MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010830	TAACCA	2	12	4463	4474	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010830	TATTTT	2	12	43188	43199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010830	TAATTC	2	12	43596	43607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010830	TAATTG	2	12	51972	51983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010830	ATAACT	2	12	54023	54034	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010830	TATTTT	2	12	54527	54538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010830	TACTTT	2	12	54664	54675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010830	ATTCTT	2	12	64137	64148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010830	AATTAA	2	12	76259	76270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010830	GAAAAA	2	12	76339	76350	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010830	AGAACA	2	12	90645	90656	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010830	GAAAAG	2	12	90937	90948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010830	TTACTT	2	12	92574	92585	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010830	ACAAAA	2	12	101477	101488	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010830	CTATTA	2	12	111284	111295	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010830	TTATAA	2	12	112327	112338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010830	TAAAAG	2	12	127207	127218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010830	ATGCTA	2	12	141888	141899	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010830	TAAATG	2	12	144909	144920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010830	GTTAGC	2	12	149868	149879	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010830	GAATAA	2	12	156567	156578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010830	TACTAT	2	12	157589	157600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010830	TTTTCT	2	12	176300	176311	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010830	ACATAA	2	12	176361	176372	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010830	TATGTA	2	12	178772	178783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010830	ATGTAA	2	12	178894	178905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010830	TTATAA	2	12	181124	181135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010830	AGACTA	2	12	181180	181191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010830	TATTTT	2	12	181869	181880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010830	AGAAGC	2	12	211509	211520	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010830	AAAAGA	2	12	215806	215817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010830	AATTTT	2	12	220021	220032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010830	TATTGA	2	12	224574	224585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010830	AAAAGA	2	12	230316	230327	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010830	AATTTT	2	12	234531	234542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010830	TATTTT	2	12	255538	255549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010830	CATACA	2	12	255704	255715	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010830	ATCCAC	2	12	260866	260877	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010830	CTAGAT	2	12	260918	260929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010830	TATACA	2	12	289613	289624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010830	TTGTTA	2	12	292975	292986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010830	ATATAG	2	12	293669	293680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010830	ATATGT	2	12	294255	294266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010830	AAGTAA	2	12	313448	313459	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010830	ATCATA	2	12	317633	317644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010830	ACTTTA	2	12	340682	340693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010830	AATATA	2	12	340861	340872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010830	TATGCT	2	12	360273	360284	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010830	ATAAAA	2	12	365310	365321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010830	TAAAAA	4	24	380892	380915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010830	TTCTTA	2	12	389120	389131	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010830	AAGGAA	2	12	390174	390185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010830	TGGATA	2	12	405210	405221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010830	AAAAGG	2	12	405814	405825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010830	AACAAA	2	12	415741	415752	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010830	ATTAGT	2	12	419549	419560	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010830	TAACTC	2	12	434765	434776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010830	TTAAGA	2	12	456701	456712	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010830	TACAAA	2	12	463422	463433	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010830	CTATAT	2	12	466727	466738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010830	GTTTAT	2	12	476394	476405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010830	AAAATA	2	12	484680	484691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010830	TAAAAT	2	12	494649	494660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010830	GTAAAA	2	12	499551	499562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010830	AAGCGA	2	12	500307	500318	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010830	TTTTAC	2	12	502566	502577	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010830	TCTTAC	2	12	502752	502763	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010830	CTATAA	2	12	502787	502798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010830	TTATAA	2	12	516331	516342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010830	AAAGGA	2	12	516380	516391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010830	AGGATT	2	12	517442	517453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010830	AATCAT	2	12	545835	545846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010830	AATCAT	2	12	558126	558137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010830	TAGAAG	2	12	599579	599590	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010830	GTAAAC	2	12	600563	600574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010830	CTTAGT	2	12	606736	606747	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010830	TTATAA	2	12	606794	606805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010830	GTGTAA	2	12	619991	620002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010830	ATAGGT	2	12	631009	631020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010830	AATTTA	2	12	656756	656767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010830	AAAGAA	2	12	656880	656891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010830	TTTTAG	2	12	664222	664233	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010830	CTTATA	2	12	676239	676250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010830	TATTTT	2	12	687866	687877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010830	TTATAA	2	12	690779	690790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010830	GGAAAT	2	12	703955	703966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010830	CTTTTT	2	12	704604	704615	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010830	CTAAAA	2	12	749830	749841	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010830	ATTCAT	2	12	752968	752979	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010830	GATATT	2	12	753128	753139	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010830	GTAATA	2	12	753162	753173	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010830	GTAATA	2	12	753187	753198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010830	ATTCTT	2	12	803667	803678	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010830	TCTTTT	2	12	819113	819124	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010830	CTAAAT	2	12	819725	819736	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010830	AAAATG	2	12	828870	828881	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010830	CGACCC	2	12	831165	831176	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010830	TTATAG	2	12	831622	831633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010830	TAAATT	2	12	842503	842514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010830	ATTGTA	2	12	844138	844149	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010830	TTGTGG	2	12	844500	844511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010830	TATTTA	2	12	865327	865338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010830	TATGCT	2	12	871257	871268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010830	ATATGA	2	12	876044	876055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010830	AGGATT	2	12	877905	877916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010830	CAATTT	2	12	887132	887143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010830	TATACT	17	102	895541	895642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010830	CTGTAT	2	12	898532	898543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010830	ATTAAA	2	12	899428	899439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010830	ATGTTG	2	12	909917	909928	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010830	ATATAG	2	12	922507	922518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010830	AATTAG	2	12	930061	930072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010830	AGGATT	2	12	935572	935583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010830	TAAGAT	2	12	937949	937960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010830	AGTAAT	2	12	949902	949913	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010830	CTAAAG	2	12	954533	954544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010830	CATAAG	2	12	955626	955637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010830	TTTGAT	2	12	963416	963427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010830	TAGGAG	2	12	970016	970027	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010830	TAAACA	2	12	971212	971223	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010830	TATAGT	2	12	977883	977894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010830	AGCAAT	2	12	988090	988101	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010830	AAAGTA	2	12	988475	988486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010830	AATCTT	2	12	991444	991455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010830	ATCGTT	2	12	1001262	1001273	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010830	TAGCTT	2	12	1027081	1027092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010830	CCTGTG	2	12	1028010	1028021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010830	TTACAT	2	12	1028996	1029007	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010830	ACTATA	2	12	1029352	1029363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010830	AAAAAC	2	12	1031232	1031243	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_010830	TTTCTA	2	12	1098185	1098196	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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133	NC_010830	AACTAT	2	12	1110246	1110257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_010830	GTCATT	2	12	1111187	1111198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.