MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 9457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010831	AGA	2	6	822782	822787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010831	CCG	2	6	822788	822793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_010831	AT	3	6	822823	822828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010831	AGA	2	6	822839	822844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010831	CAG	2	6	822893	822898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_010831	A	6	6	822911	822916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010831	CTG	2	6	824502	824507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_010831	GTG	2	6	824524	824529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010831	T	7	7	824581	824587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010831	GAC	2	6	824622	824627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_010831	CATT	2	8	824632	824639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_010831	CAT	2	6	824646	824651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_010831	CAT	2	6	824670	824675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_010831	GAAAA	2	10	824688	824697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010831	TTTG	2	8	824711	824718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010831	CT	4	8	824720	824727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_010831	TTC	2	6	824914	824919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_010831	A	8	8	825043	825050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010831	TTG	2	6	825056	825061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010831	TGG	2	6	825115	825120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010831	AAT	2	6	825166	825171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010831	CAGA	2	8	825210	825217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_010831	A	6	6	825217	825222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_010831	TAT	2	6	828145	828150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010831	TAC	2	6	828254	828259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_010831	AAT	2	6	828273	828278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010831	AG	3	6	828313	828318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_010831	TGA	2	6	828327	828332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010831	AGC	2	6	828379	828384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_010831	GCT	2	6	828389	828394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_010831	TAT	2	6	828515	828520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010831	GAG	2	6	828597	828602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010831	ATG	2	6	828664	828669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010831	TTTC	2	8	828761	828768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_010831	CAA	2	6	828846	828851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_010831	CAC	2	6	828862	828867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_010831	GCA	2	6	830155	830160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_010831	TA	3	6	830197	830202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_010831	T	6	6	833942	833947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010831	TTA	2	6	833954	833959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010831	AT	3	6	833970	833975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_010831	ACT	2	6	834042	834047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_010831	AGA	2	6	834470	834475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010831	GAA	2	6	837531	837536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010831	T	8	8	837542	837549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010831	GTT	2	6	837901	837906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010831	TAA	2	6	837922	837927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010831	ATT	2	6	837971	837976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010831	GAAT	2	8	837983	837990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010831	GTT	3	9	838007	838015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010831	AAC	2	6	838039	838044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_010831	GAA	2	6	838050	838055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010831	TAAAC	2	10	838098	838107	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3054	NC_010831	T	6	6	838409	838414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010831	AGG	2	6	838442	838447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_010831	T	9	9	840166	840174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_010831	CAG	2	6	840225	840230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_010831	AG	3	6	840265	840270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010831	TGT	2	6	840974	840979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_010831	CTG	2	6	840980	840985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_010831	TCG	2	6	840990	840995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_010831	T	7	7	841003	841009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010831	GAGC	2	8	843641	843648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_010831	GGC	2	6	843658	843663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_010831	A	6	6	843739	843744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010831	GAG	2	6	843751	843756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010831	GCT	3	9	843781	843789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_010831	TGT	3	9	844865	844873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_010831	CT	3	6	844888	844893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_010831	AGA	2	6	846651	846656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010831	AAT	2	6	846707	846712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010831	TTA	2	6	848267	848272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010831	ATACA	2	10	848344	848353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3074	NC_010831	TGA	2	6	848734	848739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_010831	AATGA	2	10	848813	848822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_010831	TCA	2	6	848877	848882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_010831	A	6	6	849068	849073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010831	T	9	9	849102	849110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010831	T	6	6	849160	849165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_010831	AG	4	8	849167	849174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010831	CA	3	6	851528	851533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_010831	TGC	2	6	851545	851550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_010831	T	6	6	853255	853260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_010831	GCC	2	6	853272	853277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_010831	T	6	6	853280	853285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010831	TCT	2	6	854660	854665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_010831	T	8	8	854692	854699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_010831	AAT	2	6	854706	854711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_010831	TATT	2	8	855646	855653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010831	TGA	2	6	855717	855722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_010831	TGT	2	6	855729	855734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010831	GGC	2	6	855737	855742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_010831	T	9	9	855767	855775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_010831	AAT	2	6	855790	855795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_010831	AAG	2	6	855822	855827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_010831	C	6	6	858076	858081	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3097	NC_010831	G	6	6	858092	858097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_010831	T	7	7	858099	858105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_010831	A	7	7	858109	858115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_010831	CTC	2	6	858119	858124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_010831	TTA	2	6	858187	858192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010831	TACA	2	8	858271	858278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_010831	GCTT	2	8	858298	858305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_010831	CTGC	2	8	861814	861821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_010831	ACG	2	6	861854	861859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_010831	GTTT	2	8	861871	861878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010831	AAT	2	6	861886	861891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_010831	ATT	2	6	861982	861987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010831	TG	3	6	862026	862031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010831	A	6	6	862044	862049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010831	GTA	2	6	862103	862108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010831	GGT	2	6	862215	862220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_010831	GAT	2	6	862254	862259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010831	TTTC	2	8	863274	863281	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_010831	GTCA	2	8	863392	863399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_010831	GTT	2	6	863421	863426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010831	GCGTC	2	10	863465	863474	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3118	NC_010831	A	6	6	863523	863528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_010831	GT	3	6	863531	863536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010831	AGA	2	6	863571	863576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010831	ATTGAA	2	12	863589	863600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010831	CAC	2	6	863603	863608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_010831	AG	3	6	863625	863630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010831	TAT	3	9	868281	868289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010831	TGT	2	6	868395	868400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_010831	TTG	2	6	868531	868536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010831	AGTTGC	2	12	868598	868609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3128	NC_010831	GTTTG	2	10	868637	868646	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010831	GGAA	2	8	869314	869321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010831	TTG	2	6	870065	870070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010831	CTG	2	6	870082	870087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_010831	CAG	2	6	870114	870119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_010831	TGTT	2	8	870172	870179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_010831	T	6	6	870178	870183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_010831	CAA	2	6	873054	873059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3137	NC_010831	GCG	2	6	873241	873246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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