MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 10631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010830	CTT	2	6	166618	166623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010830	TAA	2	6	166685	166690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_010830	TAT	2	6	166694	166699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010830	CTA	2	6	166713	166718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010830	CAG	2	6	166783	166788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_010830	AGC	2	6	166816	166821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010830	GTA	2	6	166835	166840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010830	TAAT	2	8	166878	166885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010830	TGTT	2	8	166900	166907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010830	CAA	2	6	166914	166919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_010830	ATC	2	6	166945	166950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010830	TA	3	6	166999	167004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010830	ACTA	2	8	167047	167054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_010830	TAA	3	9	167077	167085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010830	CCTC	2	8	167105	167112	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1016	NC_010830	CTC	2	6	167140	167145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_010830	AGC	2	6	167212	167217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_010830	CAATG	2	10	167219	167228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_010830	CAG	2	6	167310	167315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010830	CAATG	2	10	167318	167327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_010830	GCA	2	6	167411	167416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_010830	CTT	3	9	167463	167471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010830	TAA	2	6	167476	167481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010830	CCTT	2	8	167504	167511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_010830	TGTA	2	8	167518	167525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010830	AGG	2	6	167527	167532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010830	AAG	2	6	167579	167584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010830	CAAC	2	8	167589	167596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_010830	TTA	2	6	167604	167609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010830	TAC	2	6	167617	167622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010830	T	6	6	167646	167651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010830	TTAT	2	8	167665	167672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010830	TACT	2	8	167673	167680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_010830	ATC	2	6	167697	167702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010830	AGA	2	6	167726	167731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010830	ATTT	2	8	167732	167739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010830	TA	3	6	169550	169555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010830	GCA	2	6	169583	169588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010830	AT	3	6	169609	169614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010830	CAG	2	6	169651	169656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_010830	GCAA	2	8	169658	169665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_010830	AAT	2	6	169775	169780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010830	CATA	2	8	169835	169842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_010830	AACG	2	8	169902	169909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_010830	TAG	2	6	169951	169956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010830	TAG	2	6	169990	169995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010830	TTG	2	6	170060	170065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010830	ATT	2	6	170172	170177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010830	GCTTG	2	10	170218	170227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_010830	AGA	2	6	170300	170305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010830	ATGC	2	8	170363	170370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_010830	A	6	6	170418	170423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010830	TAA	2	6	170480	170485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010830	TA	3	6	170532	170537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010830	AAT	2	6	170584	170589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010830	CTG	2	6	170600	170605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010830	GCA	2	6	170679	170684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_010830	A	7	7	170696	170702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010830	TCT	2	6	170758	170763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010830	CTA	2	6	170773	170778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010830	TAG	2	6	170797	170802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010830	AGCA	2	8	170852	170859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_010830	A	7	7	170876	170882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010830	TG	3	6	170905	170910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010830	TTG	2	6	170954	170959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010830	TA	3	6	170986	170991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010830	T	7	7	171042	171048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010830	CAA	2	6	171067	171072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_010830	TA	3	6	171180	171185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010830	TTAC	2	8	171189	171196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_010830	TTAA	2	8	171204	171211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010830	TTC	2	6	171243	171248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010830	T	6	6	171273	171278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010830	AGC	2	6	171310	171315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_010830	ATA	2	6	171372	171377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010830	TCC	2	6	171385	171390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_010830	T	7	7	171396	171402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010830	TAA	2	6	171428	171433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010830	TCT	2	6	171436	171441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_010830	A	6	6	171447	171452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010830	AAG	2	6	171466	171471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010830	ATA	2	6	171486	171491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010830	GTA	2	6	171499	171504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010830	TAA	2	6	171554	171559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010830	T	6	6	172877	172882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010830	ATT	2	6	172896	172901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010830	TA	3	6	172925	172930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010830	TAG	2	6	172951	172956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010830	AC	3	6	173011	173016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_010830	ACCA	2	8	173028	173035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_010830	CTT	2	6	173099	173104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_010830	CTT	2	6	173106	173111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_010830	TTTC	2	8	174273	174280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_010830	AGT	2	6	174292	174297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010830	TAA	2	6	174360	174365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010830	AAAT	2	8	174423	174430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010830	TAA	2	6	174452	174457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010830	A	6	6	174456	174461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010830	TA	3	6	174465	174470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010830	CAA	2	6	174489	174494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010830	ATC	2	6	174559	174564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_010830	ATT	2	6	174570	174575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010830	TAAC	2	8	174578	174585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_010830	CAT	2	6	176222	176227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_010830	CTT	3	9	176237	176245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_010830	T	7	7	176266	176272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010830	TTTTCT	2	12	176300	176311	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1108	NC_010830	A	6	6	176329	176334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010830	ACATAA	2	12	176361	176372	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1110	NC_010830	TAT	2	6	176404	176409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010830	GCTA	2	8	176425	176432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_010830	A	6	6	176432	176437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010830	TAT	2	6	176456	176461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010830	TAT	2	6	176490	176495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010830	ATT	2	6	176498	176503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010830	T	6	6	176502	176507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010830	ATT	2	6	176522	176527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010830	TAA	2	6	176533	176538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010830	AAT	2	6	176572	176577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010830	ATT	2	6	176910	176915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010830	ACAAT	2	10	176986	176995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_010830	TAAAA	2	10	177008	177017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010830	T	6	6	178171	178176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010830	A	6	6	178194	178199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010830	AG	3	6	178645	178650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010830	AAAC	2	8	178680	178687	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_010830	AT	3	6	178707	178712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010830	CAA	2	6	178740	178745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_010830	TCTA	2	8	178748	178755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_010830	TATGTA	2	12	178772	178783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010830	TAT	2	6	178802	178807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010830	ATT	2	6	178812	178817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010830	ATT	2	6	178825	178830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010830	TA	3	6	178845	178850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010830	TA	3	6	178885	178890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_010830	ATGTAA	2	12	178894	178905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_010830	GTAA	3	12	178902	178913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1277	NC_010830	AT	3	6	220045	220050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1278	NC_010830	CTT	2	6	220052	220057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1307	NC_010830	T	6	6	222699	222704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1308	NC_010830	TA	3	6	222768	222773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_010830	AGA	2	6	248986	248991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_010830	ATACT	2	10	250310	250319	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1416	NC_010830	CTATG	2	10	250370	250379	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1417	NC_010830	TAC	2	6	250402	250407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_010830	TTA	2	6	250408	250413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_010830	AAAG	2	8	251705	251712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_010830	ATT	2	6	251727	251732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_010830	AAT	2	6	251763	251768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_010830	T	6	6	255269	255274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_010830	TAA	2	6	255336	255341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_010830	GA	3	6	255480	255485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_010830	A	6	6	255502	255507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_010830	T	6	6	255518	255523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_010830	TATTTT	2	12	255538	255549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1429	NC_010830	CTC	2	6	255576	255581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1430	NC_010830	T	7	7	255584	255590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_010830	GTT	2	6	255597	255602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_010830	GCA	2	6	255605	255610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1436	NC_010830	GTT	2	6	257987	257992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_010830	T	6	6	258024	258029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_010830	TA	4	8	258140	258147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_010830	TA	3	6	259448	259453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_010830	TAA	2	6	259470	259475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_010830	TAT	2	6	259557	259562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_010830	ATAA	2	8	259575	259582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_010830	AC	3	6	259609	259614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1449	NC_010830	ACA	2	6	260857	260862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_010830	TAT	2	6	260910	260915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_010830	CTAGAT	2	12	260918	260929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1454	NC_010830	ATA	2	6	263048	263053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_010830	GA	3	6	264257	264262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_010830	TA	3	6	264313	264318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_010830	CAA	2	6	264359	264364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1459	NC_010830	TAT	2	6	264419	264424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_010830	ATAAA	2	10	264446	264455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_010830	TCT	2	6	265073	265078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1477	NC_010830	TA	3	6	265389	265394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1478	NC_010830	TCT	2	6	265422	265427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1481	NC_010830	TACT	2	8	266035	266042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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