MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 7787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010803	GGAT	2	8	1396905	1396912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010803	TGA	2	6	1396921	1396926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_010803	GCT	2	6	1396958	1396963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_010803	ATG	2	6	1396986	1396991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_010803	A	8	8	1397058	1397065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_010803	GAA	2	6	1397066	1397071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010803	AACAA	2	10	1398560	1398569	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4008	NC_010803	CAA	2	6	1398580	1398585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_010803	CAG	2	6	1398654	1398659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_010803	GAA	2	6	1398775	1398780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_010803	GATA	2	8	1398869	1398876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_010803	CTGC	2	8	1398878	1398885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_010803	TTG	2	6	1398914	1398919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_010803	TCC	2	6	1399564	1399569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_010803	AAT	2	6	1399619	1399624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_010803	AAC	2	6	1399633	1399638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_010803	AGG	2	6	1399653	1399658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_010803	TGA	2	6	1399678	1399683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_010803	TCCCT	2	10	1399737	1399746	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4020	NC_010803	A	6	6	1400112	1400117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_010803	T	6	6	1400137	1400142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_010803	TGC	2	6	1400803	1400808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_010803	AT	3	6	1400843	1400848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010803	TC	3	6	1400877	1400882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_010803	T	6	6	1402002	1402007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_010803	ACC	2	6	1402017	1402022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_010803	TAT	2	6	1402130	1402135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_010803	T	6	6	1402158	1402163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_010803	TCT	2	6	1402207	1402212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_010803	TAA	2	6	1402214	1402219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_010803	A	7	7	1402218	1402224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_010803	AGA	2	6	1406761	1406766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_010803	T	8	8	1406780	1406787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_010803	A	8	8	1406822	1406829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_010803	CCG	2	6	1406833	1406838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_010803	TGC	2	6	1406850	1406855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_010803	TCT	2	6	1406861	1406866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_010803	GGAC	2	8	1406895	1406902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_010803	GAAT	2	8	1406971	1406978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_010803	ACA	2	6	1406996	1407001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_010803	TGA	2	6	1407030	1407035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_010803	TTA	2	6	1407038	1407043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_010803	TAT	2	6	1407069	1407074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_010803	TAA	2	6	1408146	1408151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_010803	TAT	3	9	1408264	1408272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_010803	A	6	6	1408300	1408305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_010803	TA	4	8	1408307	1408314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_010803	TAC	2	6	1408384	1408389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_010803	CTG	2	6	1408459	1408464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_010803	TCG	2	6	1408526	1408531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_010803	TCGTA	2	10	1408550	1408559	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4052	NC_010803	TTTA	2	8	1408579	1408586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_010803	A	8	8	1408586	1408593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_010803	T	7	7	1408688	1408694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_010803	AATT	2	8	1408698	1408705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_010803	GCAA	2	8	1408707	1408714	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_010803	T	10	10	1408745	1408754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_010803	TCAT	2	8	1409782	1409789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_010803	TTTG	2	8	1410347	1410354	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_010803	TAAC	2	8	1410396	1410403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_010803	T	6	6	1411558	1411563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_010803	TCC	2	6	1412569	1412574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_010803	TGA	2	6	1412579	1412584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_010803	TCCG	2	8	1412587	1412594	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_010803	ACA	2	6	1412627	1412632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_010803	AAT	2	6	1412719	1412724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_010803	TGC	2	6	1412757	1412762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_010803	TCA	3	9	1412797	1412805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_010803	GGCA	2	8	1412833	1412840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_010803	A	6	6	1412845	1412850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_010803	TC	3	6	1415327	1415332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_010803	AATC	2	8	1415339	1415346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_010803	CCT	2	6	1415915	1415920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_010803	GAA	2	6	1415945	1415950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_010803	A	7	7	1419776	1419782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_010803	ATG	2	6	1421009	1421014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_010803	AG	4	8	1421041	1421048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_010803	GGC	2	6	1421057	1421062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_010803	TTG	2	6	1421063	1421068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_010803	T	7	7	1421074	1421080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_010803	A	7	7	1421085	1421091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_010803	GAAA	2	8	1421100	1421107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_010803	A	8	8	1421133	1421140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_010803	TGTTT	2	10	1421152	1421161	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_010803	TTCTC	2	10	1421177	1421186	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4086	NC_010803	CTT	2	6	1421189	1421194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_010803	GACC	2	8	1421248	1421255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_010803	CCAA	2	8	1421256	1421263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_010803	TTTGT	2	10	1421286	1421295	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_010803	CAA	2	6	1421311	1421316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_010803	CTG	2	6	1421368	1421373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_010803	GGA	2	6	1421478	1421483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_010803	GAG	2	6	1421498	1421503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_010803	GGAAA	2	10	1421521	1421530	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_010803	CAA	3	9	1421803	1421811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_010803	AG	3	6	1422870	1422875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_010803	A	6	6	1422943	1422948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_010803	CTGC	2	8	1422951	1422958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_010803	TCC	2	6	1425093	1425098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_010803	TAT	2	6	1425392	1425397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_010803	A	6	6	1425416	1425421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_010803	TACA	2	8	1425463	1425470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_010803	TGT	2	6	1425496	1425501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010803	ATT	2	6	1425521	1425526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_010803	TTC	2	6	1425537	1425542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_010803	ATG	2	6	1425675	1425680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_010803	AC	3	6	1425683	1425688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_010803	CTT	3	9	1425707	1425715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_010803	C	6	6	1425728	1425733	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4110	NC_010803	C	6	6	1425768	1425773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4111	NC_010803	AG	3	6	1425796	1425801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_010803	CGT	2	6	1425833	1425838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_010803	TCCT	2	8	1427272	1427279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_010803	TTC	2	6	1427348	1427353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_010803	TAC	2	6	1427358	1427363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_010803	GCC	2	6	1427376	1427381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_010803	AAGT	2	8	1427417	1427424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_010803	TAT	2	6	1427509	1427514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_010803	TATGC	2	10	1427566	1427575	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4120	NC_010803	ATG	2	6	1427591	1427596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_010803	CAT	2	6	1427611	1427616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_010803	TGC	2	6	1427638	1427643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_010803	C	6	6	1427657	1427662	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4124	NC_010803	TTCT	2	8	1427663	1427670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_010803	ATT	2	6	1430056	1430061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_010803	TCC	2	6	1431359	1431364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_010803	CAG	2	6	1431384	1431389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_010803	TC	3	6	1431448	1431453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_010803	ATA	2	6	1431536	1431541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_010803	TTAC	2	8	1431576	1431583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4131	NC_010803	ACTG	2	8	1431630	1431637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_010803	ATG	2	6	1431655	1431660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_010803	CCA	2	6	1432280	1432285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_010803	CCTTAC	2	12	1432346	1432357	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_010803	TC	3	6	1432372	1432377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_010803	GCA	2	6	1432452	1432457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_010803	CT	3	6	1432520	1432525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4138	NC_010803	GCC	2	6	1432621	1432626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4141	NC_010803	T	6	6	1432708	1432713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_010803	CAA	2	6	1432738	1432743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_010803	ACA	2	6	1432747	1432752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_010803	CAG	2	6	1435399	1435404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_010803	TGA	2	6	1435574	1435579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4149	NC_010803	AGCC	2	8	1435633	1435640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4150	NC_010803	CCA	2	6	1435819	1435824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4153	NC_010803	ATT	2	6	1436148	1436153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_010803	AG	3	6	1437462	1437467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_010803	TTAC	2	8	1437493	1437500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4164	NC_010803	AAT	2	6	1440036	1440041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_010803	GTAAC	2	10	1440365	1440374	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4166	NC_010803	AGCA	2	8	1440405	1440412	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4167	NC_010803	CA	3	6	1440435	1440440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4168	NC_010803	C	6	6	1440489	1440494	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4262	NC_010803	AGA	2	6	1476575	1476580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_010803	CCTTA	2	10	1476605	1476614	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4401	NC_010803	ATC	2	6	1531127	1531132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_010803	ATC	2	6	1531653	1531658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4434	NC_010803	T	6	6	1547654	1547659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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