MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 9457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010831	TCT	2	6	1210472	1210477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_010831	ATGT	2	8	1210502	1210509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_010831	ATG	2	6	1210515	1210520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_010831	ATT	2	6	1210538	1210543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_010831	GCT	2	6	1210564	1210569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_010831	A	7	7	1212406	1212412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_010831	TG	3	6	1212428	1212433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_010831	TGTA	2	8	1212450	1212457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_010831	TAT	2	6	1212471	1212476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_010831	GTG	2	6	1212499	1212504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_010831	A	6	6	1213808	1213813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_010831	T	7	7	1213832	1213838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_010831	ATTA	2	8	1213866	1213873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_010831	TTA	3	9	1213871	1213879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_010831	TCT	2	6	1213893	1213898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_010831	GATT	2	8	1213917	1213924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_010831	CAT	2	6	1215280	1215285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_010831	AG	3	6	1216644	1216649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_010831	GAA	2	6	1219950	1219955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_010831	GTT	2	6	1220400	1220405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_010831	T	6	6	1220441	1220446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_010831	ATTGTT	2	12	1220469	1220480	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_010831	TCT	2	6	1220515	1220520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_010831	T	6	6	1221271	1221276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_010831	TTG	2	6	1221298	1221303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_010831	GGA	2	6	1221320	1221325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_010831	GTT	2	6	1221340	1221345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_010831	GTT	2	6	1223072	1223077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_010831	TTG	2	6	1223081	1223086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_010831	TAAT	2	8	1223135	1223142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_010831	TAA	2	6	1223186	1223191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_010831	TTC	2	6	1223219	1223224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_010831	TTG	2	6	1223234	1223239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_010831	CGGA	2	8	1223289	1223296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4535	NC_010831	GA	3	6	1223916	1223921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_010831	GA	3	6	1224183	1224188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_010831	GTG	2	6	1224218	1224223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_010831	T	7	7	1224265	1224271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_010831	ATT	2	6	1224283	1224288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_010831	CAA	2	6	1224352	1224357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_010831	GGC	2	6	1226285	1226290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_010831	GTCA	2	8	1226311	1226318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_010831	TTA	2	6	1226402	1226407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_010831	ATC	2	6	1226418	1226423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_010831	T	6	6	1227058	1227063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_010831	TTG	2	6	1229428	1229433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_010831	TGA	2	6	1229462	1229467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_010831	ATA	2	6	1229493	1229498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_010831	AAT	2	6	1229499	1229504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_010831	CGCC	2	8	1229586	1229593	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4551	NC_010831	GAA	2	6	1229623	1229628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_010831	ATG	2	6	1232908	1232913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_010831	CGG	2	6	1238618	1238623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_010831	T	7	7	1238688	1238694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_010831	TCGCT	2	10	1238711	1238720	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4556	NC_010831	CGGA	2	8	1240878	1240885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_010831	CCG	2	6	1240889	1240894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_010831	TTCG	2	8	1243228	1243235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_010831	GC	3	6	1243321	1243326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_010831	CCA	3	9	1243374	1243382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_010831	GAG	2	6	1243385	1243390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_010831	AAC	2	6	1243442	1243447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_010831	AGGA	2	8	1243462	1243469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_010831	GAG	2	6	1243497	1243502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_010831	TTG	2	6	1243566	1243571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_010831	TTTCG	2	10	1243594	1243603	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4567	NC_010831	TGC	2	6	1243618	1243623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_010831	GCG	2	6	1243652	1243657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_010831	CTTA	2	8	1244371	1244378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_010831	AACA	2	8	1244391	1244398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4571	NC_010831	GA	3	6	1244528	1244533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_010831	GTA	2	6	1244678	1244683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_010831	ATA	2	6	1244687	1244692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_010831	AAT	2	6	1244693	1244698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_010831	A	6	6	1244709	1244714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_010831	CAG	2	6	1244846	1244851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_010831	A	6	6	1244864	1244869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_010831	CGTG	2	8	1244917	1244924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4579	NC_010831	CTG	2	6	1246464	1246469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_010831	GTG	2	6	1246486	1246491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_010831	T	7	7	1246543	1246549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_010831	AG	3	6	1246576	1246581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_010831	A	6	6	1246594	1246599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_010831	GAC	2	6	1246633	1246638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_010831	T	6	6	1246654	1246659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_010831	A	7	7	1246695	1246701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_010831	ATTT	2	8	1246768	1246775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_010831	CAG	2	6	1246817	1246822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_010831	A	6	6	1246834	1246839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_010831	G	6	6	1246844	1246849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_010831	ACA	2	6	1247033	1247038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_010831	GGTTA	2	10	1247045	1247054	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_010831	GGT	2	6	1247065	1247070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_010831	GCAACA	2	12	1247107	1247118	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_010831	AAG	2	6	1247126	1247131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_010831	AC	3	6	1247216	1247221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_010831	CAAT	2	8	1247255	1247262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_010831	TTG	2	6	1247357	1247362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_010831	A	6	6	1247422	1247427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_010831	AAG	2	6	1247435	1247440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_010831	TA	3	6	1247471	1247476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_010831	ATA	3	9	1247515	1247523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_010831	GCCG	2	8	1249680	1249687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_010831	TTG	2	6	1249843	1249848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_010831	CGC	2	6	1249878	1249883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_010831	GCA	2	6	1249923	1249928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_010831	TA	3	6	1250034	1250039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_010831	TTG	2	6	1250065	1250070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_010831	CCTT	2	8	1250107	1250114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_010831	GCA	2	6	1250892	1250897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_010831	ATGA	2	8	1250949	1250956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_010831	TGGT	2	8	1251018	1251025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_010831	GA	3	6	1251037	1251042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_010831	TTTG	2	8	1252212	1252219	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_010831	AGG	2	6	1252235	1252240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_010831	GCA	2	6	1252261	1252266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_010831	ACGAA	2	10	1252289	1252298	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4618	NC_010831	GGCAA	2	10	1252346	1252355	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4619	NC_010831	TAT	2	6	1252416	1252421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_010831	A	9	9	1252455	1252463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_010831	TCT	2	6	1253251	1253256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_010831	ATA	2	6	1253262	1253267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_010831	GCT	3	9	1253308	1253316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_010831	GC	3	6	1253319	1253324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_010831	GAA	2	6	1253431	1253436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_010831	AAG	2	6	1253437	1253442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_010831	CT	4	8	1255838	1255845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_010831	TAT	2	6	1255858	1255863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_010831	CAC	2	6	1255871	1255876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_010831	TGC	2	6	1255901	1255906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_010831	GAT	2	6	1255970	1255975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_010831	GT	3	6	1255976	1255981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_010831	T	7	7	1256022	1256028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4882	NC_010831	GA	3	6	1314248	1314253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4886	NC_010831	TAA	2	6	1315366	1315371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4895	NC_010831	T	6	6	1319579	1319584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4898	NC_010831	ACT	2	6	1320730	1320735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4899	NC_010831	T	6	6	1323619	1323624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4900	NC_010831	T	7	7	1323644	1323650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4901	NC_010831	G	6	6	1323687	1323692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4902	NC_010831	T	7	7	1323696	1323702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4903	NC_010831	T	6	6	1323730	1323735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4904	NC_010831	GTC	2	6	1326071	1326076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4905	NC_010831	T	7	7	1326326	1326332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4906	NC_010831	TGC	2	6	1327217	1327222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4910	NC_010831	TGGT	2	8	1330140	1330147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4922	NC_010831	TTTG	2	8	1332410	1332417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4931	NC_010831	AAC	2	6	1334676	1334681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4932	NC_010831	CTG	2	6	1334723	1334728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4933	NC_010831	GT	3	6	1334752	1334757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4939	NC_010831	TGC	2	6	1336110	1336115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4945	NC_010831	CT	3	6	1339852	1339857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4959	NC_010831	T	6	6	1349207	1349212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4965	NC_010831	T	7	7	1351190	1351196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4966	NC_010831	GGGC	2	8	1353460	1353467	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4967	NC_010831	GCCC	2	8	1353474	1353481	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4983	NC_010831	TTTA	2	8	1354745	1354752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4987	NC_010831	GTGTT	2	10	1355383	1355392	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4996	NC_010831	CGTGA	2	10	1359312	1359321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4997	NC_010831	ACT	2	6	1359323	1359328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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