MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 14909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010546	A	6	6	1261719	1261724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010546	ATC	2	6	1261768	1261773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_010546	TTG	2	6	1261785	1261790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_010546	AGT	2	6	1261822	1261827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_010546	AAGA	2	8	1261830	1261837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_010546	TAAA	3	12	1262167	1262178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010546	TAA	2	6	1262180	1262185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_010546	A	7	7	1262280	1262286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_010546	ATT	2	6	1262294	1262299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_010546	T	8	8	1262339	1262346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_010546	A	8	8	1262347	1262354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_010546	A	6	6	1262823	1262828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_010546	TAAG	2	8	1262831	1262838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_010546	ATA	2	6	1262876	1262881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_010546	TAA	2	6	1262892	1262897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_010546	ATC	2	6	1262901	1262906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_010546	A	6	6	1262943	1262948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_010546	T	6	6	1262964	1262969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_010546	ATTT	2	8	1265297	1265304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_010546	ATGA	2	8	1265365	1265372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_010546	AAT	2	6	1265377	1265382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_010546	TTA	2	6	1265871	1265876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_010546	TAA	2	6	1265887	1265892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010546	TGGCCG	2	12	1266523	1266534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_010546	GTT	2	6	1266562	1266567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_010546	AGGA	2	8	1266575	1266582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_010546	AAAC	2	8	1266614	1266621	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_010546	GAT	2	6	1266651	1266656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_010546	ACT	2	6	1266670	1266675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_010546	ATAA	2	8	1266676	1266683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_010546	A	6	6	1268043	1268048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_010546	TTC	3	9	1268055	1268063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_010546	CTT	2	6	1268143	1268148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_010546	CTC	2	6	1268149	1268154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_010546	TTC	2	6	1268357	1268362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_010546	TTC	2	6	1268390	1268395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_010546	ATT	2	6	1269487	1269492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_010546	TTTA	2	8	1270231	1270238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_010546	TTATA	2	10	1270251	1270260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_010546	AAT	2	6	1270261	1270266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_010546	TGA	2	6	1272292	1272297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_010546	TCAA	2	8	1272351	1272358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_010546	TAAA	2	8	1272377	1272384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_010546	ATC	2	6	1272392	1272397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_010546	AT	3	6	1272400	1272405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_010546	AT	3	6	1272408	1272413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_010546	CAA	2	6	1272444	1272449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_010546	A	6	6	1272477	1272482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_010546	TTA	2	6	1272483	1272488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010546	ATT	2	6	1272507	1272512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_010546	TAA	2	6	1272518	1272523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_010546	ACTA	2	8	1272608	1272615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_010546	TCT	2	6	1272702	1272707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_010546	T	7	7	1272816	1272822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_010546	CTT	2	6	1272837	1272842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_010546	TAG	2	6	1272857	1272862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_010546	GTA	2	6	1273702	1273707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_010546	G	6	6	1274379	1274384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_010546	GGA	2	6	1274398	1274403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_010546	TA	3	6	1274435	1274440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_010546	AAT	2	6	1274455	1274460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_010546	T	6	6	1274480	1274485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_010546	TCA	2	6	1274563	1274568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_010546	TATAA	2	10	1274601	1274610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_010546	TAA	2	6	1274636	1274641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_010546	GTTA	2	8	1274671	1274678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_010546	A	6	6	1274737	1274742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_010546	AGA	2	6	1274746	1274751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_010546	AATC	2	8	1274771	1274778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_010546	TAAA	2	8	1274781	1274788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_010546	T	7	7	1274791	1274797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_010546	AGT	3	9	1274798	1274806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_010546	TGA	2	6	1274884	1274889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_010546	A	7	7	1275962	1275968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_010546	T	6	6	1275987	1275992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_010546	CTAAC	2	10	1276002	1276011	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4077	NC_010546	CTT	2	6	1277951	1277956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_010546	CCA	2	6	1278684	1278689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_010546	ACT	2	6	1278698	1278703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_010546	GATA	2	8	1278709	1278716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_010546	T	6	6	1280399	1280404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_010546	TCA	2	6	1280450	1280455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_010546	CTC	2	6	1280498	1280503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_010546	ATT	2	6	1280529	1280534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_010546	CTAG	2	8	1280571	1280578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_010546	AGG	2	6	1280744	1280749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_010546	TAA	2	6	1280752	1280757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_010546	TAAT	2	8	1280759	1280766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_010546	TTAGA	2	10	1281674	1281683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_010546	CTT	2	6	1281707	1281712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_010546	TTA	2	6	1281806	1281811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_010546	A	6	6	1281845	1281850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_010546	GAG	2	6	1281866	1281871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_010546	A	7	7	1281908	1281914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_010546	TCAG	2	8	1281973	1281980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_010546	TTA	2	6	1282327	1282332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_010546	T	6	6	1282365	1282370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_010546	ATTA	2	8	1282377	1282384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_010546	ATC	2	6	1282404	1282409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_010546	GTTT	2	8	1283474	1283481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_010546	TTAA	2	8	1283530	1283537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_010546	CTG	2	6	1283569	1283574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_010546	TAA	2	6	1283583	1283588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010546	TAA	2	6	1283599	1283604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_010546	CAT	2	6	1283635	1283640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_010546	AGTG	2	8	1283661	1283668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_010546	GGA	2	6	1283680	1283685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_010546	AG	3	6	1283700	1283705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_010546	ATG	2	6	1285523	1285528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_010546	ACC	2	6	1287893	1287898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_010546	AAC	2	6	1287927	1287932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_010546	A	7	7	1287934	1287940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_010546	TG	3	6	1288745	1288750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_010546	ATTTT	2	10	1288798	1288807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_010546	AAC	2	6	1289863	1289868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_010546	TA	3	6	1290787	1290792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_010546	ATAA	2	8	1290809	1290816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_010546	AAAAT	2	10	1290860	1290869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_010546	TGA	2	6	1290929	1290934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_010546	CTTAAA	2	12	1290935	1290946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4121	NC_010546	ATT	3	9	1290953	1290961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_010546	TAA	4	12	1290991	1291002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_010546	ATG	2	6	1291022	1291027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_010546	TTC	2	6	1291568	1291573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_010546	TGC	2	6	1291586	1291591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_010546	TCA	2	6	1291681	1291686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_010546	TTACT	2	10	1292652	1292661	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4128	NC_010546	AGT	2	6	1292682	1292687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_010546	CA	3	6	1292688	1292693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_010546	TGA	2	6	1294543	1294548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_010546	T	6	6	1294669	1294674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_010546	TTA	2	6	1294707	1294712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_010546	TGA	2	6	1294756	1294761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_010546	ATA	2	6	1294770	1294775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_010546	T	7	7	1294792	1294798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_010546	TATC	2	8	1294841	1294848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4155	NC_010546	T	6	6	1298977	1298982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_010546	TCTA	2	8	1299037	1299044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4253	NC_010546	AATTT	2	10	1321746	1321755	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_010546	T	6	6	1322063	1322068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_010546	TAT	3	9	1322802	1322810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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