MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 7787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010803	AAAT	2	8	312408	312415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010803	TTC	2	6	312534	312539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010803	ATC	2	6	312639	312644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_010803	G	6	6	312663	312668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010803	ATG	2	6	312699	312704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010803	GTT	2	6	312778	312783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010803	TTA	2	6	312784	312789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010803	GTCG	2	8	312800	312807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_010803	TAA	3	9	312856	312864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010803	ATT	2	6	312891	312896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010803	TA	3	6	313036	313041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010803	TTTTC	2	10	313113	313122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_010803	T	6	6	313135	313140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010803	A	6	6	313241	313246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010803	ATT	2	6	313481	313486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010803	T	6	6	313489	313494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010803	GAA	2	6	313533	313538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010803	ATT	2	6	313574	313579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010803	TC	3	6	313610	313615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_010803	GAT	2	6	313632	313637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010803	TAA	2	6	313889	313894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010803	CAA	2	6	313934	313939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010803	TA	3	6	314051	314056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010803	ATT	2	6	315167	315172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010803	TTG	2	6	315184	315189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010803	A	7	7	319318	319324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010803	GCT	2	6	319347	319352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010803	ATT	2	6	319354	319359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010803	TAT	2	6	319430	319435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010803	TCAT	2	8	319458	319465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_010803	ATG	2	6	319507	319512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010803	ATG	2	6	319569	319574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010803	A	6	6	319627	319632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010803	CTG	2	6	322923	322928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010803	CTGTT	2	10	322938	322947	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_010803	A	7	7	322958	322964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010803	ATC	2	6	322966	322971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_010803	T	7	7	323040	323046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010803	ATT	2	6	323062	323067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010803	T	6	6	323070	323075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010803	ACG	2	6	323691	323696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010803	GAT	2	6	324888	324893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010803	AAT	2	6	324896	324901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010803	ACG	2	6	324921	324926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010803	GTCGA	2	10	326458	326467	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_010803	CAGC	2	8	326728	326735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_010803	GCAG	2	8	326765	326772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_010803	AGCTCC	2	12	326837	326848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_010803	T	6	6	328259	328264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010803	GGAAG	2	10	328268	328277	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010803	GATG	2	8	329385	329392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010803	TCG	2	6	329403	329408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_010803	T	6	6	329441	329446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010803	GA	3	6	329458	329463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010803	CATT	2	8	329498	329505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_010803	CT	3	6	330463	330468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_010803	T	6	6	331336	331341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010803	AG	3	6	331902	331907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010803	A	8	8	333491	333498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010803	T	8	8	333746	333753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_010803	T	6	6	333819	333824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010803	TTA	2	6	334406	334411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010803	AGG	2	6	336029	336034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010803	AACG	2	8	341039	341046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_010803	T	6	6	341335	341340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010803	A	6	6	341382	341387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010803	AGA	2	6	341397	341402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010803	CAG	2	6	343736	343741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_010803	CTC	2	6	345387	345392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_010803	TCT	2	6	346046	346051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_010803	TAA	3	9	346061	346069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010803	CCGT	2	8	350176	350183	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_010803	TAA	2	6	350231	350236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010803	GAAA	2	8	351553	351560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_010803	GAA	2	6	351589	351594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010803	GGGA	2	8	351600	351607	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010803	T	6	6	351616	351621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010803	GCT	2	6	351639	351644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010803	A	7	7	353482	353488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010803	TCC	2	6	354999	355004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_010803	TTTTTG	2	12	355056	355067	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010803	ATT	2	6	355079	355084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010803	ATT	2	6	355124	355129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010803	T	7	7	355439	355445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010803	CAG	2	6	356178	356183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_010803	CTTT	2	8	356192	356199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_010803	T	6	6	357478	357483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010803	A	7	7	357489	357495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010803	TA	3	6	357497	357502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010803	TTC	2	6	357605	357610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010803	T	6	6	357641	357646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010803	TCGG	2	8	357659	357666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_010803	T	6	6	357727	357732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010803	GAA	2	6	359105	359110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010803	TAC	2	6	359179	359184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010803	A	6	6	359196	359201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010803	A	7	7	359236	359242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010803	GAA	2	6	359250	359255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010803	AAG	2	6	359263	359268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010803	AAGT	2	8	359287	359294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010803	TGT	2	6	359314	359319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010803	T	8	8	359416	359423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010803	GTG	2	6	359436	359441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010803	AC	3	6	359452	359457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_010803	T	6	6	359545	359550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010803	CGGA	2	8	359559	359566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_010803	ACG	2	6	359567	359572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_010803	TGC	2	6	359649	359654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_010803	AAG	2	6	359663	359668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010803	AGT	2	6	359728	359733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010803	TGT	2	6	359889	359894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_010803	GCA	2	6	359907	359912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_010803	CGC	2	6	359958	359963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_010803	TCA	2	6	359970	359975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_010803	TGC	2	6	359980	359985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010803	CAAAG	2	10	360002	360011	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_010803	CAG	2	6	360020	360025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_010803	GGC	2	6	360067	360072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_010803	GA	3	6	360119	360124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010803	GCCG	2	8	360129	360136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_010803	GCA	2	6	360141	360146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_010803	TGA	2	6	360216	360221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010803	TGC	2	6	360228	360233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_010803	TCG	2	6	360259	360264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_010803	A	6	6	360279	360284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010803	AG	3	6	360302	360307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010803	CTGT	2	8	360343	360350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_010803	GATT	2	8	360424	360431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010803	GGA	2	6	360432	360437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010803	CAG	2	6	363090	363095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010803	TGT	2	6	363106	363111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010803	TA	3	6	364012	364017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010803	A	7	7	364017	364023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010803	CCT	2	6	364035	364040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_010803	T	7	7	364040	364046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_010803	A	6	6	364772	364777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_010803	AAGC	2	8	364786	364793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_010803	CAGT	2	8	368316	368323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1256	NC_010803	TCCGG	2	10	414633	414642	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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