MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 9457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010831	TGTT	2	8	124532	124539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010831	AGC	2	6	124569	124574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010831	AAT	2	6	124624	124629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010831	AGA	2	6	124741	124746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010831	TTA	2	6	124910	124915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010831	GTG	2	6	124960	124965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010831	GAC	2	6	125086	125091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_010831	ACCGT	2	10	125100	125109	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
509	NC_010831	TC	3	6	125266	125271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_010831	CGG	2	6	125387	125392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_010831	ACT	2	6	125471	125476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_010831	ACC	2	6	125659	125664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_010831	TCG	2	6	125703	125708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010831	CCT	2	6	125747	125752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_010831	GGT	2	6	125883	125888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010831	TCA	2	6	125998	126003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010831	CGT	2	6	126078	126083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010831	AGT	2	6	126344	126349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010831	TAA	2	6	126352	126357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010831	TAT	2	6	126379	126384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010831	GTC	2	6	126574	126579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010831	ATT	2	6	126584	126589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010831	ACG	2	6	126609	126614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_010831	TTTTTA	2	12	126618	126629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010831	CTA	2	6	126632	126637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_010831	CTA	2	6	126639	126644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_010831	T	7	7	126663	126669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010831	CT	3	6	126670	126675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_010831	CT	3	6	126679	126684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_010831	CA	3	6	126737	126742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_010831	TGT	2	6	127833	127838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010831	TG	3	6	127842	127847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010831	TCCC	2	8	127862	127869	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
534	NC_010831	CA	3	6	127891	127896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_010831	GAG	2	6	128691	128696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010831	CGA	2	6	128703	128708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_010831	TAC	3	9	128819	128827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_010831	CTG	2	6	128830	128835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_010831	GCA	2	6	128864	128869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010831	GGTGA	2	10	128897	128906	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010831	CTGA	2	8	128936	128943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_010831	TC	3	6	128953	128958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_010831	GATT	2	8	129742	129749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010831	CA	3	6	129777	129782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_010831	ATA	2	6	129815	129820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010831	CAT	2	6	129823	129828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010831	ACT	2	6	129851	129856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010831	A	6	6	129890	129895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010831	GCC	2	6	129896	129901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_010831	GGC	2	6	129915	129920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010831	ATGC	2	8	129928	129935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_010831	AGC	2	6	130174	130179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010831	T	6	6	130236	130241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010831	GCA	2	6	130540	130545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010831	TTA	2	6	130551	130556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010831	CGA	2	6	130557	130562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010831	TCC	2	6	130567	130572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_010831	TGA	2	6	130581	130586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010831	TTC	2	6	130759	130764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010831	TCT	2	6	130787	130792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010831	ACA	2	6	130800	130805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_010831	CAA	2	6	130830	130835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010831	AGA	2	6	130839	130844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010831	ACC	2	6	133197	133202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_010831	TGA	2	6	133205	133210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010831	TGT	2	6	133487	133492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010831	GAT	2	6	133544	133549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010831	AAC	2	6	133590	133595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_010831	TGC	2	6	135095	135100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010831	TTG	2	6	135107	135112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010831	TAGTT	2	10	135118	135127	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010831	TAA	2	6	135140	135145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010831	AT	3	6	135154	135159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010831	TTCT	2	8	135252	135259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_010831	CTG	2	6	136469	136474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_010831	ATC	2	6	136513	136518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_010831	GCG	2	6	136536	136541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010831	CAGAAA	2	12	136613	136624	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_010831	ATG	2	6	136703	136708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010831	CCA	2	6	136791	136796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010831	TTC	2	6	136843	136848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010831	AGC	2	6	136856	136861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_010831	T	6	6	136917	136922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010831	GTT	2	6	136938	136943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010831	TCA	2	6	136974	136979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010831	T	7	7	137687	137693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010831	TTG	2	6	137698	137703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_010831	TAT	2	6	137718	137723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010831	ATTA	3	12	137787	137798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010831	T	6	6	137909	137914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010831	CA	3	6	138078	138083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_010831	CGA	2	6	138242	138247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_010831	CTTG	2	8	138256	138263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_010831	CTA	2	6	138431	138436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010831	ATCA	2	8	138574	138581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_010831	CAG	2	6	138637	138642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010831	A	6	6	138655	138660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010831	CTG	2	6	140246	140251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_010831	GTG	2	6	140268	140273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010831	T	7	7	140325	140331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010831	TTTA	2	8	140364	140371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010831	CAC	2	6	140411	140416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_010831	ATCT	2	8	140439	140446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_010831	ACC	2	6	140477	140482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_010831	ACC	2	6	140501	140506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_010831	ACC	2	6	140525	140530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_010831	T	7	7	140566	140572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010831	GCC	2	6	140582	140587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_010831	TG	3	6	140615	140620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010831	CAT	2	6	140675	140680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010831	TGC	2	6	140715	140720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_010831	AGCC	2	8	140757	140764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_010831	ATC	2	6	140796	140801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010831	T	6	6	140819	140824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010831	TTG	2	6	140830	140835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010831	GTT	2	6	140876	140881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010831	CAT	2	6	140883	140888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010831	CTG	3	9	141042	141050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010831	CAT	2	6	141230	141235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010831	GCG	2	6	141265	141270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010831	TG	3	6	141290	141295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010831	GGT	2	6	142943	142948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010831	TAA	2	6	143468	143473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010831	GAT	2	6	143478	143483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010831	CGC	2	6	143513	143518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_010831	GCG	2	6	143571	143576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010831	CTC	2	6	143598	143603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_010831	TTC	2	6	143796	143801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010831	GAA	2	6	143833	143838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010831	CAG	2	6	143887	143892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_010831	TGC	2	6	143905	143910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010831	TTC	2	6	143934	143939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_010831	CGA	2	6	143947	143952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_010831	AGC	2	6	143967	143972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_010831	TC	3	6	143991	143996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_010831	A	6	6	144035	144040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_010831	AAGA	2	8	148833	148840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
673	NC_010831	AG	4	8	148903	148910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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