MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010547	TATC	2	8	90	97	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010547	TTAT	2	8	98	105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010547	AGAT	2	8	1079	1086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010547	GCAA	2	8	1162	1169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010547	AATT	2	8	2841	2848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010547	TTAA	2	8	9343	9350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010547	TCTT	2	8	9662	9669	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010547	AGAA	2	8	9711	9718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010547	TCTT	2	8	9972	9979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010547	TCCC	2	8	10982	10989	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_010547	TCTT	2	8	10993	11000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010547	TAAG	2	8	12017	12024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010547	TTAA	2	8	12027	12034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010547	AGTT	2	8	12089	12096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010547	AAAT	2	8	12449	12456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010547	ATTA	2	8	13093	13100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010547	AATT	2	8	13823	13830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010547	AATC	2	8	13894	13901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010547	TTTA	2	8	21699	21706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010547	TGAA	2	8	24527	24534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010547	TTTC	2	8	28586	28593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010547	ATCT	2	8	33216	33223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010547	AGTC	2	8	36983	36990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010547	TTCT	2	8	37055	37062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010547	ATTA	2	8	38402	38409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010547	CAAT	2	8	38550	38557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010547	ACTC	2	8	46832	46839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010547	TAAA	2	8	46999	47006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010547	ACTG	2	8	48765	48772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010547	CAGA	2	8	49571	49578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010547	AATC	2	8	56037	56044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010547	CTTA	2	8	56125	56132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010547	TTAA	2	8	57715	57722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010547	AGAT	2	8	65242	65249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010547	CTTT	2	8	66730	66737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010547	GATT	2	8	66828	66835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010547	TAAA	2	8	67600	67607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010547	AAAT	2	8	67771	67778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010547	CAAA	2	8	68229	68236	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010547	AATT	2	8	76146	76153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010547	ATTC	2	8	83478	83485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010547	TAAT	2	8	93116	93123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010547	ATTT	2	8	109753	109760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010547	ATTA	2	8	111991	111998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010547	TATC	2	8	113185	113192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010547	CTGG	2	8	115005	115012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010547	CTAT	2	8	115273	115280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010547	TAAA	2	8	115848	115855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010547	AGTG	2	8	115962	115969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010547	TCAG	2	8	116260	116267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010547	TAAA	2	8	116310	116317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010547	TAAA	2	8	116692	116699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010547	AGTA	2	8	116767	116774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010547	TCTG	2	8	117075	117082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010547	TAAA	2	8	117125	117132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010547	TCAA	2	8	118053	118060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010547	CGGT	2	8	118602	118609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010547	TTTA	2	8	120207	120214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010547	TACA	2	8	127577	127584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010547	TGTT	2	8	130661	130668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010547	ACAA	2	8	134045	134052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010547	AAGT	2	8	134363	134370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010547	CTGT	2	8	136504	136511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010547	ATTA	2	8	137644	137651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010547	GATA	2	8	143595	143602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010547	AAAT	2	8	149909	149916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010547	TTCT	2	8	152122	152129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010547	GTCT	2	8	152134	152141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010547	ACTT	2	8	153777	153784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010547	ACTT	2	8	158942	158949	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010547	ATTG	2	8	159064	159071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010547	TAAA	2	8	164570	164577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010547	GACG	2	8	165915	165922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010547	ATCT	2	8	166524	166531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010547	AAAG	2	8	171430	171437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010547	TTTG	2	8	174253	174260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010547	TGGT	2	8	175022	175029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010547	GGTT	2	8	175612	175619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010547	CTTA	2	8	177648	177655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010547	AAAT	2	8	180172	180179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010547	AAGG	2	8	181894	181901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010547	TAAA	2	8	187814	187821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010547	AATA	2	8	190876	190883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010547	GTGA	2	8	190885	190892	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010547	CATC	2	8	190975	190982	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010547	GAAA	2	8	191125	191132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010547	GGGT	2	8	191328	191335	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010547	CCTA	2	8	191400	191407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010547	TAGA	2	8	193470	193477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010547	GAAA	2	8	194459	194466	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010547	TGAG	2	8	195183	195190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010547	CTTT	2	8	195384	195391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010547	AACC	2	8	197781	197788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010547	CACT	2	8	199641	199648	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010547	AGCA	2	8	199708	199715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010547	ACCA	2	8	204433	204440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010547	AGCA	2	8	206898	206905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010547	GAAA	2	8	236589	236596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010547	AGTT	2	8	238467	238474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010547	ATAA	2	8	247706	247713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010547	AATT	3	12	250445	250456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010547	TTAA	2	8	252126	252133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010547	TAAT	2	8	260106	260113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010547	TGTC	3	12	260916	260927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010547	TGAG	2	8	260929	260936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010547	TTCT	2	8	267929	267936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010547	TAAA	2	8	267954	267961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010547	GATA	2	8	285097	285104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010547	GTAT	2	8	285107	285114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010547	TAAG	2	8	285200	285207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010547	ATAA	2	8	286526	286533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010547	GTTT	2	8	286836	286843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010547	TGAA	2	8	287307	287314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010547	TAGT	2	8	287771	287778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010547	ATTA	2	8	287789	287796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010547	TGGT	2	8	287884	287891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010547	TCCT	2	8	288162	288169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010547	TTAT	2	8	288672	288679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010547	ATTT	2	8	290062	290069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010547	TTAT	2	8	290112	290119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010547	AAAT	2	8	290903	290910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010547	CTAA	2	8	291255	291262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010547	ATTT	2	8	291305	291312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010547	ATTA	2	8	292551	292558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010547	ATTA	2	8	297236	297243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010547	TTTC	2	8	300907	300914	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010547	ATTA	2	8	303070	303077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010547	CTTG	2	8	303081	303088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010547	TAAA	2	8	306407	306414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010547	TAAT	2	8	308468	308475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010547	TAGT	2	8	310004	310011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010547	ACTA	2	8	310038	310045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010547	GTTT	2	8	311225	311232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010547	TTTA	2	8	311410	311417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010547	CTTT	2	8	311419	311426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010547	TAAG	2	8	311467	311474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010547	TTCG	2	8	311506	311513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010547	ATCT	2	8	313185	313192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010547	TCAT	2	8	322961	322968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010547	AAAC	2	8	323003	323010	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010547	TGAA	2	8	331571	331578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010547	AAGT	2	8	331782	331789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010547	TTGA	2	8	341070	341077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010547	AATT	2	8	344198	344205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010547	AATT	2	8	349412	349419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010547	ATTA	2	8	352153	352160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010547	GATT	2	8	352163	352170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010547	AATC	2	8	352245	352252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010547	TTTA	2	8	354504	354511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010547	ATAA	3	12	354627	354638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010547	AAAT	2	8	360236	360243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010547	ACGG	2	8	360409	360416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_010547	TTGG	2	8	369937	369944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010547	TTTC	2	8	372890	372897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_010547	TTAA	2	8	372971	372978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010547	AGAA	2	8	373261	373268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010547	TAGT	2	8	373753	373760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010547	AATC	2	8	374713	374720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_010547	TCAG	2	8	375378	375385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_010547	TTAA	2	8	375768	375775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010547	TTAA	2	8	382152	382159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010547	GAAA	2	8	383804	383811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010547	TTTA	2	8	383888	383895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010547	TAAA	2	8	388778	388785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010547	TTTA	2	8	388809	388816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010547	ATTG	2	8	390220	390227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010547	ATCA	2	8	392717	392724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_010547	TAAA	2	8	395894	395901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010547	AAGA	2	8	396924	396931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010547	TATC	2	8	405982	405989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_010547	TCAA	2	8	406026	406033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_010547	ATAA	2	8	406958	406965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010547	TGAG	2	8	407281	407288	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010547	TTAA	2	8	407686	407693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010547	AATT	2	8	410213	410220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_010547	TAAT	2	8	418526	418533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010547	AAAC	2	8	418792	418799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
178	NC_010547	TGAA	2	8	424494	424501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_010547	CTGG	2	8	428088	428095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
180	NC_010547	TATT	2	8	429626	429633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_010547	GATA	2	8	429663	429670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.