MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 7787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010803	A	6	6	1030498	1030503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010803	TCA	2	6	1030528	1030533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_010803	CAT	2	6	1030552	1030557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_010803	TCA	2	6	1030558	1030563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_010803	ACC	2	6	1030566	1030571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_010803	CGA	2	6	1030607	1030612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_010803	GCT	2	6	1030628	1030633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_010803	GCT	2	6	1030640	1030645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_010803	TCA	2	6	1030660	1030665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_010803	AAC	2	6	1030714	1030719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_010803	CGG	2	6	1030726	1030731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_010803	AGG	2	6	1030733	1030738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010803	A	7	7	1030749	1030755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_010803	GTA	2	6	1030778	1030783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010803	ACA	2	6	1030932	1030937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_010803	TCA	2	6	1031001	1031006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_010803	AGG	2	6	1031013	1031018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010803	CGA	2	6	1031026	1031031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_010803	TGCT	2	8	1031049	1031056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_010803	TGA	2	6	1031152	1031157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010803	G	6	6	1031165	1031170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010803	AGT	2	6	1031190	1031195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_010803	GAA	2	6	1031631	1031636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_010803	GGT	2	6	1031682	1031687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010803	GAG	2	6	1031799	1031804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010803	GTGG	2	8	1031831	1031838	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010803	TTTGC	2	10	1031883	1031892	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_010803	GTA	2	6	1031946	1031951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010803	GAG	2	6	1031963	1031968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_010803	TGA	2	6	1032043	1032048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_010803	GGTG	2	8	1032067	1032074	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010803	TGA	2	6	1032287	1032292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010803	GGTG	2	8	1032311	1032318	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010803	AGT	2	6	1032340	1032345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_010803	T	7	7	1032657	1032663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_010803	ATT	2	6	1032677	1032682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_010803	T	7	7	1033212	1033218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_010803	A	6	6	1035809	1035814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_010803	AAG	2	6	1038109	1038114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010803	CGG	2	6	1038907	1038912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_010803	CTG	2	6	1038952	1038957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_010803	AATT	3	12	1038958	1038969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_010803	ATCGT	2	10	1039673	1039682	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_010803	TCA	2	6	1039756	1039761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_010803	ATT	2	6	1039771	1039776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010803	T	9	9	1039787	1039795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010803	GGT	2	6	1042561	1042566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010803	GAT	3	9	1042572	1042580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010803	ATT	2	6	1043286	1043291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010803	TCA	2	6	1043305	1043310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_010803	TTG	2	6	1043345	1043350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010803	ATG	2	6	1043351	1043356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010803	T	6	6	1043360	1043365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_010803	A	8	8	1043378	1043385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010803	A	6	6	1043395	1043400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_010803	TGT	2	6	1043423	1043428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_010803	CTG	2	6	1043430	1043435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_010803	GCA	2	6	1043467	1043472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_010803	AGTC	2	8	1043483	1043490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_010803	GAT	2	6	1043498	1043503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010803	GTT	2	6	1043512	1043517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010803	TCT	2	6	1043555	1043560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_010803	CT	3	6	1043577	1043582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_010803	TA	3	6	1043601	1043606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_010803	T	7	7	1043633	1043639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010803	T	9	9	1043869	1043877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010803	T	6	6	1043885	1043890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_010803	TTG	2	6	1043912	1043917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_010803	T	9	9	1043928	1043936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010803	T	7	7	1043947	1043953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010803	CAT	2	6	1043997	1044002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_010803	AGT	2	6	1045321	1045326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010803	GGT	2	6	1046517	1046522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010803	ACA	2	6	1046543	1046548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_010803	GTT	2	6	1047725	1047730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_010803	T	8	8	1047784	1047791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_010803	ATGACA	2	12	1047938	1047949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3078	NC_010803	GCG	2	6	1047971	1047976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_010803	CTG	2	6	1048632	1048637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_010803	TGCC	2	8	1048663	1048670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_010803	CGG	2	6	1052073	1052078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_010803	GTT	2	6	1052115	1052120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010803	ATC	2	6	1052121	1052126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_010803	TG	3	6	1053062	1053067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010803	GTA	3	9	1055028	1055036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010803	TTA	3	9	1055053	1055061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_010803	TTAT	2	8	1055918	1055925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_010803	TAA	2	6	1055928	1055933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_010803	C	6	6	1055999	1056004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3090	NC_010803	T	6	6	1056032	1056037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_010803	GCC	2	6	1057821	1057826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_010803	TTG	2	6	1057845	1057850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010803	TAT	2	6	1057881	1057886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_010803	TTC	2	6	1057950	1057955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_010803	A	7	7	1057967	1057973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_010803	CAA	2	6	1059195	1059200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_010803	A	6	6	1059199	1059204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_010803	T	6	6	1059223	1059228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_010803	T	7	7	1059234	1059240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010803	GT	3	6	1060888	1060893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010803	AT	3	6	1060930	1060935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_010803	T	7	7	1060937	1060943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010803	GCGG	2	8	1060969	1060976	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_010803	AGGC	2	8	1060995	1061002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_010803	GAT	2	6	1061023	1061028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010803	TA	3	6	1061064	1061069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_010803	T	8	8	1061076	1061083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010803	A	8	8	1061106	1061113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010803	T	6	6	1061116	1061121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010803	T	6	6	1062485	1062490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010803	GA	3	6	1063668	1063673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_010803	ACAGA	2	10	1063679	1063688	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3114	NC_010803	AC	3	6	1063721	1063726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_010803	TGT	3	9	1064436	1064444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_010803	GTT	2	6	1064448	1064453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010803	GA	3	6	1064479	1064484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_010803	GTT	3	9	1064494	1064502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_010803	A	7	7	1064508	1064514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010803	T	6	6	1066247	1066252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010803	TTCT	2	8	1066262	1066269	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_010803	GTA	2	6	1066316	1066321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_010803	ATT	2	6	1066322	1066327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010803	TAA	2	6	1066350	1066355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010803	T	6	6	1066367	1066372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_010803	CGC	2	6	1066424	1066429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_010803	GC	3	6	1066444	1066449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_010803	TATT	2	8	1066875	1066882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010803	CGGA	2	8	1066907	1066914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_010803	AAAT	2	8	1066990	1066997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010803	TCA	2	6	1067013	1067018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_010803	A	6	6	1069767	1069772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010803	GAG	2	6	1069930	1069935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_010803	GGC	2	6	1075667	1075672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3136	NC_010803	A	7	7	1080953	1080959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_010803	TTA	2	6	1080970	1080975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3243	NC_010803	A	6	6	1137485	1137490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_010803	CGGA	2	8	1137517	1137524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3245	NC_010803	GCA	2	6	1137579	1137584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3247	NC_010803	CTG	2	6	1138456	1138461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3249	NC_010803	AT	3	6	1138863	1138868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_010803	ACTA	2	8	1138915	1138922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3251	NC_010803	ATA	2	6	1140020	1140025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_010803	TA	3	6	1140024	1140029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_010803	A	6	6	1140058	1140063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_010803	ATA	2	6	1140072	1140077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_010803	TG	3	6	1140166	1140171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_010803	AGCAC	2	10	1141638	1141647	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3257	NC_010803	ACA	2	6	1141648	1141653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_010803	GGC	2	6	1141669	1141674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_010803	GTAA	2	8	1141713	1141720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_010803	T	6	6	1141748	1141753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_010803	AGA	2	6	1141790	1141795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_010803	A	6	6	1141854	1141859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3397	NC_010803	CGATCT	2	12	1156954	1156965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3398	NC_010803	AAGGG	2	10	1157205	1157214	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3399	NC_010803	CTG	2	6	1157243	1157248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3400	NC_010803	CGA	2	6	1157335	1157340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3401	NC_010803	AGC	2	6	1157382	1157387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3402	NC_010803	TCT	2	6	1157407	1157412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3416	NC_010803	CAG	2	6	1158106	1158111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3422	NC_010803	CTGC	2	8	1158756	1158763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3423	NC_010803	CG	3	6	1158851	1158856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3424	NC_010803	A	6	6	1158964	1158969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3426	NC_010803	A	6	6	1159047	1159052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3427	NC_010803	T	8	8	1165547	1165554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3428	NC_010803	TCG	2	6	1165589	1165594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3429	NC_010803	CTG	2	6	1165676	1165681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3432	NC_010803	CGGCG	2	10	1165945	1165954	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3433	NC_010803	T	7	7	1166043	1166049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3434	NC_010803	T	7	7	1168066	1168072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3435	NC_010803	GT	3	6	1168153	1168158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3436	NC_010803	CTT	2	6	1168165	1168170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3451	NC_010803	T	6	6	1181282	1181287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3452	NC_010803	TTGT	2	8	1181331	1181338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3453	NC_010803	TCTGT	2	10	1181366	1181375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3454	NC_010803	TA	3	6	1181381	1181386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3455	NC_010803	AGTGGG	2	12	1181519	1181530	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3467	NC_010803	T	9	9	1189447	1189455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3468	NC_010803	AAAATA	2	12	1189487	1189498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3470	NC_010803	CCT	2	6	1192582	1192587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3474	NC_010803	T	6	6	1193435	1193440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3475	NC_010803	TCT	2	6	1195399	1195404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3492	NC_010803	TG	4	8	1201902	1201909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_010803	A	6	6	1201984	1201989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3494	NC_010803	TGA	2	6	1205063	1205068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_010803	TATC	2	8	1205222	1205229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3498	NC_010803	ATT	2	6	1207649	1207654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_010803	CTTTT	2	10	1207675	1207684	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3500	NC_010803	TC	3	6	1211649	1211654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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