MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 9836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	CAA	2	6	26	31	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010723	TAT	2	6	47	52	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010723	TAA	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010723	AAT	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010723	GGA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010723	ATA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010723	TAA	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010723	CAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010723	CTA	3	9	1674	1682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010723	TAT	2	6	1687	1692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010723	AAT	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010723	AGG	2	6	1745	1750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010723	TTA	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010723	TAA	2	6	3120	3125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010723	TAT	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010723	AGG	2	6	4261	4266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010723	AGG	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010723	TAA	2	6	9065	9070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010723	AAT	2	6	9240	9245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010723	TAT	2	6	9257	9262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010723	TAT	2	6	9288	9293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010723	TTG	2	6	9386	9391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010723	GGC	2	6	9600	9605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010723	CTT	2	6	9637	9642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010723	GCG	2	6	9656	9661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010723	CGA	2	6	9836	9841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010723	GCA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010723	GCA	2	6	9950	9955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010723	CGC	2	6	9957	9962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010723	AGG	2	6	10026	10031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010723	CAG	2	6	10053	10058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010723	TGC	2	6	10163	10168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010723	GAA	2	6	10245	10250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010723	GCC	2	6	10389	10394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010723	AGC	2	6	10472	10477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010723	GAA	2	6	10507	10512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010723	GGT	2	6	10581	10586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010723	GTC	2	6	10595	10600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010723	GGA	2	6	10707	10712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010723	ATC	2	6	10731	10736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010723	CCT	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010723	ATG	2	6	11098	11103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010723	ACA	2	6	11234	11239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010723	ATT	2	6	11248	11253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010723	GGA	2	6	11514	11519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010723	TAG	2	6	11543	11548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010723	ACC	2	6	11751	11756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010723	TAC	2	6	11770	11775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010723	TGA	2	6	11777	11782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010723	ATG	2	6	11893	11898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010723	GGA	2	6	12066	12071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010723	AGC	2	6	12412	12417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010723	ACC	2	6	12491	12496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010723	CGT	2	6	12537	12542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010723	TAG	2	6	12604	12609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010723	TAT	2	6	12747	12752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010723	TTA	2	6	12755	12760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010723	GAG	2	6	12968	12973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010723	CGG	2	6	12987	12992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010723	CGG	2	6	13215	13220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010723	ACC	2	6	13486	13491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010723	CCT	2	6	13574	13579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010723	GGT	2	6	13710	13715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010723	TCG	2	6	13825	13830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010723	CGT	2	6	13905	13910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010723	GTT	2	6	14008	14013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010723	CCT	2	6	14081	14086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010723	TGA	2	6	14278	14283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010723	CCA	2	6	14464	14469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010723	CCA	2	6	14544	14549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010723	ATA	2	6	15149	15154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010723	TAG	2	6	17430	17435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010723	ATA	2	6	17656	17661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010723	ATA	2	6	18957	18962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010723	TAT	3	9	18994	19002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010723	ATT	3	9	19037	19045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010723	ATA	2	6	19172	19177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010723	AGA	2	6	19485	19490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010723	TAT	2	6	19517	19522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010723	TAA	2	6	19523	19528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010723	TTA	2	6	19572	19577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010723	ATA	2	6	19610	19615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010723	TAT	4	12	19624	19635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010723	TAA	2	6	19662	19667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010723	ATG	2	6	20188	20193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010723	TTA	2	6	20202	20207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010723	TAA	3	9	20217	20225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010723	AAG	2	6	20240	20245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010723	ATT	2	6	20773	20778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010723	TAC	2	6	28051	28056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010723	TGA	2	6	28057	28062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010723	CCT	2	6	29459	29464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010723	ATA	3	9	29514	29522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010723	TTA	2	6	29565	29570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010723	GGA	2	6	29598	29603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010723	ATT	2	6	31723	31728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010723	TTG	2	6	31773	31778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010723	ATA	2	6	31812	31817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010723	AAT	2	6	31830	31835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010723	ATT	2	6	31851	31856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010723	GTT	2	6	31894	31899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010723	ATA	2	6	31917	31922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010723	AAT	2	6	31941	31946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010723	TTA	2	6	32887	32892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010723	AAT	2	6	32918	32923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010723	TTA	2	6	32950	32955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010723	ATA	2	6	32968	32973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010723	ATA	2	6	33002	33007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010723	TAA	3	9	33147	33155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010723	TAA	2	6	33194	33199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010723	TTA	2	6	33237	33242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010723	TAA	2	6	33286	33291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010723	ATA	3	9	34581	34589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010723	GTA	2	6	34597	34602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010723	TAA	2	6	35595	35600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010723	TTA	2	6	35629	35634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010723	ATA	2	6	36240	36245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010723	ATT	2	6	36393	36398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010723	TAA	2	6	36511	36516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010723	AAT	2	6	38441	38446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010723	TTA	2	6	38463	38468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010723	TTC	2	6	39357	39362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010723	TTA	2	6	39392	39397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010723	TAA	2	6	39410	39415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010723	TTA	2	6	41122	41127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010723	TAT	2	6	41179	41184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010723	GAT	2	6	41203	41208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010723	ATT	2	6	41240	41245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010723	TAT	2	6	41265	41270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010723	TAT	2	6	41300	41305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010723	TAA	2	6	41321	41326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010723	ATG	2	6	41374	41379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010723	GAA	2	6	41510	41515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010723	AGT	2	6	41533	41538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010723	AGG	2	6	41562	41567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010723	TAT	2	6	42954	42959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010723	TAT	2	6	42970	42975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010723	TAT	2	6	42980	42985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010723	TAG	2	6	42993	42998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010723	TTA	2	6	43031	43036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010723	TTA	2	6	43040	43045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010723	ATT	2	6	43203	43208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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