MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010546	TTTAGA	2	12	79592	79603	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010546	TTTTGG	2	12	93994	94005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010546	TAAAAG	2	12	94365	94376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010546	AATCTC	2	12	135688	135699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010546	AATTAC	2	12	190910	190921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010546	TCCCCA	2	12	199427	199438	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010546	ATTAAT	2	12	206401	206412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010546	AAAGTA	2	12	207939	207950	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010546	AAATAA	2	12	218748	218759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010546	TTGTAA	2	12	238183	238194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010546	TGTAGC	2	12	252251	252262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010546	AAAGAG	2	12	254319	254330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010546	TCCAAT	2	12	275600	275611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010546	TATCCT	2	12	276764	276775	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010546	AATTAA	2	12	290099	290110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010546	AGCTTT	2	12	359552	359563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010546	TTTACG	2	12	389797	389808	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010546	TTAATC	2	12	419968	419979	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010546	CTCTAG	2	12	444854	444865	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010546	TAACGA	2	12	447338	447349	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010546	TAAAAT	2	12	482762	482773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010546	GACCCT	2	12	546765	546776	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010546	CTCACC	2	12	560966	560977	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010546	CTCTCC	2	12	568490	568501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010546	TATAAG	2	12	615193	615204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010546	AAAAAC	2	12	625890	625901	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010546	TTCTGA	2	12	650018	650029	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010546	TTTTTC	2	12	650222	650233	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010546	TAAATT	2	12	667141	667152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010546	ATAAAA	2	12	676933	676944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010546	AATCTT	2	12	722605	722616	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010546	TCTTAT	2	12	736487	736498	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010546	CAAAAT	2	12	738988	738999	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010546	ATAGGT	2	12	739590	739601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010546	TTACTT	2	12	739736	739747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010546	TACTTT	2	12	739748	739759	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010546	AAAAGA	2	12	740191	740202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010546	AGGGAA	2	12	749606	749617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010546	ACTCTT	2	12	771564	771575	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010546	AATTGA	2	12	776552	776563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010546	ATCACT	2	12	782327	782338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010546	AAATAC	2	12	783112	783123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010546	TGAGAT	2	12	842811	842822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010546	ACTTTC	2	12	859322	859333	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010546	TTAATT	2	12	859338	859349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010546	AGTCAT	2	12	866059	866070	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010546	AAAAGA	2	12	921527	921538	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010546	AATCTT	2	12	928593	928604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010546	GCCAAG	2	12	931377	931388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010546	TTCTAT	2	12	941895	941906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010546	AAATAA	2	12	958645	958656	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010546	TATTAG	2	12	978948	978959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010546	AAATAA	2	12	997001	997012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010546	TTAAGA	2	12	1033200	1033211	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010546	ACAAAA	2	12	1045519	1045530	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010546	TTGATT	2	12	1055750	1055761	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010546	ACTATT	2	12	1060030	1060041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010546	AAGAAT	2	12	1060163	1060174	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010546	TTAATA	2	12	1103312	1103323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010546	ATTTTA	2	12	1107068	1107079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010546	TTAATA	2	12	1150627	1150638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010546	TCTATC	2	12	1151812	1151823	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010546	GATTCT	2	12	1181327	1181338	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010546	TCTATT	2	12	1193467	1193478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010546	TCATTT	2	12	1222027	1222038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010546	TAATAT	2	12	1240753	1240764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010546	ATCTTA	2	12	1253939	1253950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010546	TGGCCG	2	12	1266523	1266534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010546	CTTAAA	2	12	1290935	1290946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010546	TTCTAA	2	12	1303059	1303070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010546	TATTAA	2	12	1304377	1304388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010546	TATTTT	2	12	1310745	1310756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010546	CAAAAA	2	12	1314065	1314076	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010546	TCTTAA	2	12	1326558	1326569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010546	TATACT	2	12	1347560	1347571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010546	TAAAAA	2	12	1374040	1374051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010546	TCAATC	2	12	1377869	1377880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010546	AGGATG	2	12	1444126	1444137	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010546	ATGATA	2	12	1496737	1496748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010546	ATAAGA	2	12	1557324	1557335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010546	TTTTAT	2	12	1597865	1597876	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010546	TAAAAT	2	12	1603996	1604007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010546	GTTTAG	2	12	1622584	1622595	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010546	ATTTTT	2	12	1675252	1675263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010546	ATAATG	2	12	1682092	1682103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010546	GTGCTA	2	12	1691627	1691638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010546	TATATT	2	12	1694992	1695003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010546	ACAAAC	2	12	1720013	1720024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010546	ATATTT	2	12	1723392	1723403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010546	CTAAAA	2	12	1758501	1758512	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010546	GATAAC	2	12	1762915	1762926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010546	AACTAA	2	12	1809621	1809632	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010546	TTTTAA	2	12	1826287	1826298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010546	TCCACT	2	12	1826911	1826922	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010546	TTCAAT	2	12	1864857	1864868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010546	ATAAAG	2	12	1869496	1869507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010546	AAGAAA	2	12	1879167	1879178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010546	AAATAG	2	12	1879200	1879211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010546	TTTACT	2	12	1942289	1942300	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010546	AAATAA	2	12	1963724	1963735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010546	GTTTAA	2	12	1965166	1965177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010546	AATTCA	2	12	1983811	1983822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010546	CTATAA	2	12	1991544	1991555	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010546	AATTGA	2	12	2006451	2006462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010546	AAAAAC	2	12	2038316	2038327	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010546	AATCAA	2	12	2048466	2048477	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010546	AAATAC	2	12	2084996	2085007	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010546	TTCCTT	2	12	2110935	2110946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010546	AAAATC	2	12	2143031	2143042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010546	TGCTAT	2	12	2164461	2164472	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010546	AATCTT	2	12	2181575	2181586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010546	AATCTT	2	12	2193506	2193517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010546	ACAAAT	2	12	2215929	2215940	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010546	ATTAAT	2	12	2244288	2244299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010546	TTTTTA	2	12	2275152	2275163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010546	CCCTAA	2	12	2375754	2375765	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010546	GTCATC	2	12	2449211	2449222	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010546	TTGATT	2	12	2451534	2451545	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010546	TTTAAA	2	12	2474762	2474773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010546	AGGACA	2	12	2486432	2486443	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010546	CTTAGA	2	12	2505856	2505867	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010546	TAATTT	2	12	2505891	2505902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010546	ATCAAT	2	12	2509435	2509446	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010546	TATCTA	2	12	2518090	2518101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010546	TAAAAA	2	12	2530166	2530177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010546	TAAGAT	2	12	2549070	2549081	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010546	TTTTGA	2	12	2589159	2589170	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010546	TCTTGC	2	12	2638979	2638990	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010546	TTGGTT	2	12	2639883	2639894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010546	ATTAGA	2	12	2671046	2671057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010546	AGGTTA	2	12	2671103	2671114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010546	TTCCCG	2	12	2684535	2684546	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010546	GTTTTG	2	12	2698322	2698333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010546	GATTGA	2	12	2698386	2698397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_010546	AATGCT	2	12	2744630	2744641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_010546	TTTTTA	2	12	2748344	2748355	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_010546	ATTAAT	2	12	2770669	2770680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010546	TTTTAA	2	12	2802343	2802354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_010546	TATAAT	2	12	3328533	3328544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010546	ATTTAT	2	12	3332154	3332165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.