MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 4217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010803	TGA	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010803	TTC	2	6	125	130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010803	TGA	2	6	1719	1724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010803	AAT	2	6	1729	1734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010803	GTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010803	CAT	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010803	AAC	3	9	1879	1887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010803	TAA	2	6	1906	1911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010803	AGG	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010803	TGT	2	6	10323	10328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010803	GTT	2	6	10346	10351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010803	TTA	2	6	10361	10366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010803	CAG	2	6	10512	10517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010803	GTT	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010803	CGG	2	6	10599	10604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010803	TTG	2	6	10680	10685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010803	GCA	2	6	10715	10720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010803	AAT	2	6	11648	11653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010803	GTT	2	6	13382	13387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010803	ATT	2	6	13515	13520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010803	TTC	2	6	21052	21057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010803	CTC	2	6	21156	21161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010803	CCG	2	6	23859	23864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010803	AAC	2	6	23917	23922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010803	GTT	2	6	29052	29057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010803	TAC	2	6	29748	29753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010803	TGC	2	6	30260	30265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010803	CTC	2	6	30291	30296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010803	CAG	2	6	31788	31793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010803	CTG	2	6	31802	31807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010803	TTC	2	6	33613	33618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010803	CTA	2	6	33655	33660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010803	GAA	2	6	33793	33798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010803	TTC	2	6	36471	36476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010803	TAT	2	6	36581	36586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010803	TAT	2	6	36596	36601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010803	ATG	2	6	36681	36686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010803	TGA	2	6	36725	36730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010803	ACC	2	6	36777	36782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010803	AAC	2	6	36783	36788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010803	GAA	2	6	38261	38266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010803	CAA	2	6	38584	38589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010803	AAT	2	6	38618	38623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010803	ATA	2	6	38692	38697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010803	CAG	2	6	38743	38748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010803	ATA	3	9	38801	38809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010803	AAT	2	6	38821	38826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010803	CAG	2	6	38974	38979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010803	GAG	2	6	39057	39062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010803	GCA	2	6	43687	43692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010803	CAG	2	6	43694	43699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010803	TTA	3	9	45162	45170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010803	GAG	2	6	45252	45257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010803	TCA	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010803	CAT	2	6	46333	46338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010803	GTT	2	6	46388	46393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010803	CAA	2	6	48654	48659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010803	GCC	2	6	48697	48702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010803	CGG	2	6	48795	48800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010803	TGA	2	6	52748	52753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010803	CTC	2	6	52796	52801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010803	GCG	2	6	54263	54268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010803	CTT	2	6	54286	54291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010803	CCG	2	6	54581	54586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010803	GAC	2	6	54694	54699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010803	ACA	2	6	54712	54717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010803	AGG	2	6	54728	54733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010803	ATC	2	6	55067	55072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010803	TTG	2	6	56612	56617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010803	GGA	2	6	56627	56632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010803	ATT	2	6	56718	56723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010803	TTC	2	6	56843	56848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010803	ATT	2	6	56868	56873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010803	CAG	2	6	56881	56886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010803	TCT	2	6	56926	56931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010803	ATA	2	6	56952	56957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010803	TCT	2	6	59656	59661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010803	TCT	2	6	59884	59889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010803	TCA	2	6	59914	59919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010803	GTT	2	6	59948	59953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010803	TTC	2	6	60027	60032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010803	AGA	2	6	60065	60070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010803	GAA	2	6	60079	60084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010803	GAG	2	6	60104	60109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010803	TGC	2	6	60158	60163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010803	CTT	2	6	60251	60256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010803	ATA	2	6	60305	60310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010803	CAG	2	6	60319	60324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010803	GGA	2	6	64611	64616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010803	GAT	2	6	64643	64648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010803	ACT	2	6	65927	65932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010803	AGG	2	6	66004	66009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010803	TCC	2	6	66251	66256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010803	GCT	2	6	66272	66277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010803	CTG	2	6	66443	66448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010803	TTC	2	6	69076	69081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010803	CGG	2	6	69095	69100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010803	AGC	2	6	69107	69112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010803	GCT	2	6	69143	69148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010803	TCC	2	6	69750	69755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010803	GAA	2	6	70237	70242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010803	CAG	2	6	70362	70367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010803	TGC	2	6	70443	70448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010803	GAA	2	6	76055	76060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010803	GTT	2	6	76119	76124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010803	AAT	2	6	76132	76137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010803	TTC	2	6	76184	76189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010803	ATT	2	6	76193	76198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010803	GGA	2	6	78531	78536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010803	TTC	2	6	79915	79920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010803	TCT	2	6	80399	80404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010803	GTG	2	6	80407	80412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010803	TGT	2	6	81737	81742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010803	GTT	2	6	81756	81761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010803	CTG	2	6	81773	81778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010803	GTT	2	6	81780	81785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010803	TCC	2	6	84044	84049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010803	GAG	2	6	84107	84112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010803	GGT	2	6	85410	85415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010803	ATT	2	6	85429	85434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010803	TAT	2	6	85444	85449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010803	CGA	2	6	85483	85488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010803	AAC	2	6	85528	85533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010803	CGA	2	6	87385	87390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010803	GTT	2	6	88617	88622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010803	TCG	2	6	88706	88711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010803	CGG	2	6	88716	88721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010803	GAA	2	6	91282	91287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010803	ATT	2	6	95143	95148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010803	TAT	3	9	96239	96247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010803	ATT	2	6	98613	98618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010803	AGC	2	6	98694	98699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010803	GCC	2	6	99650	99655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010803	ACA	2	6	99723	99728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010803	AAC	2	6	100642	100647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010803	ATT	2	6	100658	100663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010803	TAA	2	6	100980	100985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010803	TAC	2	6	100989	100994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010803	TAT	2	6	100995	101000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010803	ACA	2	6	102735	102740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_010803	TGA	2	6	107517	107522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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