MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 14909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010546	ATGT	2	8	315121	315128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010546	GCT	2	6	315137	315142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010546	TGG	2	6	315223	315228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010546	ACGC	2	8	315240	315247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_010546	ATT	2	6	315297	315302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010546	TCAA	2	8	315312	315319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_010546	GCT	2	6	315465	315470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010546	TCT	2	6	315535	315540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_010546	ATT	2	6	315575	315580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010546	A	6	6	315650	315655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010546	TAAA	2	8	315659	315666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010546	AG	3	6	315672	315677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010546	T	7	7	315693	315699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010546	AAT	2	6	315707	315712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010546	TTG	2	6	315727	315732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010546	CAAA	2	8	315742	315749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_010546	AG	3	6	315757	315762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010546	TTAA	2	8	315763	315770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010546	CT	3	6	315776	315781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_010546	AGA	2	6	317589	317594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010546	GAT	2	6	317604	317609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010546	TTA	2	6	318632	318637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010546	CAC	2	6	318656	318661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_010546	TCT	2	6	318729	318734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_010546	ATA	2	6	318780	318785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010546	ATG	2	6	318813	318818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010546	T	6	6	318978	318983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010546	TTC	2	6	325088	325093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_010546	TTAA	2	8	325149	325156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010546	ATG	2	6	325167	325172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010546	ATCAA	2	10	325221	325230	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_010546	A	6	6	325236	325241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010546	ATTAA	2	10	326278	326287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010546	ACA	2	6	326305	326310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010546	AATA	2	8	326333	326340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010546	T	6	6	328844	328849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010546	ATT	2	6	328884	328889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010546	CTAAA	2	10	328974	328983	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_010546	CAG	2	6	330844	330849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1041	NC_010546	AAG	2	6	330907	330912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010546	A	7	7	330936	330942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010546	ACG	2	6	330963	330968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010546	TTA	2	6	332007	332012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010546	ATT	2	6	332022	332027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010546	AGG	2	6	332052	332057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010546	ATTA	2	8	332091	332098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010546	GT	3	6	332140	332145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010546	A	6	6	333434	333439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010546	CAA	2	6	333453	333458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_010546	A	6	6	334955	334960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010546	AGT	2	6	334969	334974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010546	GTG	2	6	334988	334993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010546	ATT	2	6	336266	336271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010546	CAT	2	6	340067	340072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010546	TAT	2	6	341506	341511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010546	A	6	6	341541	341546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010546	CT	3	6	341596	341601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_010546	ATT	2	6	341606	341611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010546	AAC	2	6	341619	341624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010546	TAC	2	6	341649	341654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010546	T	6	6	341655	341660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010546	AT	3	6	341707	341712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010546	ATA	3	9	341780	341788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010546	TCA	2	6	341823	341828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010546	T	6	6	341897	341902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010546	TAA	2	6	341914	341919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010546	ATC	2	6	341930	341935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_010546	ACT	2	6	341967	341972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_010546	GA	3	6	343657	343662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010546	CAT	2	6	343672	343677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_010546	AAT	2	6	343691	343696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010546	TTC	2	6	343714	343719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010546	ATCA	2	8	343735	343742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_010546	CTTA	2	8	343977	343984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_010546	T	8	8	344455	344462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010546	A	7	7	344569	344575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010546	ATT	2	6	344600	344605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010546	AT	3	6	344608	344613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010546	TTTTG	2	10	344959	344968	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010546	TTA	2	6	344985	344990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010546	AG	3	6	344993	344998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010546	AGG	2	6	345024	345029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010546	AG	3	6	345070	345075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010546	A	6	6	345155	345160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010546	ATTG	2	8	345705	345712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010546	TA	4	8	348400	348407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010546	A	7	7	348424	348430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010546	ACTA	2	8	348472	348479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_010546	AAC	2	6	348487	348492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010546	GTAGG	2	10	356096	356105	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010546	AAG	2	6	356108	356113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010546	TC	3	6	356168	356173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_010546	ATT	2	6	356174	356179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010546	AAT	2	6	356181	356186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010546	TAT	2	6	358004	358009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010546	TAACT	2	10	359315	359324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_010546	TAT	2	6	359400	359405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010546	T	7	7	359441	359447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010546	GTGG	2	8	359512	359519	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010546	TAAAA	2	10	359528	359537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010546	A	6	6	359534	359539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010546	AGCTTT	2	12	359552	359563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1104	NC_010546	ATG	2	6	359565	359570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010546	AC	3	6	359641	359646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_010546	TGG	2	6	359657	359662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010546	T	6	6	359780	359785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010546	TAG	2	6	359793	359798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010546	ACTG	2	8	359803	359810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_010546	ATC	2	6	359914	359919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_010546	TAC	2	6	359921	359926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010546	CAA	2	6	359930	359935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_010546	CCAGG	2	10	359962	359971	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_010546	CGA	2	6	359990	359995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_010546	TCC	2	6	360045	360050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_010546	G	6	6	360084	360089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010546	G	6	6	360092	360097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010546	TAA	2	6	361456	361461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010546	ATTT	2	8	361858	361865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010546	ATT	2	6	361869	361874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010546	T	6	6	361873	361878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010546	TAA	2	6	361887	361892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010546	TAA	2	6	361909	361914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010546	AAAT	2	8	361918	361925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010546	A	6	6	362158	362163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010546	TAAAA	2	10	362180	362189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010546	A	6	6	365246	365251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010546	ATT	2	6	365332	365337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010546	TAT	2	6	365526	365531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010546	ATG	2	6	365547	365552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010546	A	6	6	365570	365575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010546	ATA	2	6	366063	366068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010546	TAT	2	6	366450	366455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010546	ATTT	2	8	366467	366474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010546	TTA	2	6	366477	366482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_010546	AAT	2	6	366874	366879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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