MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 9457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010831	TTG	2	6	213642	213647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010831	AGC	2	6	213698	213703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010831	CATTT	2	10	213721	213730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_010831	GA	3	6	213931	213936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010831	T	7	7	213953	213959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010831	TGA	2	6	213963	213968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010831	GCC	2	6	214011	214016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_010831	TTTG	2	8	214021	214028	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010831	CTT	2	6	214030	214035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_010831	AAGGA	2	10	214099	214108	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010831	GTTTC	2	10	214110	214119	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_010831	GTT	2	6	214179	214184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010831	AG	4	8	214251	214258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010831	ATT	2	6	214269	214274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010831	GCA	2	6	214573	214578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_010831	GGCT	2	8	214615	214622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_010831	GTCGT	2	10	214639	214648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1018	NC_010831	AAC	2	6	214726	214731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010831	GTT	2	6	214866	214871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010831	TTG	2	6	214929	214934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010831	AAATC	2	10	214941	214950	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_010831	GTT	2	6	214971	214976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010831	GTA	2	6	215040	215045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010831	TGCA	2	8	215218	215225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_010831	TGT	2	6	215230	215235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010831	CTG	2	6	215243	215248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010831	GCT	2	6	215249	215254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010831	GAA	2	6	215269	215274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010831	GAT	2	6	215303	215308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010831	GAT	2	6	215348	215353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010831	GAT	2	6	215357	215362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010831	GGAG	2	8	215369	215376	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010831	AAC	2	6	215622	215627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_010831	G	6	6	215675	215680	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010831	ATGCAG	2	12	215682	215693	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1036	NC_010831	GA	3	6	215720	215725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010831	AACA	2	8	215729	215736	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_010831	ATG	2	6	215751	215756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010831	GA	3	6	215760	215765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010831	AAC	2	6	215838	215843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_010831	TCT	2	6	215905	215910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010831	GAT	2	6	215912	215917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010831	AG	3	6	215965	215970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010831	CCGG	2	8	215992	215999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_010831	AGG	2	6	216048	216053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010831	CT	3	6	216090	216095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_010831	TTG	2	6	216115	216120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010831	ATT	2	6	216141	216146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010831	AGG	2	6	216270	216275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010831	AGC	2	6	216292	216297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_010831	T	7	7	216313	216319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010831	GGC	2	6	216358	216363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_010831	GCC	2	6	216398	216403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_010831	GTTT	2	8	216433	216440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010831	A	6	6	216507	216512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010831	TGT	2	6	216580	216585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010831	TG	3	6	216618	216623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010831	GGA	2	6	216693	216698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010831	GCG	2	6	216853	216858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010831	ATG	2	6	216876	216881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_010831	CTG	2	6	216896	216901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010831	TTGA	2	8	216903	216910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010831	ATG	2	6	216930	216935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010831	ATG	2	6	216956	216961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010831	T	6	6	217743	217748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010831	TTCTGC	2	12	217775	217786	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010831	T	7	7	217807	217813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010831	CCT	2	6	218306	218311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_010831	TG	3	6	218400	218405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010831	AATA	2	8	218457	218464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010831	CTG	2	6	218512	218517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_010831	GAAA	2	8	218531	218538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010831	GTT	2	6	218551	218556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010831	TGCC	2	8	218558	218565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_010831	GGA	3	9	218587	218595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010831	TGA	2	6	219616	219621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010831	GTT	2	6	219650	219655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010831	G	6	6	219709	219714	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010831	CA	3	6	219819	219824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_010831	GTT	2	6	219861	219866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010831	TGT	2	6	219882	219887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010831	A	7	7	219889	219895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010831	A	6	6	219941	219946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010831	CCT	2	6	219975	219980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_010831	ACA	2	6	219996	220001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_010831	TGC	2	6	220018	220023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_010831	GC	3	6	220065	220070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_010831	CTA	2	6	220692	220697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010831	CAC	2	6	220699	220704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_010831	AT	3	6	220738	220743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_010831	TG	3	6	220748	220753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010831	GT	3	6	221461	221466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010831	T	6	6	221482	221487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010831	CAA	2	6	221516	221521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_010831	CGA	2	6	221663	221668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010831	CAT	2	6	221669	221674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_010831	GAA	2	6	221706	221711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010831	ATC	2	6	221720	221725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_010831	GCTTT	2	10	221805	221814	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_010831	ATG	3	9	224013	224021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010831	T	6	6	224050	224055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010831	TTG	2	6	224122	224127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010831	AGTT	2	8	224203	224210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010831	CGA	2	6	224275	224280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_010831	T	7	7	224644	224650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010831	GAA	2	6	224653	224658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010831	ACA	2	6	224671	224676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_010831	ACA	2	6	226576	226581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_010831	TTC	2	6	227766	227771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_010831	TAAC	2	8	229960	229967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_010831	GGT	2	6	233386	233391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_010831	AG	3	6	233393	233398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010831	CTT	2	6	236976	236981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_010831	TTG	2	6	237085	237090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010831	TTG	2	6	237140	237145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010831	CTTG	2	8	237162	237169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_010831	TATT	2	8	237178	237185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010831	CAT	2	6	237244	237249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_010831	ATA	2	6	237274	237279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010831	TTC	2	6	237288	237293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_010831	CGG	2	6	237366	237371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_010831	GTT	2	6	237396	237401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010831	GAA	2	6	237414	237419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010831	AAT	2	6	237428	237433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010831	TTCA	2	8	237434	237441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_010831	TGA	2	6	239182	239187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010831	TGCAA	2	10	241359	241368	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1128	NC_010831	TTC	2	6	241402	241407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_010831	TAG	2	6	241428	241433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010831	GA	3	6	241481	241486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010831	ATGA	2	8	241567	241574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010831	CTT	2	6	241583	241588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_010831	GT	3	6	241623	241628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010831	GTT	2	6	243222	243227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010831	TAG	2	6	243245	243250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_010831	TAA	2	6	243254	243259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_010831	CGT	2	6	350404	350409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_010831	ATGG	2	8	353192	353199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_010831	TAA	2	6	356491	356496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_010831	TTC	2	6	356561	356566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1426	NC_010831	AGTA	2	8	359119	359126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_010831	CAA	2	6	359270	359275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1443	NC_010831	AAC	2	6	363083	363088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1446	NC_010831	CTG	2	6	363125	363130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_010831	CAA	2	6	365924	365929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1450	NC_010831	CAG	2	6	365932	365937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_010831	TA	3	6	366063	366068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_010831	TTA	2	6	366125	366130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1464	NC_010831	GA	3	6	368929	368934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_010831	AGT	2	6	368949	368954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_010831	T	7	7	382155	382161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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