MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 9457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010831	T	7	7	1363927	1363933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_010831	CAGCA	2	10	1363934	1363943	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5003	NC_010831	GAT	2	6	1363945	1363950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_010831	TCG	2	6	1364004	1364009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_010831	AT	3	6	1364022	1364027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010831	TCG	2	6	1364080	1364085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_010831	AT	3	6	1364098	1364103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_010831	AG	3	6	1364151	1364156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_010831	GT	3	6	1364321	1364326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_010831	TAGG	2	8	1364439	1364446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_010831	TGA	2	6	1364463	1364468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_010831	GGGC	2	8	1364500	1364507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_010831	GCCC	2	8	1364514	1364521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5014	NC_010831	T	7	7	1364571	1364577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_010831	AAT	2	6	1364592	1364597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_010831	AG	3	6	1364613	1364618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_010831	ATT	2	6	1366282	1366287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_010831	TGT	2	6	1366288	1366293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_010831	AATAA	2	10	1366303	1366312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_010831	T	6	6	1366337	1366342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_010831	ATT	2	6	1366356	1366361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_010831	CTG	2	6	1366470	1366475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_010831	ATC	2	6	1366476	1366481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_010831	TAGG	2	8	1366706	1366713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_010831	TGA	2	6	1366730	1366735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_010831	GGGC	2	8	1366767	1366774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_010831	GCCC	2	8	1366781	1366788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5028	NC_010831	GTT	2	6	1366845	1366850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_010831	TAT	2	6	1366895	1366900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_010831	TTTAT	2	10	1366941	1366950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_010831	TGA	2	6	1366960	1366965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_010831	AAGGA	2	10	1367000	1367009	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_010831	GCAA	2	8	1367529	1367536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_010831	GAA	2	6	1367542	1367547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010831	GGGC	2	8	1367905	1367912	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_010831	GCCC	2	8	1367919	1367926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5037	NC_010831	GA	3	6	1368045	1368050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_010831	AAT	2	6	1368768	1368773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_010831	GAA	2	6	1368783	1368788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_010831	A	8	8	1368787	1368794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_010831	GGC	2	6	1368960	1368965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_010831	TAA	2	6	1369005	1369010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_010831	GGC	2	6	1369027	1369032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_010831	TG	3	6	1369047	1369052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_010831	CTG	2	6	1369147	1369152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_010831	ATC	2	6	1369153	1369158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_010831	CT	4	8	1369214	1369221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_010831	GGC	2	6	1369318	1369323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_010831	TAA	2	6	1369363	1369368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_010831	GGC	2	6	1369385	1369390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_010831	GTT	2	6	1369462	1369467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_010831	CCT	2	6	1369468	1369473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_010831	ACT	2	6	1369578	1369583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_010831	TTTTCC	2	12	1369655	1369666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_010831	GTT	2	6	1373335	1373340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_010831	T	6	6	1373357	1373362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_010831	T	8	8	1373801	1373808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_010831	GAAGGG	2	12	1375557	1375568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_010831	AGG	2	6	1375590	1375595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_010831	AGA	2	6	1375653	1375658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_010831	CTT	2	6	1375754	1375759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_010831	ATT	3	9	1375814	1375822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_010831	TCA	2	6	1377640	1377645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_010831	TCA	2	6	1377647	1377652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_010831	AAC	2	6	1377860	1377865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_010831	AAG	2	6	1377914	1377919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_010831	TAA	2	6	1379328	1379333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_010831	TTG	2	6	1379370	1379375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_010831	GTC	2	6	1379492	1379497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_010831	CAA	2	6	1379498	1379503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_010831	CGT	2	6	1379806	1379811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_010831	TTA	2	6	1379812	1379817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_010831	TTG	2	6	1379881	1379886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_010831	AACGT	2	10	1379943	1379952	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5075	NC_010831	GCC	2	6	1379962	1379967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_010831	TGG	2	6	1380025	1380030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_010831	GCA	2	6	1380268	1380273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5080	NC_010831	CG	3	6	1380386	1380391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_010831	CT	3	6	1387588	1387593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_010831	T	6	6	1387778	1387783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_010831	TGAAAT	2	12	1387831	1387842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_010831	GGC	2	6	1388920	1388925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5087	NC_010831	TCA	2	6	1388994	1388999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_010831	AAAG	2	8	1389082	1389089	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_010831	TGT	2	6	1389171	1389176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_010831	TTC	2	6	1389210	1389215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_010831	CTTGGT	2	12	1389218	1389229	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5092	NC_010831	GCC	2	6	1389260	1389265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5093	NC_010831	AGT	2	6	1389266	1389271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5095	NC_010831	TTG	2	6	1389384	1389389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_010831	GA	3	6	1389459	1389464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_010831	AGA	3	9	1389468	1389476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_010831	CGC	2	6	1389526	1389531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_010831	CGGAG	2	10	1389535	1389544	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5100	NC_010831	TGC	2	6	1389634	1389639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_010831	GATG	2	8	1389868	1389875	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_010831	GGC	3	9	1389925	1389933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_010831	CTT	2	6	1389935	1389940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_010831	GGA	2	6	1389992	1389997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_010831	TTA	2	6	1390020	1390025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_010831	CGCT	2	8	1390095	1390102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_010831	GA	3	6	1390224	1390229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_010831	GGA	2	6	1390266	1390271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_010831	ATG	2	6	1390290	1390295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_010831	GGGA	2	8	1390332	1390339	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_010831	CCG	2	6	1390358	1390363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_010831	CTT	2	6	1390427	1390432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_010831	G	6	6	1390461	1390466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_010831	CTT	2	6	1390486	1390491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_010831	GA	3	6	1390503	1390508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_010831	CTC	2	6	1393397	1393402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_010831	ATT	2	6	1393411	1393416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_010831	T	6	6	1393418	1393423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010831	CAA	2	6	1393443	1393448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_010831	TA	3	6	1393474	1393479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_010831	TGC	2	6	1393585	1393590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5123	NC_010831	GCG	2	6	1393630	1393635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_010831	CAA	2	6	1393665	1393670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_010831	AAT	2	6	1393688	1393693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_010831	GAA	2	6	1393703	1393708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_010831	A	7	7	1393707	1393713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_010831	GGC	2	6	1393869	1393874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_010831	AGG	2	6	1393912	1393917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5131	NC_010831	AGGTT	2	10	1393988	1393997	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5261	NC_010831	AAG	2	6	1426188	1426193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_010831	AAG	2	6	1474410	1474415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_010831	ATG	2	6	1474416	1474421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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