	128936	128943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010831	GATT	2	8	129742	129749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010831	ATGC	2	8	129928	129935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010831	TTCT	2	8	135252	135259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010831	ATTA	3	12	137787	137798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010831	CTTG	2	8	138256	138263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010831	ATCA	2	8	138574	138581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010831	TTTA	2	8	140364	140371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010831	ATCT	2	8	140439	140446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010831	AGCC	2	8	140757	140764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010831	CAGG	2	8	144250	144257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010831	CATG	2	8	147911	147918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010831	AAGA	2	8	148833	148840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010831	GTTT	2	8	148969	148976	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010831	ATTT	2	8	150716	150723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010831	TGTT	2	8	152181	152188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010831	TATG	2	8	153860	153867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010831	TATC	2	8	157331	157338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010831	CTGA	2	8	167453	167460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010831	AGGG	2	8	167503	167510	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010831	CTAT	2	8	167533	167540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010831	TGAA	2	8	167598	167605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010831	TGAA	2	8	169164	169171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010831	TAGT	2	8	171615	171622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010831	CTGT	2	8	172070	172077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010831	AGGT	2	8	172218	172225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010831	AGCA	2	8	172874	172881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010831	GTCA	2	8	173352	173359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010831	TGAC	2	8	173432	173439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010831	CAAA	2	8	173450	173457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010831	CAGA	2	8	175944	175951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010831	ATTT	2	8	176709	176716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010831	TTCC	2	8	181107	181114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010831	CCTT	2	8	181124	181131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010831	TCAA	2	8	182715	182722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010831	TCCA	2	8	182732	182739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010831	TTTC	2	8	185484	185491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010831	ATTG	2	8	186076	186083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010831	ATCA	2	8	186553	186560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010831	TTGT	2	8	187094	187101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010831	CTTT	2	8	187404	187411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010831	AAAG	2	8	187456	187463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010831	GTTT	2	8	187606	187613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010831	TAGT	2	8	187887	187894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010831	TAGT	2	8	187920	187927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010831	ACAG	2	8	195019	195026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010831	TGCC	2	8	197285	197292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010831	AACA	2	8	199143	199150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010831	GATG	2	8	201460	201467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010831	TGCC	2	8	202629	202636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010831	CAGA	2	8	203439	203446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010831	TTCC	2	8	205785	205792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010831	CTTT	2	8	205841	205848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010831	GAGT	2	8	211589	211596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010831	CAGG	2	8	212303	212310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010831	TTTG	2	8	214021	214028	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010831	GGCT	2	8	214615	214622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010831	TGCA	2	8	215218	215225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010831	GGAG	2	8	215369	215376	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010831	AACA	2	8	215729	215736	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010831	CCGG	2	8	215992	215999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010831	GTTT	2	8	216433	216440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010831	TTGA	2	8	216903	216910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010831	AATA	2	8	218457	218464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010831	GAAA	2	8	218531	218538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010831	TGCC	2	8	218558	218565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010831	AGTT	2	8	224203	224210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010831	TAAC	2	8	229960	229967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010831	CTTG	2	8	237162	237169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010831	TATT	2	8	237178	237185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010831	TTCA	2	8	237434	237441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010831	ATGA	2	8	241567	241574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010831	GGTT	2	8	244716	244723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010831	ATTG	2	8	246132	246139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010831	TTTG	2	8	246200	246207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010831	TTAA	2	8	249330	249337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010831	GTTG	2	8	258709	258716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010831	TAAT	2	8	261566	261573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010831	AGCA	2	8	263313	263320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010831	GTGA	2	8	263368	263375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010831	TCAG	2	8	274665	274672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010831	TGCC	2	8	274825	274832	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010831	CCAT	2	8	274956	274963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010831	AACA	2	8	275672	275679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010831	TTGT	2	8	280793	280800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010831	AGTG	2	8	282847	282854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010831	AAAG	2	8	284040	284047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010831	CTTC	2	8	286397	286404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010831	TTAC	2	8	288814	288821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010831	TTCT	2	8	295806	295813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010831	TAAA	2	8	296108	296115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010831	TTTC	2	8	298442	298449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010831	TAAA	2	8	300253	300260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010831	TGCA	2	8	300442	300449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010831	AGGG	2	8	308092	308099	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010831	GATC	2	8	308565	308572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010831	GGTG	2	8	311552	311559	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010831	GTAG	2	8	311716	311723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010831	TCCA	2	8	327066	327073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_010831	CTTT	2	8	328273	328280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_010831	TACG	2	8	1096634	1096641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
484	NC_010831	ATTG	2	8	1096862	1096869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_010831	AATA	2	8	1126257	1126264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_010831	CATC	2	8	1126992	1126999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_010831	TGAT	2	8	1129722	1129729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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